陆川猪脂酰辅酶A氧化酶1基因克隆及序列分析

发布时间：2018-04-08 09:28

  本文选题：陆川猪　切入点：ACOX基因　出处：《中国畜牧兽医》2017年03期

【摘要】：本研究旨在对陆川猪脂酰辅酶A氧化酶1(acyl-coenzyme A oxidase 1,ACOX1)基因进行克隆及生物信息学分析。根据GenBank中猪ACOX1基因序列设计特异性引物,利用RT-PCR技术对陆川猪ACOX1基因进行克隆、测序和生物信息学分析。结果表明,陆川猪ACOX1基因CDS全长1 986bp,编码661个氨基酸,陆川猪ACOX1基因与猪、牛、人、斑马鱼、鸡、猕猴、大鼠、小鼠、爪蟾序列同源性分别为99.5%、85.5%、87.1%、66.3%、75.6%、84.0%、82.3%、81.1%和69.1%。系统进化树分析结果表明,ACOX1基因在不同物种及进化的过程中具有高度保守性,蛋白质二级结构预测结果表明,陆川猪ACOX1蛋白没有信号肽,没有形成跨膜结构。本研究成功克隆了陆川猪ACOX1基因,为阐明其在陆川猪脂肪沉积及代谢方面的调控研究奠定了理论基础。
[Abstract]:The aim of this study was to clone and bioinformatics analysis of 1(acyl-coenzyme A oxidase 1 oxidase 1 ACOX1 gene of Luchuan porcine lipoacylcoenzyme oxidase.According to the sequence of porcine ACOX1 gene in GenBank, specific primers were designed, and the ACOX1 gene of Luchuan pig was cloned, sequenced and bioinformatics analyzed by RT-PCR technique.Phylogenetic tree analysis showed that the COX1 gene was highly conserved in different species and evolution. The prediction of protein secondary structure showed that the ACOX1 protein of Luchuan pig had no signal peptide and no transmembrane structure.In this study, the ACOX1 gene of Luchuan pig was cloned successfully, which laid a theoretical foundation for the regulation of fat deposition and metabolism in Luchuan pig.
【作者单位】： 广西壮族自治区畜牧研究所广西家畜遗传改良重点实验室;广西大学动物科学技术学院;
【基金】：国家自然科学基金(31360544) 广西壮族自治区畜牧研究所基本科研业务费项目(桂牧研科2015-03) 广西家畜遗传改良重点实验室自主研究课题(2015GXKLLGI-06)
【分类号】：S828

【参考文献】

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【共引文献】

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【二级参考文献】

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本文编号：1721010