NCOA1基因mRNA表达及多态性与黔北麻羊产羔性状关联性分析

发布时间：2024-11-03 00:12

　　 为了研究核受体辅激活蛋白1(NCOA1)对黔北麻羊繁殖性能的影响,试验采用DNA测序技术,利用SeqMan软件分析测序结果初步筛选SNP位点,根据筛选出的SNP位点应用RNA在线二级结构预测软件中的RNA secondary structure prediction、ProtScale、DNAStar软件中的EditSeq分析NCOA1基因突变位点的二级结构、理化性质、亲疏水性、结构域,运用SPSS 20.0软件分析NCOA1基因型与产羔数的关联性;再应用实时荧光定量PCR方法检测NCOA1基因在黔北麻羊子宫、输卵管、垂体、下丘脑、卵巢5个器官中mRNA的表达水平。结果表明:在外显子7处发现2个SNP位点,命名为G144A和G155A,其中G144A属于同义突变,编码的氨基酸未发生改变,G155A属于错义突变,编码的精氨酸突变为赖氨酸,导致外显子7所编码的氨基酸自由能升高,稳定性降低,分子质量变大,等电点升高,疏水性增强,但未发现保守结构域和特殊结构域,即NCOA1基因外显子7编码的蛋白无特异结构和独立功能;对G155A位点进行基因分型,发现GG基因型个体产羔数分别比GA、AA基因型个...

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【文章目录】：
1 材料
    1.1 样品
    1.2 主要试剂
    1.3 主要仪器
2 方法
    2.1 引物的设计与合成
    2.2 DNA池PCR扩增及SNP位点分析
    2.3 实时荧光定量PCR扩增
3 结果与分析
    3.1 NCOA1基因的多态性分析
        3.1.1 PCR扩增
        3.1.2 SNP位点的检测
        3.1.3 突变位点二级结构分析
        3.1.4 理化性质分析
        3.1.5 氨基酸亲疏水性分析
        3.1.6 基因分型与产羔数关联性分析
    3.2 实时荧光定量PCR扩增
        3.2.1 扩增曲线和熔解曲线
        3.2.2 NCOA1基因mRNA在黔北麻羊不同器官中的表达分析
4 讨论
    4.1 NCOA1基因SNP位点分析
    4.2 NCOA1基因mRNA在黔北麻羊不同器官中的表达规律
5 结论



本文编号：4010375