基于酶切的简化基因组测序在绵羊品种进化关系研究中的应用

发布时间：2018-04-14 02:02

  本文选题：绵羊 + 基于酶切的简化基因组测序　； 参考：《畜牧与兽医》2017年09期

【摘要】：以基于酶切的简化基因组测序技术对3个绵羊品种(滩羊(TY)、蒙古羊(MGY)、湖羊(HY))进行测定,通过序列比较发现品种间存在SNP,在分析品种群体遗传参数的基础上,建立系统发生树。结果表明,滩羊的SNP位点平均数为24 008个,湖羊SNP位点平均数为23906个,蒙古羊SNP位点平均数为23 306个。系统发生树分析表明,3个绵羊群体未能明确分类。基于个体间的SNP差异程度,利用PCA分类成2个亚群,蒙古羊和湖羊聚为一类,滩羊单独为一类。通过样本的群体结构,推翻了3个绵羊群体来自于同一祖先的说法。品种之间存在大量的SNP,该研究为地方绵羊识别和进化提供依据。
[Abstract]:Three sheep breeds (TYT, MGYA, HYY) were determined by the simplified genomic sequencing technique based on enzyme digestion. SNPs were found among the breeds by sequence comparison. Phylogenetic tree was established on the basis of analyzing the genetic parameters of the breeds.The results showed that the average number of SNP loci was 24 008 in Tan sheep, 23 906 in Hu sheep and 23 306 in Mongolian sheep.Phylogenetic tree analysis showed that three sheep populations could not be classified clearly.Based on the degree of SNP difference among individuals, two subgroups were classified by PCA. Mongolian sheep and Hu sheep were clustered into one group, and Tan sheep were classified into two groups.The three sheep populations from the same ancestor were overturned by the population structure of the sample.A large number of SNPs exist among breeds, and this study provides evidence for the identification and evolution of local sheep.
【作者单位】： 宁夏农林科学院动物科学研究所;
【基金】：宁夏自治区农业育种专项(2013NYYZ0404) 宁夏自然科学基金(NZ16099)
【分类号】：S826

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本文编号：1747197