禽内源性反转录病毒ALVE1在鸡基因组上下游序列鉴定

发布时间：2018-05-05 21:16

本文选题：禽内源性反转录病毒 + ALVE　；参考：《中国动物传染病学报》2017年06期

【摘要】：已知鸡基因组中含有禽内源性反转录病毒ALVE1序列,而ALVE1在鸡基因组中的上游和下游区域位置在参考基因组中并未成功鉴定。本研究成功鉴定出ALVE1所在鸡基因组中的上、下游序列,并通过提取CEF细胞和DF-1细胞基因组反过来验证了ALVE1的位置信息。与参考基因组不同的是,我们发现ALVE1序列包含3'LTR序列,在鸡1号染色体上的插入位置为chr1:65,995,534~65,993,540。本研究不仅提供了ALVE1在鸡基因组中的完整信息,也为进一步研究ALVE1的功能奠定了基础。
[Abstract]:Avian endogenous retrovirus ALVE1 sequences are known to exist in chicken genomes, but the upstream and downstream regions of ALVE1 in chicken genomes have not been successfully identified in reference genomes. In this study, the upstream and downstream sequences of the chicken genome in which ALVE1 is located were successfully identified, and the location information of ALVE1 was verified by extracting the genome of CEF cells and DF-1 cells. Different from the reference genome, we found that the ALVE1 sequence contains the 3'LTR sequence, and the insertion position on chicken chromosome 1 is chr1: 65995534 / 65993540. This study not only provided complete information of ALVE1 in chicken genome, but also laid a foundation for further study on the function of ALVE1.
【作者单位】：扬州大学表观遗传学及表观基因组学研究所;扬州大学动物科学和技术学院;
【基金】：国家自然科学基金重大研究计划(91540117);国家自然科学基金面上项目(81372237);国家自然科学基金青年基金项目(31602032) 江苏省畜牧学优势学科项目江苏省高等学校大学生创新创业训练计划项目(201611117037Z)
【分类号】：S852.65

【相似文献】