一株金黄色葡萄球菌小菌落突变株全基因组测序分析

发布时间：2018-05-11 17:11

  本文选题：金葡菌小菌落突变株 + 基因序列差异　； 参考：《动物医学进展》2017年05期

【摘要】：对金黄色葡萄球菌小菌落突变株(small colony mutant strains Staphylococcus aureus,SASCVs)和CP000253.1基因组差异进行了研究,为后续研究金葡菌分泌抗药物相关物质能力提供数据支持。对一株金葡菌小菌落突变株进行全基因组测序,并与CP000253.1参考序列进行序列比较。结果显示,金葡菌SCVs的文库插入片段为350bp,测序读长为150bp,SCVs的原始数据量为551 Mb,SCVs的碱基含量分布在处理前后有所不同,通过重测序,存在单核苷酸多态性(SNP)的数量较大。金葡菌SCVs与CP000253.1参考序列之间存在明显的序列差异,该数据为研究金葡菌感染奶牛乳房炎提供了一定的序列依据。
[Abstract]:The genomic differences between small colony mutant strains Staphylococcus aureus, SASCVs and CP000253.1 were studied in order to provide data support for the subsequent study of the ability of Staphylococcus aureus to secrete anti drug related substances. The results showed that the inserted fragment of Staphylococcus aureus SCVs was 350bp, the sequence reading length was 150bp, the original data of SCVs was 551 Mb, the base content distribution of SCVs was different before and after treatment. By re sequencing, the number of single nucleotide polymorphisms (SNP) was larger. Staphylococcus aureus SCVs and CP000253.1 reference sequence There was obvious sequence difference between the two data, which provided a series of evidence for studying Staphylococcus aureus infection in dairy cow mastitis.

【作者单位】： 云南农业大学动物科学技术学院;
【基金】：国家自然科学基金项目(31260629)
【分类号】：S852.611

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本文编号：1874833