广州地区猫泛白细胞减少症病毒分离鉴定及全基因组遗传分析
本文选题：猫泛白细胞减少症病毒 + 细小病毒 ； 参考：《华南农业大学学报》2017年01期
【摘要】：【目的】分析广州地区猫泛白细胞减少症病毒(Feline panleukopenia virus,FPLV)的自然重组、跨宿主传播以及流行变异情况。【方法】采集疑似感染猫泛白细胞减少症病毒的猫粪便样品进行细胞分离,并对阳性病料提取基因组DNA,PCR扩增获得病毒的全基因组序列,并与Gen Bank中相关的参考毒株序列进行遗传进化分析,同时对VP2基因与NS1基因的主要氨基酸位点进行差异分析。【结果】成功获得2株猫泛白细胞减少症病毒及其全基因组序列。遗传进化分析显示,广州地区分离的猫泛白细胞减少症病毒FPLV-GZ01、FPLV-GZ02与我国其他分离毒株FPLV-XJ01、FPLV-HRB属同一分支,提示FPLV-GZ01、FPLV-GZ02由FPLV-XJ1进化而来;NS1基因系统进化树显示,FPLV存在与CPV-447重组的可能。主要氨基酸位点分析显示,FPLV在VP2基因中的主要氨基酸位点上的遗传变异比CPV保守;在NS1基因上发现FPLV-GZ01、FPLV-GZ02分别存在不同程度的氨基酸位点突变。【结论】广州地区分离的猫泛白细胞减少症病毒仍在不断地重组进化。
[Abstract]:[objective] to analyze the natural recombination, cross-host transmission and epidemic variation of feline panleukopenia virus (Feline panleukopenia virus) in Guangzhou. [methods] Cat fecal samples suspected to be infected with cat panleukopenia virus were collected for cell isolation. The whole genome sequence of the virus was amplified by PCR from the genomic DNA-DNA extracted from the positive venereal disease material, and the genetic evolution analysis of the reference strain sequence related to Gen Bank was carried out. At the same time, the main amino acid sites of VP2 gene and NS1 gene were analyzed. [results] two strains of cat panleukopenia virus and its whole genome sequence were successfully obtained. Genetic evolution analysis showed that FPLV-GZ01FPLV-GZ02 and other isolates FPLV-XJ01FPLV-HRB belong to the same branch in Guangzhou, suggesting that FPLV-GZ01FPLV-GZ02 evolved from FPLV-XJ1 and the NS1 gene phylogenetic tree showed that FPLV might be recombined with CPV-447. The analysis of main amino acid loci showed that the genetic variation of FPLV in the main amino acid loci of VP2 gene was more conserved than that of CPV. It was found that FPLV-GZ01FPLV-GZ02 had different degree of amino acid mutation on NS1 gene. [conclusion] the panleukopenia virus isolated in Guangzhou area is still recombination and evolution.
【作者单位】： 华南农业大学兽医学院/广东省兽医临床重大疾病综合防控重点实验室/广东省宠物工程技术研究中心;
【基金】：国家重点研发计划(2016YFD0501004) 公益性行业(农业)科研专项(201303042)
【分类号】：S852.65
【参考文献】
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【共引文献】
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，本文编号：1880216
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