欧洲型PRRSV辽宁株LNEU12的分离及其ORF5的序列分析

发布时间：2018-08-14 14:56

【摘要】：从辽宁某猪场疑似猪繁殖与呼吸综合征(PRRS)病猪全血中分离到1株病毒,经Marc-145细胞5次传代后出现稳定的细胞病变(CPE),电镜观察病毒粒子直径约55 nm,并命名为LNEU12。采用RT-PCR方法扩增分离毒的ORF5全序列,再将目的基因克隆入p MD18-T载体进行测序,并与国内外已发表的毒株序列进行比较。结果表明:分离毒的ORF5基因与LV、Amervac株的核酸同源性分别为87.1%和87.6%,与国内分离的欧洲型毒株同源性为83.5%~94.2%。与LV株比较,分离毒GP5有22个氨基酸发生了变异,并存在3个潜在N-糖基化位点。基因系统发育树分析表明:分离毒LNEU12与BJEU06-1、NVDC-NM1-2011株的亲缘关系很近,而与VR2332美洲株处于不同的分支,由此推断分离毒LNEU12为欧洲型PRRSV。
[Abstract]:A strain of virus was isolated from the whole blood of a suspected porcine reproductive and respiratory syndrome (PRRS) disease pig in a pig farm in Liaoning province. After five passages of Marc-145 cells, stable cytopathic effect was observed by (CPE), electron microscope, and the diameter of the virus particles was about 55 nm and named LNEU12. The whole ORF5 sequence of the isolated virus was amplified by RT-PCR method. The target gene was cloned into p MD18-T vector and sequenced, and compared with the published strains at home and abroad. The results showed that the nucleic acid homology of the isolated ORF5 gene was 87.1% and 87.6%, respectively, and the homology with the European strain was 83.5% and 94.2%, respectively. Compared with LV strain, the isolated GP5 had 22 amino acids and 3 potential N-glycosylation sites. Phylogenetic tree analysis showed that the isolated virus LNEU12 was closely related to BJEU06-1 NVDC-NM1-2011 strain, but was in a different branch with VR2332 strain in America, so it was deduced that the isolated virus LNEU12 was a European type of PRRSVV.The genetic phylogenetic tree analysis showed that the isolated virus LNEU12 was closely related to BJEU06-1 NVDC-NM1-2011 strain.
【作者单位】： 锦州医科大学畜牧兽医学院;
【基金】：辽宁省教育厅科研项目(L2014327)
【分类号】：S852.651

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本文编号：2183219