猪圆环病毒2型江西株的全基因组克隆和序列分析

发布时间：2018-11-14 11:15

【摘要】：为了解江西地区猪圆环病毒2型(PCV-2)的流行和进化情况,根据GenBank上已发表的PCV-2全基因序列设计1对引物,PCR扩增后得到9条PCV-2全基因序列,并对其全基因序列核苷酸和蛋白序列进行分析,绘制遗传进化树。结果表明,江西地区流行的9株PCV-2中,基因组序列全长分为8株1 767bp和1株1 768bp,9株PCV-2的核苷酸同源性为94.7%~99.9%,与GenBank己发表的PCV-2分离株全基因组同源性介于94.3%~99.8%之间,而9株PCV-2的ORF1核苷酸序列同源性为96.9%~100.0%。ORF2和ORF3编码的蛋白氨基酸序列存在部分位点突变。遗传进化树显示为3种基因型:5株PCV-2b、3株PCV-2d、1株PCV-2a。本研究有助于江西地区PCV-2的监测和防制。
[Abstract]:In order to understand the prevalence and evolution of porcine circovirus type 2 (PCV-2) in Jiangxi province, a pair of primers were designed according to the published PCV-2 gene sequence on GenBank, and 9 PCV-2 gene sequences were obtained by PCR amplification. The nucleotide and protein sequences of the whole gene were analyzed and the genetic evolution tree was plotted. The results showed that the nucleotide homology of 9 PCV-2 strains in Jiangxi province was 94.7% and 99.9% respectively. The total length of genomic sequence was divided into 8 strains (1 767bp) and 1 strain (1 768 BP). The homology of the whole genome of the PCV-2 isolate published by GenBank was 99.8%, and the homology of the whole genome of the isolate was between 94.33% and 99.8%. The nucleotide sequence homology of ORF1 in 9 strains of PCV-2 was 96.9%~100.0%.ORF2 and ORF3 encoded protein amino acid sequence with partial mutation. Genetic evolution tree showed three genotypes: 5 PCV-2b,3 strains, PCV-2d,1 strain PCV-2a. This study is helpful to the monitoring and control of PCV-2 in Jiangxi province.
【作者单位】： 江西农业大学动物科学技术学院;
【基金】：江西省研究生创新专项资金(YC2013-S123)
【分类号】：S852.651

【参考文献】

相关期刊论文 前10条

1 张志;孙启峰;张美晶;吴发兴;刘爽;董雅琴;邵卫星;李晓成;王树双;;我国猪圆环病毒病的流行病学分析[J];中国动物检疫;2015年11期

2 董烨;郭士琪;孙雪;沈国顺;刘丽霞;;辽宁地区猪圆环病毒2型全基因克隆与序列分析[J];中国畜牧兽医;2015年11期

3 朱向波;;猪圆环病毒2型研究进展[J];中国畜牧兽医文摘;2015年04期

4 李海花;覃尧;张全红;李秀丽;;猪圆环病毒2型Cap全基因的克隆与原核表达[J];中国畜牧兽医;2015年02期

5 王伟丞;曾智勇;汤德元;刘钊;;猪圆环病毒2型贵州株全基因组的克隆与序列分析[J];畜牧与兽医;2014年09期

6 郭颖初;王开功;周碧君;程振涛;文明;温贵兰;汪德生;;猪圆环病毒2型ORF1基因的克隆与原核表达[J];中国畜牧兽医;2013年11期

7 刘金鑫;孙孟娇;陈磊;王雪娇;银森森;;猪圆环病毒研究进展[J];动物医学进展;2012年02期

8 乔翠;高凤山;许崇波;;猪圆环病毒2型分子致病机理及相关疾病研究进展[J];中国畜牧兽医;2012年02期

9 陈琼;;猪圆环病毒2型福建株的全基因组克隆与序列分析[J];生物技术通报;2010年02期

10 杨晓农;郭万柱;徐志文;朱玲;王新;曾秀;王小玉;;猪圆环病毒Ⅱ型ORF3基因缺失突变毒株对仔猪的致病性及免疫原性研究[J];畜牧兽医学报;2008年08期

相关博士学位论文 前1条

1 温立斌;猪圆环病毒2型的分子流行病学研究[D];中国农业大学;2005年

相关硕士学位论文 前2条

1 周松海;猪圆环病毒2型捕获ELISA抗体检测方法的建立与临床应用[D];华中农业大学;2013年

2 孙贤;猪圆环病毒2型的流行病学调查与综合防控措施研究[D];南京农业大学;2012年

【共引文献】

相关期刊论文 前10条

1 张遥遥;张小莺;李新平;;猪圆环病毒2型Cap基因的原核表达及IgY多抗的制备[J];中国兽医科学;2017年06期

2 付远妨;赵尉丹;杨潇;林霜;胡庭俊;陈海兰;;鸡血藤总黄酮对猪圆环病毒2型感染小鼠脾脏氧化应激的影响[J];中国畜牧兽医;2017年05期

3 湛洋;胡意;王东亮;蔡杰;邓治邦;;PCV2a-ORF3基因缺失株感染性克隆的构建[J];中国预防兽医学报;2017年05期

4 李观辉;李勇发;沈淼优;;猪圆环病毒感染相关疾病及防控措施[J];畜牧兽医科学(电子版);2017年04期

5 蔡高峰;李凯;张黎;王伟松;何后军;;猪圆环病毒2型江西株的全基因组克隆和序列分析[J];中国畜牧兽医;2017年03期

6 李娇;王文秀;谢金文;李峰;沈志强;;我国猪圆环病毒病的流行现状分析[J];养猪;2016年06期

7 王立波;吴润生;闫超;吕暾;;不同佐剂对猪圆环病毒衣壳蛋白免疫原性的影响[J];中国畜牧兽医;2016年11期

8 岳锋;周娟娟;朱艳平;李鹏;孙国鹏;王选年;;猪PD-1及其配体PD-L1和PD-L2 SYBR Green Ⅰ Real-time PCR检测方法的建立及应用[J];中国畜牧兽医;2016年11期

9 彭泽琴;张小苗;阿瑶;;云南省临沧地区猪圆环病毒2型血清学调查[J];黑龙江畜牧兽医;2016年18期

10 李海花;张蕾;杨春蕾;赵向华;乔家运;王文杰;;PCV2通过NF-κB/NLRP3信号通路调控体外培养PAMs分泌IL-1β[J];中国畜牧兽医;2016年09期

相关博士学位论文 前5条

1 董林;猪圆环病毒2型诊断试剂盒的研制与应用[D];吉林大学;2014年

2 张建远;猪圆环病毒pVAX1-ORF2-ISS核酸疫苗及与猪细胞因子联合免疫研究[D];四川农业大学;2009年

3 祝卫国;猪圆环病毒2型（PCV2）的研究[D];西北农林科技大学;2008年

4 杨增岐;断奶仔猪多系统衰竭综合征的研究[D];西北农林科技大学;2007年

5 冯志新;猪圆环病毒2型致病机理和重组腺病毒介导shRNA抑制PCV2在体内外复制的研究[D];南京农业大学;2007年

相关硕士学位论文 前4条

1 关男;猪繁殖障碍疫病4种病毒多重PCR方法的建立及初步应用[D];锦州医科大学;2016年

2 常晓霞;猪伪狂犬病毒、猪细小病毒和猪圆环病毒2型联合共检可视化基因芯片检测技术研究[D];四川农业大学;2015年

3 杨莹莹;猪圆环病毒2型Cap蛋白原核表达及间接ELISA方法的建立[D];东北林业大学;2015年

4 王丽敏;猪圆环病毒2型Cap蛋白阻断ELISA抗体检测试剂盒的标准化研究[D];南京农业大学;2014年

【二级参考文献】

相关期刊论文 前10条

1 李海花;李秀丽;张莉;孙英峰;任卫科;路超;田向学;;猪圆环病毒2型天津株的全基因组克隆与序列分析[J];动物医学进展;2014年01期

2 杨芳;陈立功;李艳琴;宋勤叶;赵丹萍;李潭清;;猪圆环病毒2型SD/2008株对仔猪的致病性[J];中国兽医学报;2013年04期

3 刘健;张维谊;鞠厚斌;杨德全;王建;刘佩红;周锦萍;;猪圆环病毒2a/2b亚型病毒株毒力分析[J];中国畜牧兽医;2013年02期

4 薛云;赵战勤;王清义;龙塔;庞有志;董发明;;河南省猪圆环病毒2型感染的病原流行病学研究[J];河南农业科学;2012年08期

5 黄新;康立超;韩猛立;何延华;钟发刚;;猪圆环病毒2型XJ-SW株全基因组的克隆与序列分析[J];中国兽医科学;2012年05期

6 李玲;李国新;周艳君;童武;王礞礞;童光志;;2008～2011年中国部分地区猪圆环病毒2型的分子流行病学调查[J];中国动物传染病学报;2012年02期

7 王贵华;陈义锋;汤波;刘明明;陈翠云;赵亚荣;;猪圆环病毒2型毒株分离鉴定和体外增殖特性研究[J];中国畜牧兽医;2012年01期

8 车勇良;庄向生;石运通;王隆柏;魏宏;陈如敬;吴学敏;周伦江;;猪圆环病毒2型间接ELISA方法的建立[J];中国农学通报;2011年07期

9 王宪文;姚四新;刘兴友;刘丽艳;杭柏林;;猪圆环病毒2型复制及其影响因素[J];中国畜牧兽医;2011年03期

10 郭抗抗;张彦明;张红;刘华科;宁蓬勃;王晶钰;;猪圆环病毒2型分离株优势基因型分析与检测[J];中国预防兽医学报;2010年10期

相关硕士学位论文 前3条

1 丁献红;禽流感病毒抗原纯化方法的建立及纯化抗原对鸡体免疫效果研究[D];河南农业大学;2009年

2 李益飞;猪圆环病毒Rep蛋白在大肠杆菌中的表达及其单克隆抗体的研制[D];浙江大学;2007年

3 施旅娟;PCV-2感染仔猪的病理学变化及淋巴结细胞凋亡的研究[D];南京农业大学;2006年

【相似文献】

相关期刊论文 前10条

1 龚振华,尹燕博,沈广;猪圆环病毒:一种新发现的病原[J];中国预防兽医学报;2000年S1期

2 王丽荣;;猪圆环病毒的病原学与诊断[J];安徽农业科学;2006年06期

3 孙艳明;赵德明;;猪圆环病毒分子生物学研究进展[J];中国畜牧兽医;2006年07期

4 IGORMOROZOV,李凯年;猪圆环病毒及临床意义[J];国外畜牧科技;1999年05期

5 冯卫;陈沫;杨晓容;聂克艳;陈静;姜萍;杨林;刘海;颜艳;王海;;基于文献计量法分析我国猪圆环病毒的研究现状[J];农技服务;2013年12期

6 王志军;郭慧娟;李秀丽;董树仁;鄢明华;;猪圆环病毒病原学研究进展[J];天津农业科学;2014年08期

7 ;兽药新产品——猪圆环病毒疫苗[J];科技致富向导;2010年28期

8 段丽丽,文心田,曹三杰,马晓平;猪圆环病毒分子生物学研究进展[J];动物医学进展;2005年06期

9 丁昌春;郑新勇;杨世兴;;猪圆环病毒研究进展[J];中国动物检疫;2006年08期

10 王慧杰;乔宏兴;;猪圆环病毒河南株的分离鉴定[J];中国农学通报;2007年09期

相关会议论文 前10条

1 王东方;安春霞;刘光辉;闫若潜;吴志明;;猪圆环病毒1、2型多重PCR诊断方法建立及应用[A];中国畜牧兽医学会家畜传染病学分会第七届全国会员代表大会暨第十三次学术研讨会论文集（上册）[C];2009年

2 冯丽丽;张改平;张丽萍;朱礼倩;李娇;杨苏珍;席俊;;猪圆环病毒致病机理的研究进展[A];河南省畜牧兽医学会第七届理事会第二次会议暨2008年学术研讨会论文集[C];2008年

3 黄立平;刘长明;危艳武;陆月华;郭龙军;温士刚;武嘉男;吴洪丽;;检测猪圆环病毒2型血清中和抗体阻断ELISA方法的建立及应用[A];中国畜牧兽医学会家畜传染病学分会第七届全国会员代表大会暨第十三次学术研讨会论文集（上册）[C];2009年

4 程荣华;刘云志;孙健;呼延含蓉;赵欣;邵洪泽;张丽媛;杨金生;;浅谈猪圆环病毒研究现况[A];低碳经济与科学发展——吉林省第六届科学技术学术年会论文集[C];2010年

5 王鑫;叶贺佳;李敏;仇微红;孙招金;梁昭平;;猪圆环病毒研究进展[A];中国畜牧兽医学会生物制品学分会中国微生物学会兽医微生物学专业委员会2010年学术年会（第三届中国兽药大会学术论坛）论文集[C];2010年

6 郎洪武;赵德明;王力;张广川;程君生;宋立;;猪圆环病毒分离、鉴定及猪断奶多系统衰弱综合征[A];中国畜牧兽医学会兽医病理学分会第十一次兽医病理学、第十次动物病理生理学学术研讨会论文集[C];2001年

7 郎洪武;赵德明;王力;张广川;程君生;宋立;;猪圆环病毒分离、鉴定及猪断奶多系统衰弱综合征[A];第四届中国畜牧兽医青年科技工作者学术研讨会论文集[C];2001年

8 芦银华;谈国蕾;陈德胜;陈溥言;;猪圆环病毒、猪繁殖和呼吸综合征病毒快速检测方法的研究[A];猪的重要传染病防治研究新成果——中国畜牧兽医学会家畜传染病学分会第五届理事会第二次全体会议暨防检疫专业委员会第7次学术交流会论文集[C];2002年

9 万遂如;;猪圆环病毒感染[A];中国畜牧兽医学会家畜传染病学分会成立20周年庆典暨第十次学术研讨会论文集（上）[C];2003年

10 万遂如;;猪圆环病毒感染的防治[A];现代化养猪企业经营管理研讨会论文集[C];2004年

相关重要报纸文章 前10条

1 临城县畜牧办公室 张荣连;猪圆环病毒与肺炎混感的诊治[N];河北科技报;2014年

2 江苏省农科院兽医所 俞正玉 林继煌;猪圆环病毒感染[N];江苏农业科技报;2004年

3 李凯年 译;日本韩国发现猪圆环病毒感染[N];中国畜牧水产报;2001年

4 记者 尹江勇;“猪圆环病毒疫苗”技术实现国产化[N];河南日报;2010年

5 张晓鹏　记者 李丽云;国内首创“猪圆环病毒新一代疫苗”研制成功[N];科技日报;2010年

6 记者 孟山　李松战;猪圆环病毒疫苗在洛研制成功[N];洛阳日报;2010年

7 记者 乔地　通讯员 闻亚丽;“猪圆环病毒”疫苗批准上市[N];科技日报;2010年

8 邢台市兽医院 邢兰君 杨立帆;猪圆环病毒与附红细胞体混感怎么办[N];河北科技报;2014年

9 张晓鹏;“猪圆环病毒疫苗”全国推广[N];农民日报;2010年

10 本报记者 乔地　通讯员 马焱 郑世孝;科技创新,走在富民强国的路上[N];科技日报;2010年

相关博士学位论文 前10条

1 周莹珊;猪圆环病毒2型感染诱导PK-15细胞内质网应激与凋亡的机制研究[D];浙江大学;2016年

2 时建立;猪圆环病毒2型糖基化位点突变对病毒复制能力和致病性的影响及抗体胶体金检测方法的建立[D];山东师范大学;2016年

3 芦银华;华东地区猪圆环病毒2型的分子流行病学调查及其感染性核酸的构建[D];南京农业大学;2003年

4 司兴奎;猪圆环病毒2型感染对猪免疫功能影响的细胞与分子机制[D];中国农业大学;2005年

5 曲连东;猪圆环病毒2型地方株的分离鉴定和诊断方法的建立及应用[D];南京农业大学;2006年

6 华利忠;猪圆环病毒2型诱导仔猪淋巴细胞凋亡途径的研究[D];南京农业大学;2011年

7 温立斌;猪圆环病毒2型的分子流行病学研究[D];中国农业大学;2005年

8 董林;猪圆环病毒2型诊断试剂盒的研制与应用[D];吉林大学;2014年

9 朱善元;江苏部分地区猪圆环病毒2型的检测及其免疫接种试验[D];南京农业大学;2008年

10 潘群兴;猪圆环病毒2型感染分子诊断与防制的相关研究[D];南京农业大学;2008年

相关硕士学位论文 前10条

1 陈冬杰;猪圆环病毒2型与猪鼻支原体共感染协同致病性研究[D];中国农业科学院;2015年

2 王晓卉;猪圆环病毒2型灭活苗参考品的研制及定值方法研究[D];中国兽医药品监察所;2015年

3 高雪洪;闽西地区猪圆环病毒2型血清学调查及遗传变异分析[D];福建农林大学;2015年

4 王力圆;不同品种猪感染圆环病毒Ⅱ型后肺组织差异miRNA的鉴定及功能分析[D];山东农业大学;2015年

5 朱鹏;猪圆环病毒2型ORF2基因的克隆与表达及其免疫原性研究[D];安徽农业大学;2014年

6 李丽;猪圆环病毒2型ORF2基因的表达及抗体ELISA方法的建立[D];中国兽医药品监察所;2011年

7 侯成才;猪圆环病毒2型Cap蛋白基因在毕赤酵母中的表达与复合水佐剂的研制[D];南京农业大学;2014年

8 陈福旺;猪瘟病毒感染报告细胞系和猪圆环病毒2型敏感细胞系的建立[D];吉林大学;2016年

9 陈灵艳;猪圆环病毒衣壳蛋白ORF2的原核表达系统的研究[D];福州大学;2014年

10 张广芳;猪圆环病毒2型ORF3基因的原核表达与间接ELISA检测方法的建立及初步应用[D];西北农林科技大学;2016年

，

本文编号：2331011