广东部分地区猪戊型肝炎的分子流行病学调查

发布时间：2018-11-22 17:53

【摘要】：为了解广东地区猪戊型肝炎的感染情况,本试验于2015年在广东不同猪场收集了2月龄内猪胆汁73份,RTnPCR检测、全基因组测序、同源性及进化分析结果显示:猪感染戊型肝炎的阳性率为6.8%(5/73),5个ORF2部分核苷酸序列同源性为87.2%~99.4%,属于基因4型,4b、4h亚型。对4b亚型中的1个阳性样品(GZHD)株进行全基因测序,其核苷酸序列与swGX40(EU676172)同源性最高为96.5%,与广东株SS19(JX855794)同源性为93.9%,与人源戊型肝炎病毒(HEV)株CVS-Sie10(LC042232)同源性为94.8%。结果表明:广东地区猪群间HEV流行毒株仍以基因4型为主,且为揭示戊型肝炎的跨种传播提供了新的分子生物学依据。
[Abstract]:In order to understand the infection of swine hepatitis E in Guangdong, 73 samples of pig bile were collected in different pig farms in Guangdong province in 2015. The samples were detected by RTnPCR, and the whole genome was sequenced. The results of homology and evolution analysis showed that the positive rate of hepatitis E infection in pigs was 6.8% (5 / 73), and the homology of 5 ORF2 partial nucleotide sequences was 87.2%. The nucleotide sequence of one positive (GZHD) strain of 4b subtype was 96.5 with swGX40 (EU676172) and 93.9 with Guangdong SS19 (JX855794). The homology with human hepatitis E virus (HEV) strain CVS-Sie10 (LC042232) was 94. 8%. The results showed that gene 4 was the dominant HEV strain among swine populations in Guangdong, which provided a new molecular biological basis for revealing the interspecies transmission of hepatitis E.
【作者单位】： 华南农业大学兽医学院;
【基金】：现代农业生猪产业技术体系资助项目(CARS-36)
【分类号】：S858.28

【参考文献】

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【共引文献】

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本文编号：2350127