J亚群禽白血病病毒GD14A8株分离鉴定及遗传进化分析

发布时间：2018-11-25 12:27

【摘要】：为了解J亚群禽白血病病毒(ALV-J)的流行和变异情况,本研究利用ALV-p27群特异性抗原检测、PCR鉴定、病毒分离和全基因组测序分析等方法,从广东某鸡场分离鉴定出1株ALV-J,命名为GD14A8。全基因组序列分析表明,GD14A8分离株的gag、pol、env基因和LTR相对保守,而3′UTR变异较大,与ALV-J参考毒株序列同源性仅为82.5%~92.5%,其中rTM和E元件呈现大量碱基缺失,U3区出现与血管瘤分离株NHH和SCDY1类似的11个碱基缺失,可能与血管瘤形成相关。遗传进化分析表明,GD14A8分离株与我国鸡源ALV-J血管瘤分离株SCDY1亲缘关系最近。本研究为分析黄羽肉鸡源ALV-J毒株的分子特征提供了重要的数据资料,为深入了解广东地区ALV-J的变异趋势提供参考。
[Abstract]:In order to understand the prevalence and variation of subgroup J avian leukemia virus (ALV-J), the methods of ALV-p27 group specific antigen detection, PCR identification, virus isolation and genome sequencing were used in this study. Isolation and identification of a strain of ALV-J, named GD14A8. from a chicken farm in Guangdong The whole genome sequence analysis showed that the gag,pol,env gene and LTR of the GD14A8 isolate were relatively conserved, while the 3'UTR mutation was relatively large. The homology of the gag,pol,env gene with the ALV-J reference strain was only 82.5% and 92.5%. The rTM and E elements showed a large number of base deletions, and the 11 base deletions in U3 region were similar to those of hemangioma isolates NHH and SCDY1, which might be related to the formation of hemangioma. Genetic and evolutionary analysis showed that GD14A8 isolates had the closest relationship with Chinese chicken ALV-J hemangioma isolate SCDY1. This study provides important data for the analysis of molecular characteristics of ALV-J strains from yellow broiler chickens, and provides a reference for further understanding the variation trend of ALV-J in Guangdong.
【作者单位】： 华南农业大学动物科学学院;
【基金】：广东省科技计划资助项目(2015A020209137)
【分类号】：S852.65

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