陕西部分地区山羊毕氏肠微孢子虫多位点基因分型研究

发布时间：2019-03-09 17:02

【摘要】：为了阐明山羊毕氏肠微孢子虫的遗传多样性,笔者采用基于微卫星(MS1、MS3、MS7)和小卫星(MS4)位点的多位点序列分型技术首次对不同用途山羊的122个毕氏肠微孢子虫分离株进行了多位点序列分型研究。结果发现,在MS1、MS4和MS7位点的扩增效率依次为27.9%(34/122)、18.0%(22/122)、50.8%(62/122),而在MS3位点所有样品均未获得有效扩增。核苷酸序列分析表明,所有样品的MS1、MS4和MS7位点分别具有16、9和18个基因型,共形成了14个MLGs。其中,50份绒山羊阳性样品3个位点扩增效率分别为10.0%(5/50)、14.0%(7/50)和90.0%(45/50),分别具有3、3和10个基因型,共形成了5个MLGs;56份奶山羊阳性样品3个位点的扩增效率依次为28.6%(16/56)、19.6%(11/56)和8.9%(5/56),分别组成4、4、1个基因型,共组成7个不同的MLGs;16份黑山羊阳性样品在3个位点的扩增效率依次为81.3%(13/16)、25.0%(4/16)、75.0%(12/16),分别具有9、2、7个基因型,构成2个MLGs。
[Abstract]:In order to clarify the genetic diversity of Microsporidium pyrenoides in goats, the authors used microsatellite-based (MS1,MS3,). MS7) and microsatellite (MS4) were used for the first time to study the multi-site genotyping of 122 isolates of Microsporidium Pichia from goats for the first time in this paper. The results were as follows: (1) Multi-site genotyping was carried out for the first time in goats with different uses. The results showed that the amplification efficiency of MS1,MS4 and MS7 loci were 27.9% (34 / 122), 18.0% (22 / 122), 50.8% (62 / 122), respectively, while none of the samples at MS3 site was amplified effectively. Nucleotide sequence analysis showed that there were 16, 9 and 18 genotypes of MS1,MS4 and MS7 loci, respectively, and 14 MLGs. were formed in all samples. Among them, the amplification efficiency of three loci was 10.0% (5 / 50), 14.0% (7 / 50) and 90.0% (45 / 50), respectively, and there were 3, 3 and 10 genotypes in 50 positive samples of cashmere goat. Five MLGs; were formed in total. The amplification efficiency of three loci in 56 dairy goats was 28.6% (16 / 56), 19.6% (11 / 56) and 8.9% (5 / 56), respectively, consisting of 4,4,1 genotype and 7 different MLGs; genotypes. The amplification efficiency of 16 black goat positive samples was 81.3% (13 / 16), 25.0% (4 / 16), 75.0% (12 / 16), respectively, with 9, 2 and 7 genotypes, which constituted 2 MLGs..
【作者单位】： 西北农林科技大学动物医学院;河南牧翔动物药业有限公司;陕西省珍稀野生动物抢救饲养研究中心;
【分类号】：S852.723

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本文编号：2437670