CiteSpace软件分析反刍动物胃肠道微生物研究科技论文的图谱

发布时间：2019-10-11 15:49

【摘要】：为了解反刍动物胃肠道微生物研究领域的研究历史,作者通过Web of Science数据库查找得到1940年到2017年2月20日为止6 372篇该领域的文献,通过CiteSpace软件分析其参考文献、关键词、作者、机构等元素,挑选重要的文献进行仔细阅读、分析、归纳和总结,展示该领域的研究方法发展史、研究内容发展史以及当前的研究热点。微生物研究方法在不断进步,人们对反刍动物胃肠道微生物的认识也越来越深入,研究者们不仅探究胃肠道微生物于宿主消化的意义,也开始发掘与宿主健康、生理、生产性状的直接联系。对于如何开展反刍动物胃肠道微生物的相关研究,建议全面收集相关研究信息、谨慎选择研究方法、有选择地研读科技文献。
【图文】：

胃肠道微生物,反刍动物,发文量,被引频次

?微生物的阐释具有重要意义；Janssen等[8]提出古细菌主要是由产甲烷菌组成的（被引频次104）；Hook等[9]总结了古细菌和后肠道微生物是主要的产甲烷微生物。Stevenson等[10]认为瘤胃微生物主要是由普氏菌属（42%~60%）和其他稀有菌属（少于1%）构成（被引频次135），这种瘤胃微生物区系结构的阐释是不够完全的。近年发现，，瘤胃微生物主要由细菌、真菌、原虫、古细菌组成[11]。Brulc等[12]发现细菌占到所有微生物的95%。目前高通量1985199019952000200520102015年文量，篇发6004002000图１反刍动物胃肠道微生物研究国际年发文量图2反刍动物胃肠道微生物领域文献共被引网络知识图谱标题作者年份出版物被引频次StructureoftheArchaealCommunityoftheRumenJanssen等[8]2008AppliedandEnvironmentalMicrobiology104DominanceofPrevotellaandlowabundanceofclassicalruminalbacterialspeciesinthebovinerumenrevealedbyrelativequantificationreal-timePCRStevenson等[10]2007AppliedMicrobiologyandBiotechnology135Gene-centricmetagenomicsofthefiber-adherentbovinerumenmicrobiomerevealsforagespecificglycosidehydrolasesBrulc等[12]2009TheNationalAcademyofSciencesoftheUSA109Nutrientrequirementsofdairycattle.NRC[15]2001Nutrientrequirementsofdairycattle130QIIMEallowsanalysisofhigh-throughputcommunitysequencingdataCaporaso等[22]2010NatureMethods123表1反刍动物胃肠道微生物领域被引频次排前5的文献

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、研究主体，并提供一些研究建议。1研究历史分析1.1反刍动物胃肠道微生物研究的国际发文量分析如图1所示，该领域在1954年发表了第1篇文献，1954—1990年，平均每年发文量约2篇（图1中未显示）。1990—2005年，发文量处于缓慢增长时期；2005年以后，发文量快速增长；2016年发文量已达556篇。1.2对反刍动物胃肠道微生物区系结构的探索图2是CiteSpace生成的胃肠道微生物领域高被引文献按照时间排序的共被引网络知识图谱，每一个节点都是在本领域被引用次数较高的文献；连线代表共被引关系，线越粗，共被引次数越高。图2中，共有243篇文献和485条连线，标出名字的文献是被引次数最高的4篇。被引频次最高的5篇文献的详细信息如表1所示。被引频次较高的文献对该领域研究进展贡献较大，是该领域的学科基础，主要探讨了领域内重要的分析方法，也探索了反刍动物胃肠道重要的微生物群体，进而完善反刍动物胃肠道微生物的组成结构信息。在体外分离培养和发酵活动研究的时代，完整地阐释反刍动物胃肠道微生物区系结构几乎是不可能的，只能分离、培养和研究可培养的微生物，如瘤胃球菌属、甲烷细菌属和丁酸弧菌属等[6]。甲烷不能被反刍动物利用，如瘤胃中产甲烷菌较多，将会造成饲料利用效率下降；如果甲烷排放到大气中，会加重温室效应；产甲烷菌成为后续研究的焦点。后肠是发酵产生甲烷的重要场所，Stewart[7]对后肠微生物的阐释具有重要意义；Janssen等[8]提出古细菌主要是由产甲烷菌组成的（被引频次104）；Hook等[9]总结了古细菌和后肠道微生物是主要的产甲烷微生物。Stevenson等[10]认为瘤胃微生物主要是由普氏菌属（42%~60%）和其他稀有菌属（少于1%）构成（被引频次135），这种瘤胃微生物区系结构的阐释
【作者单位】：中国农业大学动物科技学院;北京首农畜牧发展有限公司;
【基金】：现代农业(奶牛)产业技术体系建设专项资金(CARS-36) 长江学者和创新团队发展计划(IRT_15R62)
【分类号】：S852.6

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