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略阳乌鸡不同生长时期脾脏转录组学分析及免疫相关基因筛选

发布时间:2020-04-07 18:51
【摘要】:本研究在测定略阳乌鸡体重、脾脏重量等生长性状及鸡脾脏发育状况的基础上,运用转录组测序和生物信息学分析技术鉴定差异表达基因和影响脾脏发育的关键基因,旨在进一步发掘略阳乌鸡生长脾脏发育与免疫相关基因及相关通路,探索其内在分子机制。选取7日龄、30日龄和120日龄且饲养条件相同的略阳乌鸡各3只。测量体重和脾脏重量,收集脾脏组织,利用石蜡切片对脾脏发育进行组织学分析,利用RNA-seq技术对略阳乌鸡脾脏组织进行转录组测序,分析基因表达模式。主要结果如下:1.脾脏组织学观察:7日龄略阳乌鸡脾脏T、B淋巴细胞和淋巴鞘开始产生,30日龄略阳乌鸡脾脏T、B淋巴细胞数量和淋巴鞘数量更多,形态趋于稳定,120日龄略阳乌鸡脾脏与30日龄相比无显著差异。2.转录组测序筛选差异表达基因:通过转录组测序发现7日龄与30日龄相比差异表达基因340个;30日龄与120日龄相比差异表达基因174个;7日龄与120日龄相比差异表达基因1100个。三组对比共同差异表达基因17个。3.差异表达基因GO、KEGG分析:7日龄与30日龄差异表达基因主要富集在外部刺激反应、白细胞迁移、细胞趋化性、粒细胞迁移和防御反应等与免疫相关的条目。30日龄与120日龄差异表达基因主要富集在细胞趋化作用、白介素-1的调节、外部刺激反应、细菌防御反应和趋化因子受体结合等与免疫相关的条目。7日龄与120日龄差异表达基因主要富集在细胞周期、有丝分裂核分裂、染色体的浓缩、着丝粒和纺锤体微管等与细胞分裂相关的条目。此外,三组间对比的差异基因均富集到了造血细胞谱系信号通路、神经活性配体受体相互作用信号通路和细胞因子-细胞因子受体相互作用信号通路。4.权重基因共表达网络分析:构建了与性状相关联的权重基因共表达网络,筛选出与鸡生长发育相关的关键基因有:EVL、FGD3、TNIK、QRICH1、ZYX、TBL1X、IFT80、SF3B1、CEPT1、MYH9、POLH和MICAL1;影响略阳乌鸡免疫功能的关键基因有:EVL、VAV3、TNIK、NLRC3、IL2RB、RPS25、WBP1L、DDX17、ABHD10、PON2、FANCD2和CD3E。
【图文】:

乌鸡,略阳,日龄,脾脏


-10-图 2-2 不同日龄略阳乌鸡脾脏重量变化规律ig. 2-2 Changes in spleen weight of Lueyang black-bone chicken at different day-不同日龄略阳乌鸡脾脏组织学分析同发育阶段的鸡脾脏组织结构进行研究,可以将脾脏免疫细胞的发育联系起来,从而揭示其所蕴含的生物学意义。略阳乌鸡脾脏石蜡切片图可知,7 d 鸡脾脏有零星淋巴细胞(蓝色部位),中央动脉周围包裹织。30 d 鸡脾脏生发中心变多变大,,白髓和红髓的界线更加明显,椭着大量淋巴细胞。120 d 鸡脾脏动脉明显且数量变多,生发中心显著量也显著增多。

乌鸡,略阳,石蜡切片,鸡脾


从而揭示其所蕴含的生物学意义。略阳乌鸡脾脏石蜡切片结果见图2-3,由图可知,7 d 鸡脾脏有零星淋巴细胞(蓝色部位),中央动脉周围包裹着一些弥散淋巴组织。30 d 鸡脾脏生发中心变多变大,白髓和红髓的界线更加明显,椭球淋巴鞘周围充斥着大量淋巴细胞。120 d 鸡脾脏动脉明显且数量变多,生发中心显著增大,淋巴细胞数量也显著增多。
【学位授予单位】:陕西理工大学
【学位级别】:硕士
【学位授予年份】:2019
【分类号】:S831

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