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隐孢子虫和蓝氏贾第虫在青海省牦牛中的流行情况及其种群结构研究

发布时间:2020-04-24 21:03
【摘要】:隐孢子虫(Cryptosporidium)和蓝氏贾第虫(Giardia lamblia)是两种重要的机会性人兽共患的肠道原虫,宿主范围广泛,可在全世界范围内流行,对人类健康造成威胁,也对动物的生产性能产生了不良影响。牦牛是青海省的优势种家畜,掌握该省牦牛Cryptosporidium和G.lamblia的流行情况,明确这两种原虫在牦牛的种群结构,可为牦牛隐孢子虫病和贾第虫病的防控提供参考数据。利用套式PCR技术对青海省牦牛Cryptosporidium和G.lamblia的流行情况进行调查,并对其种群结构进行分析,获得以下结果:1.对从青海省7个地区采集的1027份牦牛粪便样品进行Cryptosporidium 18S rRNA和HSP70基因的PCR扩增分析发现,牦牛Cryptosporidium总感染率为2.53%(26/1027),7个地区间及各季节间感染率总体差异均不显著。6月龄及其以内的犊牦牛和6月龄以上牦牛的Cryptosporidium感染率分别为6.25%和2.35%,两者之间差异不显著。种系发育分析结果表明,青海省存在瑞氏隐孢子虫(C.ryanae)和牛隐孢子虫(C.bovis)的感染,其中,C.ryanae是青海省感染牦牛的Cryptosporidium优势虫种。2.对从青海省7个地区采集的1027份牦牛粪便样品基于TPI基因进行蓝氏贾第虫(G.lamblia)感染情况的检测,结果发现总感染率为2.04%(21/1207),7个地区间及各季节间感染率差异均不显著,但6月龄及其以内的犊牦牛和6月龄以上的牦牛G.lamblia感染率之间差异显著,分别为8.33%和1.73%。序列比对结果发现有G.lamblia集聚体E(18/21)和集聚体A(3/21)存在。发现了1个G.lamblia集聚体A亚型A1和4个G.lamblia集聚体E亚型(E1~E4),其中E2~E4为首次鉴定的集聚体亚型。基于TPI、BG和GDH 3个基因的多位点序列分型结果显示,共有3份G.lamblia分离株在3个位点均扩增成功,构成3个不同的MLGs。其中2个集聚体E的MLGs在玉树州的牦牛发现,1个集聚体A的MLG在西宁市的牦牛中发现。
【图文】:

地理分布图,牦牛,青海省,地理分布


注: 为采样地点Note: Sampling site图 2-1 青海省牦牛粪便样品来源的地理分布Fig. 2-1 Geographical origins of fecal samples from yaks in Qinghai province2.1.1.2 主要仪器设备电热鼓风干燥箱(上海一恒科学仪器有限公司)、微型水平电泳槽(北京六一生物科技有限公司)、DYY-12 型稳压稳流电泳仪(北京市六一仪器厂)、全自动凝胶成像分析系统(北京赛智创业科技有限公司)、1-14 小型台式离心机(SIGMA,德国)、FA135s 电子天平(上海海康电子仪器厂)、手掌离心机(Scilogex,,美国)、高速离心机(安徽中科中佳科学仪器有限公司)、涡旋混合器(海门市其林贝尔仪器制造有限公司)、电数显恒温水浴锅(国华电器有限公司公司)、单道移液器(大龙兴创实验仪器有限公司)、PCR 扩增仪(杭州博日科技有限公司)、洁净工作台(苏州安泰空气技术有限公司)、IMS 系列全自动雪花制冰机(雪科电器有限公司)。2.1.1.3 主要试剂及溶液

核苷酸序列,隐孢子虫,牦牛,PCR扩增


视为差异显著,当 P≥0.成功测序的阳性样本核苷酸序列进行l Alignment Search Tool(BLAST)在pson et al. 1997)。利用 MEGA 7.0.26bor-joining),自展值为 1000,Kimurayi 和 C. parvum 为参考序列,GenBankAB089290。 以努氏内阿米巴(Enta外群。um PCR 扩增结果样品中,有 26 份样品成功扩增出A 基因目的片段(图 2-2)。在 26 份阳的目的片段(图 2-3)。
【学位授予单位】:西北农林科技大学
【学位级别】:硕士
【学位授予年份】:2018
【分类号】:S858.23

【参考文献】

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本文编号:2639396

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