褐黄血蜱、长角血蜱的ITS序列及线粒体基因组研究
发布时间:2020-06-20 00:11
【摘要】:蜱是一类以吸血为生的体外寄生虫,对人、兽具有直、间接危害。人们一直依据蜱类的形态、结构特点对其进行分类,但一些近缘蜱种的形态特征常常难以区分。近年来,人们借助核糖体DNA内转录间隔区(Internal transcribed spacers,ITS)及某些线粒体DNA(mtDNA)基因分析很好的解决了这一问题,已成为分类的辅助手段。本项研究拟对褐黄血蜱和长角血蜱的核糖体ITS rDNA、线粒体部分基因及全基因组序列进行分析。褐黄血蜱和长角血蜱ITS-1、ITS-2序列的长度分别为1302 bp、1160 bp和1582 bp、1610 bp;褐黄血蜱ITS-1、ITS-2的种内和种间差异分别为0-1.2%,0-1.6%和50.66-52.77%,37.0-52.0%;长角血蜱ITS-1、ITS-2的种内与种间差异分别为0-2.0%,0-2.2%和35.1-55.2%,37.0%-52.0%。暗示,两种血蜱的ITS rDNA序列种内较为保守,种间差异较大,可作为蜱类分类鉴定的遗传标记。褐黄血蜱、长角血蜱线粒体基因组序列全长分别为14689 bp,14693 bp;都包含37个基因,即13个蛋白编码基因,22tRNA基因,2个rRNA基因。在13个蛋白编码基因中,nad5基因长度最长(褐黄血蜱为1656 bp,长角血蜱为1658bp);atp8基因长度最短(褐黄血蜱为162 bp,长角血蜱为154 bp);ML分析显示,褐黄血蜱与长角血蜱处于同一分枝上,与形态学的分类结果一致。对褐黄血蜱的细胞色素c氧化酶亚基(cox1)、NADH脱氧酶亚基I(nad1)、NADH脱氧酶亚基4(nad4)和长角血蜱的cox1、核糖体大亚基(16S)、NADH脱氧酶亚基5(nad5)的遗传变异分析结果显示,褐黄血蜱(cox1、nad1、nad4)的种内与种间差异分别为0-0.4%、0-0.4%、0-0.3%,和2.5-14.3%,13.6-24.8%,14.8-19%;长角血蜱(cox1、16S、nad5)的种内与种间差异分别为0-2.84%、0-3.0%、0-6.7%和13.8-15.34%,14.73-15.66%,13.3-18.11%。ML分析结果显示,两省的褐黄血蜱没有出现地区分化,而三省的长角血蜱已出现地区分化。
【学位授予单位】:湖南农业大学
【学位级别】:硕士
【学位授予年份】:2018
【分类号】:S852.746
本文编号:2721551
【学位授予单位】:湖南农业大学
【学位级别】:硕士
【学位授予年份】:2018
【分类号】:S852.746
【参考文献】
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本文编号:2721551
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