奶山羊发情期与间情期卵巢中circRNAs差异性表达谱筛选及功能预测分析

发布时间：2020-07-15 20:33

【摘要】：circRNAs能够作为吸附miRNA的“海绵”,参与机体生命活动中多种重要的生物学过程。卵巢是雌性动物的重要生殖器官,其主要功能是产生卵子和分泌雌激素。产生卵子和分泌雌激素的重要器官目前关于卵巢中circRNA的种类、数量、功能及其对卵巢发育的调控机理研究报道很少。因此本研究对奶山羊发情期和发情间期卵巢组织中circRNA表达谱进行检测和分析,为更好地探索circRNA在奶山羊发情周期的卵巢发育过程中所起到的调控作用研究提供新的试验依据。本试验以发情期与间情期的奶山羊卵巢为研究对象,通过样品提取总RNA后并对其进行处理之后制备整个文库的策略,利用IlluminaHiSeq进行测序并进行分析、生物信息学方法、GO和KEGG通路分析,采用RT-qPCR等检测技术,研究了奶山羊发情期与间情期卵巢中的circRNA及其在奶山羊发情过程中发挥的作用,并从circRNA调控的角度预测奶山羊卵巢发育不同时期差异性表达的circRNA的生理机理。主要研究结果如下:1.奶山羊发情期卵巢中circRNAs的筛选及验证研究通过circRNA高通量测序检测到奶山羊发情期和发情间期卵巢组织中候选的circRNA有22,333个,可分为六类;奶山羊发情期卵巢相对发情间期有772个circRNA差异性表达,268个上调,504个下调;奶山羊卵巢组织中除了Y染色体,circRNAs在其他所有染色体上均广泛分布,大多数circRNA长度约为500nt。2.奶山羊发情期卵巢中相关circRNAs功能预测分析(1)GO分析结果显示,共86个组显著富集在细胞组分。在分子功能GO分析中circRNA显著聚集在111个分类中,而371个在生物过程分类中聚集。(2)KEGG结果显示,105个通路被显著富集,包括黏着连接、泛素介导的蛋白水解、胞吞作用等。本试验研究了奶山羊卵巢组织中circRNA表达水平在奶山羊发情的不同生理阶段而不同,circRNAs可参与卵巢发育相关信号通路,可能与奶山羊的发情有关。该结果为circRNA在卵巢发育中RNA的功能研究提供了新的研究思路,并为circRNA参与奶山羊卵巢发育、发情的具体生物学功能和分子机理提供了数据支持。
【学位授予单位】：西北农林科技大学
【学位级别】：硕士
【学位授予年份】：2019
【分类号】：S827
【图文】：

图 1-1 发情周期（以 21 天为例）中各阶段所占比重及卵巢变化(2013)e proportion of each stage and ovarian changes in an estrous cycle (21 days as exa的结构雌性动物重要生殖器官，它可以产生卵子、分泌雌激素。具体的结

它可以产生卵子、分泌雌激素。具体的结构如图1-2 所示。图 1-2 卵巢的结构(王珊, 2016)Fig 1-2 The ovarian structure

第一章 奶山羊卵巢及 circRNA 研究进展卵巢的主要功能是促进卵泡发育。胚胎干细胞中大约有 14%~28%在胎儿时期发了雌性生殖细胞。卵原细胞（Oogonium）产生于卵巢皮质内，在卵巢皮质内散布-70 万个原始卵泡。卵母细胞和颗粒细胞（Granulosa cell）可以连续的增殖分化，形态也随之发生着不断的改变，如图 1-3 所示为卵母细胞形态依次的变化：原始、初级卵泡（Primary oocyte）、次级卵泡（Secondary oocyte）及三级卵泡。

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本文编号：2756978