季节变化对散养芦花鸡肠道菌群的影响及肠道益生芽孢杆菌的筛选

发布时间：2020-08-04 17:14

【摘要】：鸡肠道菌群与宿主呈现营养互作关系,肠道微生物结构与多样性变化影响鸡的增重和产蛋。目前使用抗生素手段调节肠道菌群的弊端不断扩大,而益生菌作为抗生素的有效替代品,其使用时间、种类等缺少依据。本研究从季节环境变化对鸡肠道菌群影响入手,研究散养芦花鸡肠道菌群季节变化规律指导养殖生产实际并筛选鉴定了肠道益生芽孢杆菌。研究内容如下。1.随季节改变,芦花鸡鸡肠道菌群结构变化较大,盲肠、小肠的夏季菌群结构与冬季相比只有66.7%、62.5%的相似度;小肠菌群结构在夏季时出现明显变化,小肠内优势菌乳杆菌占比明显下降,梭菌类数量种类提升明显;菌群丰富度未随季节明显变化,但小肠菌群种类与丰富度要远远少于盲肠。2.通过多样性指数分析,盲肠多样性要明显高于小肠;相较于鸡春季肠道菌群,冬季、夏季的环境会导致鸡盲肠菌群多样性降低,小肠菌群多样性提高;作为营养主要吸收部位的小肠,在环境较为适宜的春季,其菌群香浓指数与均匀度均为最低,此时小肠内菌群种类数较少且优势菌占比非常高。3.盲肠共性菌为乳杆菌、拟杆菌、梭菌类,小肠共性菌主要为乳杆菌。盲肠共性菌随季节变化不大,小肠不同种类乳杆菌占比随季节变化较大;冬季、夏季环境会造成特异肠杆菌、梭菌增多,春季时会出现更多的乳杆菌。4.共从芦花鸡肠道内筛选鉴定到6种芽孢菌,其中一株为球形赖氨酸芽孢杆菌(Lysinibacillus sphaericus),其余5株分别为蕈状芽孢杆菌(Bacillus mycosis)、地衣芽孢杆菌(Bacillus licheniformis)、弯曲芽孢杆菌(Bacillus flexus)、蜡状芽孢杆菌(Bacillus cereus)、马氏芽孢杆菌(Bacillus marcorestinctum)。结果表明季节改变对散养芦花鸡肠道菌群多样性与结构影响明显,盲肠菌群丰富度与多样性均高于小肠菌群。散养芦花鸡肠道菌群季节变化规律:冬季、夏季肠道主要益生菌乳杆菌占比下降,夏季小肠变化最为明显并出现较多梭菌增值;盲肠、小肠菌群多样性呈现相反变化规律;较适宜生长发育的春季,芦花鸡小肠菌群种类减少,益生乳杆菌占比最高。肠道芽孢杆菌还需益生性、安全性鉴定,用于微生态制剂研制。
【学位授予单位】：河北科技师范学院
【学位级别】：硕士
【学位授予年份】：2019
【分类号】：S831.89
【图文】：

图 2-1 样品多样性算法Fig 2-1 Sample Diversity Algorithms其中，pi 为凝胶上单一条带的灰度值在该凝胶上所有条带总灰率，N 为 DGGE 图谱单一泳道上所有条带的丰度，Ni 为第 i 条样品中所有条带数目总和。丰富度 R 用条带数表示。结果1 鸡肠道菌群基因组 DNA 提取使用试剂盒、CTAB/NaCl、CTAB 三种方法提取到的鸡肠道内 经琼脂糖电泳后得到大小约为 23kb 条带，符合预计基因组 DNA如图 2-2。基因组 DNA 纯度用 OD260/280 表示，结果见表 2-5，比值越接 纯度越高。试剂盒法提取的基因组 DNA 浓度只有 46ng/μL，

图 2-2 不同方法提取的基因组 DNA 电泳图Fig. 2-2 Genomic DNA electrophoresis maps extracted by different methods1.CTAB/NaCl 法；2.试剂盒法；3.CTAB/NaCl 法 DNA 稀释；4.CTAB 法；5.CTAB 法 DN稀释采用 CTAB 法提取不同季节散养芦花鸡小肠盲肠菌群基因组 DNA，结果图 2-3。由图可知在约 23kb 处，发现与目的条带大小相符、特异性良好、浓纯度均符合要求的基因组 DNA 可以用于后续的 DNA 特异性扩增。

图 2-2 不同方法提取的基因组 DNA 电泳图Fig. 2-2 Genomic DNA electrophoresis maps extracted by different methoTAB/NaCl 法；2.试剂盒法；3.CTAB/NaCl 法 DNA 稀释；4.CTAB 法；5.CTA稀释采用 CTAB 法提取不同季节散养芦花鸡小肠盲肠菌群基因组 DNA 2-3。由图可知在约 23kb 处，发现与目的条带大小相符、特异性良度均符合要求的基因组 DNA 可以用于后续的 DNA 特异性扩增。

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本文编号：2780844