瑞香狼毒根部潜在盐敏蛋白ScSrlk及其下游互作蛋白ScMPK6的鉴定及表达分析
发布时间：2020-08-06 17:53
【摘要】：瑞香狼毒是草原毒害草之一,它凭借自身极强的抗逆性在草原上蔓延,破坏了草原的生态平衡。结合实验室前期进行基础实验对瑞香狼毒耐盐性的观测以及相关文献报道,我们选择依赖其根部高效排盐机制而拥有耐盐性的瑞香狼毒作为研究材料。又因为在蒺藜苜蓿和紫花苜蓿中发现类受体蛋白激酶Srlk蛋白可以感知盐信号,但是具体将信号传递到哪个下游蛋白是不清楚的。结合类受体蛋白激酶普遍以MAPK家族蛋白作为胞内信号传递蛋白,其中MPK6蛋白能够激活SOS1蛋白应答盐胁迫,因此我们在瑞香狼毒根部假定了一条盐信号传导途径,为了验证这一猜想,我们主要进行了以下研究:(1)结合已报道的目标基因序列与瑞香狼毒转录组数据库中本地比对后,确定序列号为c39384.graph_c0、c73211.graph_c1、c59271.graph_c0_seq6的基因为目标基因,分别命名为ScMPK6、ScSrlk、ScSOS1,利用Primer 5、Oligo 7软件设计引物,然后以瑞香狼毒根部RNA反转录的cDNA为模板扩增目的基因,借助试剂盒将目的基因成功构建到测序载体上进行测序比对。(2)然后对ScMPK6、ScSrlk、ScSOS1基因的生物信息学进行分析,预测结果如下:ScMPK6、ScSrlk、ScSOS1蛋白相对分子质量分别为44.2467 k Da、66.83682 k Da、127.13664 k Da,ScMPK6、ScSrlk蛋白具有亲水性,ScSOS1蛋白具有疏水性;ScMPK6蛋白没有跨膜结构域也没有信号肽,具有TEY基序的活化环和CD结构域;ScSrlk蛋白序列主要分为胞外结构域、跨膜结构域和胞内结构域,胞外包括信号肽和5个亮氨酸重复序列,含有1个跨膜结构域,胞内结构域包括ATP结合位点和蛋白激酶大家族类似催化域;ScSOS1蛋白N端包括了11个跨膜结构域是Na+/H+交换区域,C端包括3个保守功能域:环核苷酸结合结构域、SOS1蛋白自抑制区域、SOS2蛋白磷酸化位点;ScSrlk、ScSOS1蛋白锚定于质膜上,ScMPK6蛋白游离于细胞核和胞质中;ScMPK6蛋白相对保守,ScSOS1蛋白与已知排盐植物的SOS1蛋白起源一致。(3)利用荧光实时定量PCR对盐胁迫处理下3个基因非保守序列的表达量进行测定,ScSrlk基因最先响应盐胁迫信号,表达量达到峰值持续积累一段时间后恢复至初始表达量以下。ScMPK6基因表达量开始缓慢上升,之后激增到达最大值,又迅速降至最低且不再有上升趋势。胁迫处理一段时间后ScSOS1基因表达量开始上升,上升至最高值后开始缓慢恢复至初始水平。(4)在体内利用双分子荧光互补技术验证ScMPK6、ScSrlk蛋白之间存在相互作用,作用于细胞周围;在体外成功诱导表达出特异蛋白,通过蛋白免疫印迹技术确定为带标签的目标重组融合蛋白ScMPK6::His、GST::ScSrlk。我们推测ScSrlk蛋白作为盐信号传感蛋白当它感知到外界环境中的盐胁迫信号时,将信号传递给ScMPK6蛋白后,由它作为胞内信号传递蛋白激活细胞内的盐胁迫响应蛋白ScSOS1来抵御胁迫。我们的验证结果与3个蛋白在该模拟信号通路中的职责一致,这些研究为我们以后深入开展工作提供了很好的借鉴。
【学位授予单位】：西北大学
【学位级别】：硕士
【学位授予年份】：2018
【分类号】：S812.6
【图文】：
图 1.1 植物细胞内全部的信号组成[62]Fig. 1.1 A cell with all signaling components in plant[62]1.2 瑞香狼毒瑞香狼毒（Stellera chamaejasme L.）属于瑞香科狼毒属多年生草本植物，生于海拔 2600-4200 m 干旱而向阳的高山草坡、草坪或河滩台地，而且其地理分布范围极其广泛[68,69]。瑞香狼毒是草原主要毒害草之一，它的蔓延不仅影响了草原牧草的生长导
样品质量检测NA 经过测定浓度在 800 ng/μl 左右，O（如表 2.1），结果表明所提取的总 RNA糖凝胶电泳共观察到 3 个条带，分别为 28 RNA，且 28S 条带亮度是 18S 条带亮度些结果都显示所提取的 RNA 可用于下一表 2.1 瑞香狼毒 RNA 分光光度检测结果The Nanodrop analysis results of the S.chamaejC（ng/μl） OD260/2801161.22 1.83 659.55 1.78 630.63 1.83
毒 ScMPK6、ScSrlk、ScSOS1 扩增产物琼e gel electrophoresis of product of ScMPK6S.chamaejasmeer（bp）；1：ScMPK6 PCR 产物（1366 b 产物（3537 bp）ScSrlk、ScSOS1 基因生物信息学分析ram 分析，推测 ScMPK6 蛋白由 387 18，原子个数为 6203，相对分子质量ropathicity，GRAVY）平均系数为-0.2式为 C3005H4704N802O871S26，原子个数为估为-0.027。推测 ScSOS1 蛋白由 111653S38，原子个数为 18024，相对分子质
本文编号：2782758
【学位授予单位】：西北大学
【学位级别】：硕士
【学位授予年份】：2018
【分类号】：S812.6
【图文】：
图 1.1 植物细胞内全部的信号组成[62]Fig. 1.1 A cell with all signaling components in plant[62]1.2 瑞香狼毒瑞香狼毒（Stellera chamaejasme L.）属于瑞香科狼毒属多年生草本植物，生于海拔 2600-4200 m 干旱而向阳的高山草坡、草坪或河滩台地，而且其地理分布范围极其广泛[68,69]。瑞香狼毒是草原主要毒害草之一，它的蔓延不仅影响了草原牧草的生长导
样品质量检测NA 经过测定浓度在 800 ng/μl 左右，O（如表 2.1），结果表明所提取的总 RNA糖凝胶电泳共观察到 3 个条带，分别为 28 RNA，且 28S 条带亮度是 18S 条带亮度些结果都显示所提取的 RNA 可用于下一表 2.1 瑞香狼毒 RNA 分光光度检测结果The Nanodrop analysis results of the S.chamaejC（ng/μl） OD260/2801161.22 1.83 659.55 1.78 630.63 1.83
毒 ScMPK6、ScSrlk、ScSOS1 扩增产物琼e gel electrophoresis of product of ScMPK6S.chamaejasmeer（bp）；1：ScMPK6 PCR 产物（1366 b 产物（3537 bp）ScSrlk、ScSOS1 基因生物信息学分析ram 分析，推测 ScMPK6 蛋白由 387 18，原子个数为 6203，相对分子质量ropathicity，GRAVY）平均系数为-0.2式为 C3005H4704N802O871S26，原子个数为估为-0.027。推测 ScSOS1 蛋白由 111653S38，原子个数为 18024，相对分子质
【参考文献】
相关博士学位论文 前4条
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本文编号：2782758
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