鸭PRLR基因单核苷酸多态性和拷贝数变异研究

发布时间：2020-09-21 13:19

　　 本研究以台湾褐色菜鸭为试验动物,通过PCR-SSCP测序对台湾褐色菜PRLR基因第10外显子进行单核苷酸多态性检测并分析其多态性与台湾褐色菜鸭各性状的关联；通过克隆获得目的基因和参照基因的重组质粒标准品,10倍浓度梯度稀释后进行定量PCR扩增,获得引物的扩增曲线和熔解曲线,绘制相应的标准曲线,优化扩增条件使得目标基因和参照基因的引物扩增效率一致,最后通过2-△△Ct方法对PRLR基因拷贝数进行定量,并分析其多态性与台湾褐色菜鸭生产性能的关联。结果如下：(1)在台湾褐色菜鸭PRLR基因第10外显子检测到1个碱基突变(G253A),存在BB和Bb两种基因型,B等位基因频率为0.787 2,b等位基因频率为0.2128,杂合度为0.3350,多态信息含量为0.2789,属于中度多态；χ2适应性检验结果表明PRLR基因第10外显子的多态位点偏离Hardy-Weinberg平衡(P0.05)。Bb基因型个体的出生重和300日龄蛋重均显著高于BB型(P0.05),且Bb基因型个体的蛋壳重极显著高于BB基因型(P0.01),(2)以10倍浓度梯度稀释的重组质粒标准品为模板进行荧光定量PCR扩增,绘制相应的标准曲线。结果显示,PRLR和Ldh-B的标准曲线的R2分别为0.991和0.990,扩增效率分别为111.68%和108.429%,斜率分别为-3.070和-3.135,说明PRLR和Lah-B的扩增效率近似一致,可以通过2-△△Ct方法对PRLR基因进行定量分析。(3)在94羽台湾褐色菜鸭的样品中共检测到1、2、3、4、5五种拷贝数变异类型,拷贝数变异与台湾褐色菜鸭的蛋壳厚度和蛋形指数显著相关(P0.05),拷贝数为2的个体蛋壳厚度显著高于拷贝数为1和5的个体；拷贝数为3的个体蛋形指数显著低于拷贝数为1、2和4的个体；其余性状均无显著相关(P0.05)。
【学位单位】：福建农林大学
【学位级别】：硕士
【学位年份】：2015
【中图分类】：S834

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本文编号：2823532