牛支原体贵州株表面膜蛋白p81基因生物信息学分析
发布时间：2021-01-13 19:33
为了解牛支原体（Mycoplasma bovis）贵州株表面膜蛋白p81基因的生物信息学特征,对2株贵州分离株p81基因进行克隆测序,应用DNAStar 7.1、Mega 5.0、Protparam、Protscale、IEBD等软件进行序列分析。结果显示,2株M.bovis贵州分离株培养物DNA样本均能PCR扩增出2 187 bp的特异性条带,序列编码728个氨基酸,该分离株与标准株PG45进化关系最为接近,说明牛支原体p81基因具有良好的保守性。p81蛋白共存在5个N糖基化位点,59个丝氨酸、29个苏氨酸及11个酪氨酸可能被磷酸化。p81蛋白B细胞抗原表位分析显示该蛋白具有良好的抗原性。研究结果表明,p81蛋白具有作为亚单位疫苗和诊断试剂靶标蛋白的优势。
【文章来源】：畜牧与兽医. 2020,52(08)北大核心
【文章页数】：6 页
【部分图文】：
p81基因片段PCR扩增结果
提取重组质粒,用限制性内切酶KpnⅠ和SalⅠ对重组质粒进行双酶切鉴定,酶切产物电泳电泳结果见图3。重组质粒双酶切可见约2 187 bp的目的基因条带和2 962 bp的载体条带,结果证实,目的基因克隆成功。2.2.3 p81基因推到氨基酸序列分析
经PCR和双酶切鉴定为阳性的重组质粒进行测序,对氨基酸序列进行推导分析。由图4可见,p81基因序列编码728个氨基酸,推导氨基酸55 位、230 位、485 位、558位密码子为TGA,可作为终止密码子,但对于牛支原体p81基因为色氨酸,如进行蛋白表达需进行位点突变。将2株M.bovis贵州株氨基酸序列与参考株PG45氨基酸序列进行比较显示, 2株分离自贵州省不地区的M.bovis贵州株氨基酸序列完全相同,但与PG45株p81蛋白氨基酸序列发生110位点突变。此结果表明,贵州省内M.bovis菌株p81蛋白保守,但相较于标准株PG45株已出现明显进化。图4 牛支原体贵州株p81基因推导的氨基酸序列
【参考文献】：
期刊论文
[1]牛支原体新疆株的分离鉴定[J]. 凌晨,郝成武,何海,张飞,候凤,贺笋. 中国畜牧兽医. 2019(05)
[2]牛支原体膜蛋白的研究进展[J]. 刘畅,曹钰晗,赵春阳,徐璐尧,张文劲,唐鑫,赖金伦,陈颖钰,郭爱珍,胡长敏. 中国兽医学报. 2018(10)
[3]牛支原体致病机理的研究进展[J]. 季文恒,陈胜利,赵萍,郝华芳,王展慧,刘永生,储岳峰. 中国预防兽医学报. 2018(04)
[4]牛支原体新疆分离株重组P81膜蛋白的表达及鉴定[J]. 赵阳,陈创夫,剡根强,石峰. 中国病原生物学杂志. 2017(10)
[5]牛支原体TaqMan实时荧光定量PCR检测方法的建立[J]. 李建,高航飞,安维雪,牛同州,赵永春,遇培之,满都拉图,乌力吉那仁,王建国,申之义. 中国兽医学报. 2017(06)
[6]宁夏某肉牛场牛支原体分离鉴定及病理组织学观察[J]. 郭亚男,曹思婷,何生虎,王爽,张鑫,孙鹏. 动物医学进展. 2017(03)
[7]牛支原体P81蛋白的表达及纯化[J]. 马海彬,韩继成,孙文超,解长占,靖杰,肖朋朋,赵飞,张萍,鲁会军,金宁一. 中国病原生物学杂志. 2017(01)
[8]牛支原体实验室检测方法研究进展[J]. 庄金秋,梅建国,刘吉山,姚春阳,马力. 中国奶牛. 2017(02)
[9]牛支原体膜蛋白研究进展[J]. 李强,赵泽慧,牛耀祖,许立华. 动物医学进展. 2016(06)
[10]绵羊肺炎支原体贵州株P113基因的克隆与生物信息学分析[J]. 吴燕,袁海文,王琦,岳筠,文明,周碧君,程振涛. 西北农业学报. 2016(03)
硕士论文
[1]牛肺炎支原体分离鉴定及主要基因分子特征研究[D]. 袁海文.贵州大学 2017
[2]鸡毒支原体S6株P25、P33蛋白粘附特性的研究[D]. 高利萍.中国农业科学院 2016
本文编号：2975440
【文章来源】：畜牧与兽医. 2020,52(08)北大核心
【文章页数】：6 页
【部分图文】：
p81基因片段PCR扩增结果
提取重组质粒,用限制性内切酶KpnⅠ和SalⅠ对重组质粒进行双酶切鉴定,酶切产物电泳电泳结果见图3。重组质粒双酶切可见约2 187 bp的目的基因条带和2 962 bp的载体条带,结果证实,目的基因克隆成功。2.2.3 p81基因推到氨基酸序列分析
经PCR和双酶切鉴定为阳性的重组质粒进行测序,对氨基酸序列进行推导分析。由图4可见,p81基因序列编码728个氨基酸,推导氨基酸55 位、230 位、485 位、558位密码子为TGA,可作为终止密码子,但对于牛支原体p81基因为色氨酸,如进行蛋白表达需进行位点突变。将2株M.bovis贵州株氨基酸序列与参考株PG45氨基酸序列进行比较显示, 2株分离自贵州省不地区的M.bovis贵州株氨基酸序列完全相同,但与PG45株p81蛋白氨基酸序列发生110位点突变。此结果表明,贵州省内M.bovis菌株p81蛋白保守,但相较于标准株PG45株已出现明显进化。图4 牛支原体贵州株p81基因推导的氨基酸序列
【参考文献】：
期刊论文
[1]牛支原体新疆株的分离鉴定[J]. 凌晨,郝成武,何海,张飞,候凤,贺笋. 中国畜牧兽医. 2019(05)
[2]牛支原体膜蛋白的研究进展[J]. 刘畅,曹钰晗,赵春阳,徐璐尧,张文劲,唐鑫,赖金伦,陈颖钰,郭爱珍,胡长敏. 中国兽医学报. 2018(10)
[3]牛支原体致病机理的研究进展[J]. 季文恒,陈胜利,赵萍,郝华芳,王展慧,刘永生,储岳峰. 中国预防兽医学报. 2018(04)
[4]牛支原体新疆分离株重组P81膜蛋白的表达及鉴定[J]. 赵阳,陈创夫,剡根强,石峰. 中国病原生物学杂志. 2017(10)
[5]牛支原体TaqMan实时荧光定量PCR检测方法的建立[J]. 李建,高航飞,安维雪,牛同州,赵永春,遇培之,满都拉图,乌力吉那仁,王建国,申之义. 中国兽医学报. 2017(06)
[6]宁夏某肉牛场牛支原体分离鉴定及病理组织学观察[J]. 郭亚男,曹思婷,何生虎,王爽,张鑫,孙鹏. 动物医学进展. 2017(03)
[7]牛支原体P81蛋白的表达及纯化[J]. 马海彬,韩继成,孙文超,解长占,靖杰,肖朋朋,赵飞,张萍,鲁会军,金宁一. 中国病原生物学杂志. 2017(01)
[8]牛支原体实验室检测方法研究进展[J]. 庄金秋,梅建国,刘吉山,姚春阳,马力. 中国奶牛. 2017(02)
[9]牛支原体膜蛋白研究进展[J]. 李强,赵泽慧,牛耀祖,许立华. 动物医学进展. 2016(06)
[10]绵羊肺炎支原体贵州株P113基因的克隆与生物信息学分析[J]. 吴燕,袁海文,王琦,岳筠,文明,周碧君,程振涛. 西北农业学报. 2016(03)
硕士论文
[1]牛肺炎支原体分离鉴定及主要基因分子特征研究[D]. 袁海文.贵州大学 2017
[2]鸡毒支原体S6株P25、P33蛋白粘附特性的研究[D]. 高利萍.中国农业科学院 2016
本文编号：2975440
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