RBP4基因多态性与贵州黑山羊产羔性状关联性分析

发布时间：2021-01-16 11:32

　　为研究RBP4基因单核苷酸多态性与贵州黑山羊产羔性状之间的关系,本研究采用混合DNA池测序和直接测序法筛选SNPs位点,进行生物信息学和群体遗传参数分析,并收集118头贵州黑山羊母羊1～4胎产羔数据,分析SNPs位点与产羔性状之间的关联性。结果显示:共检测到2个SNPs位点,为g.4527G>T和g.4744C>T。生物信息学分析发现g.4744C>T位点变异会使mRNA二级结构最小自由能增大,结构稳定性降低;群体遗传参数分析发现,g.4527G>T位点基因型频率差异较大,G为优势等位基因;g.4744C>T位点C为优势等位基因;χ²检验显示两位点均处于Hardy-Weinberg平衡。基因型与产羔数关联性分析发现,g.4527G>T位点在2、3、4胎次,野生型产羔数显著高于突变型;g.4744C>T位点在第1胎次,突变型母羊产羔数显著高于野生型。本研究揭示了RBP4基因对贵州黑山羊产羔数存在显著影响,g.4527G>T和g.4744C>T可能是影响贵州黑山羊产羔性状的重要SNPs位点。 

【文章来源】：中国畜牧杂志. 2020,56(10)北大核心

【文章页数】：6 页

【部分图文】：

RBP4基因的PCR扩增电泳图

混池测序结果

图3 单个样本测序结果统计g.4527G>T和g.4744C>T位点各个基因型个体数量，计算基因型频率、等位基因频率、群体纯合度、杂合度、多态信息含量以及HardyWeinberg平衡的卡方适合性检验，结果如表2。由表2可知，g.4527G>T位点基因型频率差异较大，G为优势等位基因，等位基因频率为0.885 2，等位基因分布不均匀；杂合度低，表明群体内变异程度小；多态信息含量小于0.25，为低度多态，能提供的遗传信息较少；χ2检验显示该位点处于Hardy-Weinberg平衡。g.4744C>T位点C为优势等位基因，等位基因频率为0.696 7，等位基因分布不均匀；杂合度较高，多态信息含量为中度多态，表明该位点可以提供一定的遗传信息；χ2检验显示该位点处于Hardy-Weinberg平衡。

【参考文献】：
期刊论文
[1]贵州黑山羊生态养殖提质增效技术[J]. 王德凤,韩勇,张华琦,粟朝芝.  农技服务. 2019(10)
[2]视黄醇结合蛋白4的生物学作用研究进展[J]. 邢辙,栾新红.  中国家禽. 2017(08)
[3]大白猪FSHβ和RBP4基因多态性与繁殖性状的相关性研究[J]. 胡闪耀,陈佳,姜佳佳,毛翠,毛慧敏,王利通,王国水,左波,徐在言.  猪业科学. 2017(03)
[4]贵州地方山羊RBP4基因多态性及生物信息学分析[J]. 邓位喜,孙振梅,李鹏程,冯文武,陈祥.  生物技术. 2016(05)
[5]家畜视黄醇结合蛋白4（RBP4）的研究进展[J]. 王旭,白俊艳,杨帅,陈森,刘力.  畜牧与饲料科学. 2016(12)
[6]视黄醇结合蛋白4（RBP4）基因多态性对猪繁殖性能的影响[J]. 王怀禹.  养猪. 2015(04)
[7]视黄醇结合蛋白4的研究进展[J]. 胡敏敏,王晓青,闫福媛,高璠,琚坚.  胃肠病学和肝病学杂志. 2015(07)
[8]大白猪、长白猪和杜洛克猪RBP4基因多态性及其与繁殖性能的相关分析[J]. 刘璐,梁永晔,吴正常,苏先敏,郑先瑞,王瑾,吴圣龙,包文斌.  中国畜牧兽医. 2012(10)
[9]猪PRLR和RBP4基因多态性与产仔性能的关系[J]. 孙延晓,曾勇庆,唐辉,樊新忠,陈其美,李华,钱源,宋一萍.  遗传. 2009(01)
[10]小尾寒羊高繁殖力候选基因RBP4的研究[J]. 何远清,郭晓红,王金玉,储明星,方丽,叶素成,周忠孝.  畜牧兽医学报. 2006(07)

硕士论文
[1]松辽黑猪RBP4和RARG基因多态性及其与繁殖性状的关联分析[D]. 王万兴.长春师范大学 2019
[2]RBP4基因和RARγ基因单核苷酸多态性与小尾寒羊高繁殖力关系的研究[D]. 郭晓红.山西农业大学 2004



本文编号：2980752