我国某地H5亚型禽流感分子流行病学调查及变异分析

发布时间：2021-01-19 10:21

　　在过去的二十年中,我国养禽业经历了快速发展的阶段,规模化、集约化程度进一步提高。1996年,H5N1亚型高致病性禽流感病毒（High Pathogen Avian Influenza Virus, HPAIV）首次出现于广东省。2003年,H5N1亚型HPAIV在亚洲再次暴发,严重影响了养禽业的发展。目前,我国防治HPAIV主要通过大规模疫苗接种以及对病禽进行扑杀和隔离,该策略已经成功地降低了我国HPAIV暴发次数。然而,H5N1亚型AIV一直存在于我国的家禽群中,并给人类健康构成了威胁。因此,我们必须对家禽中的H5N1亚型AIV的流行和基因变异情况进行调查研究。2011年-2012年间,本试验从我国某省的7个地区的家禽交易市场和养殖场采集棉拭子和组织样品共2110份,并运用RT-PCR方法对样品进行H5亚型AIV检测,检测结果表明总的阳性率为7.25%。其中,鸭的阳性率较高,约为14.83%,其次为鸡（3.32%）和鸽子（2.50%）,鹌鹑和鹅的临床样品全部为阴性。再者,我们分析了AIV感染率与季节的关系。与其他季节相比,在春季和秋季采集的样品中AIV阳性率较高,分别为7.50%和7... 

【文章来源】：华中农业大学湖北省 211工程院校 教育部直属院校

【文章页数】：81 页

【学位级别】：硕士

【文章目录】：
摘要
Abstract
缩略语表（Abbreviation）
1 前言
    1.1 禽流感的历史
    1.2 临床症状
    1.3 传播和流行性
    1.4 禽流感病毒的形态和结构
    1.5 禽流感病毒的基因组
    1.6 禽流感病毒基因组的编码产物
        1.6.1 血凝素（Hemagglutinin,HA）
        1.6.2 神经氨酸酶（Neuraminidase,NA）
        1.6.3 核蛋白（Nucleoprptein,NP）
        1.6.4 基质蛋白（Matix proteins,M）
        1.6.5 非结构蛋白（Nonstructural proteins,NS）
        1.6.6 聚合酶蛋白（Polymerase,P）
    1.7 禽流感病毒的抗原性变异
    1.8 禽流感病毒的复制
    1.9 禽流感病毒的分子诊断
        1.9.1 血清学诊断检测技术
        1.9.2 反转录聚合酶链式反应技术
        1.9.3 荧光RT-PCR技术
        1.9.4 转录环介导等温扩增技术（RT-LAMP）
        1.9.5 核酸探针技术
    1.10 禽流感病毒的防治
        1.10.1 综合防治
        1.10.2 药物治疗
        1.10.3 疫苗接种
    1.11 研究的目的和意义
2 材料与方法
    2.1 材料
        2.1.1 样品
        2.1.2 主要试剂及实验仪器
        2.1.3 培养基与抗生素的配制
        2.1.4 禽流感参考毒株
    2.2 方法
        2.2.1 H5亚型禽流感病毒病原检测
        2.2.2 全基因组的基因克隆
3 结果与分析
    3.1 H5亚型禽流感病毒病原检测结果
        3.1.1 样品病原检测
        3.1.2 RT-PCR的扩增
    3.2 基因克隆样品
        3.2.1 病毒分离
        3.2.2 克隆样品
        3.2.3 禽流感病毒扩增电泳图
    3.3 基因序列分析
        3.3.1 HA基因序列分析
        3.3.2 NA基因序列分析
        3.3.3 NS基因序列分析
        3.3.4 M基因序列分析
        3.3.5 NP基因序列分析
        3.3.6 PA基因序列分析
        3.3.7 PB2基因序列分析
        3.3.8 PB1基因序列分析
4 讨论
    4.1 H5亚型禽流感病毒的流行情况
    4.2 H5亚型禽流感检测
    4.3 HA基因的进化分析
    4.4 NA基因的进化分析
    4.5 NS基因的进化分析
    4.6 M、NP、PA、PB1、PB2基因的进化分析
    4.7 5株H5N1亚型禽流感病毒的遗传进化分析
5 结论
参考文献
致谢
硕士期间发表论文情况


【参考文献】：
期刊论文
[1]禽流感病毒及其疫苗研究进展[J]. 王雪莲,袁萍,林淑玲.  新疆畜牧业. 2012(07)
[2]基于颜色判定的环介导逆转录等温扩增技术检测人甲型H1N1流感病毒基因[J]. 聂凯,王大燕,秦萌,高荣保,王淼,邹淑梅,韩峰,赵翔,李希妍,舒跃龙,马学军.  病毒学报. 2010(02)
[3]H5亚型禽流感病毒RT-LAMP快速检测方法的建立[J]. 侯佳蕾,罗开健,樊惠英,焦培荣,亓文宝,曹伟胜,廖明,任涛.  中国兽医科学. 2008(12)
[4]HA基因322位和329位氨基酸对H5N1亚型禽流感病毒毒力的影响[J]. 唐应华,吴培培,孙庆,彭大新,张文俊,李彦芳,汪文斌,龙进学,张评浒,刘秀梵.  病毒学报. 2008(05)
[5]H5亚型禽流感病毒一步法RT-PCR检测方法的建立[J]. 包红梅,王秀荣,刘丽玲,王昱,李一经,陈化兰.  中国生物工程杂志. 2007(05)
[6]神经氨酸酶茎部氨基酸缺失对H5N1亚型禽流感病毒生物学特性的影响[J]. 王曲直,龙进学,胡顺林,吴艳涛,刘秀梵.  微生物学报. 2006(04)
[7]2006年全球禽流感流行形势分析[J]. 高彦生,王冲.  检验检疫科学. 2006(02)
[8]H5N1亚型禽流感病毒NS第263277位核苷酸缺失提高病毒对鸡的致病力[J]. 龙进学,薛峰,彭宜,顾敏,刘秀梵.  微生物学报. 2006(02)
[9]利用反向遗传技术研究H9N2亚型AIV传播途径的分子机制[J]. 石火英,刘秀梵.  微生物学报. 2006(01)
[10]禽流感病毒M2蛋白跨膜区基因的缺失[J]. 李永清,姚四新,韦莉,杨汉春.  中国兽医杂志. 2004(05)



本文编号：2986812