广东省活禽市场外环境重配H3N2亚型禽流感病毒污染调查

发布时间：2021-01-21 19:19

　　目的了解2017-2018年广东省活禽市场外环境中H3N2亚型禽流感病毒的污染和变异情况。方法于2017-2018年在广东省禽流感监测点采集环境样品进行核酸检测,阳性样品接种鸡胚分离病毒并进行全基因组测序,利用相关软件进行生物信息学分析。结果成功获得7株H3N2亚型禽流感病毒,其HA蛋白裂解位点序列均为PEKQTR↓GL,与典型低致病性禽流感病毒的序列特征相符合。其中一分离株NS基因发生D92E干扰素抗性突变。HA蛋白受体结合位点、神经氨酸酶耐药位点、M基因上的金刚烷胺类药物耐药位点、PB2基因上与哺乳动物适应性相关位点等均未发生突变。系统进化分析显示,7株分离株的8个基因片段均处在欧亚禽源分支中,但相互间存在差距。结论 7株分离株中存在5种组合的重配H3N2亚型禽流感病毒,其中1株NS基因发生D92E干扰素抗性突变。因此应加强活禽市场及环境监测,防止产生能在人群中流行的重配H3N2病毒。 

【文章来源】：中国病原生物学杂志. 2020,15(06)北大核心

【文章页数】：8 页

【部分图文】：

NA基因系统进化树

PB2基因进化树(图3)显示,欧亚禽源流感病毒分为两支:C1、C4、C5、C6、C7分离株处于H3亚型禽流感病毒为代表的小分支(H3 Group 1)中,大部分广东地区前期H3N2亚型分离株也属于这一分支;另一分支(Gene Pool)由多种亚型组成,C2、C3分离株处于其中。C1、C4、C5、C6、C7分离株PB1基因分布与其PB2基因分布相似。C2、C3分离株PB1基因(图4)分别处于H5 Group和Gene Pool分支。内部基因PA、NP、NS和M进化树如图5-图8所示。7株分离株所在位置及其分支已在图中标出。

C2、C3分离株PB1基因(图4)分别处于H5 Group和Gene Pool分支。内部基因PA、NP、NS和M进化树如图5-图8所示。7株分离株所在位置及其分支已在图中标出。图5 PA基因系统进化树

【参考文献】：
期刊论文
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硕士论文
[1]两株鸭源H3N2禽流感病毒全基因组序列分析及其致病性研究[D]. 胡涛.吉林农业大学 2013



本文编号：2991745