猪流行性腹泻病毒陕西地方株的分离鉴定及序列分析

发布时间：2021-01-26 03:09

　　为了解陕西地区猪流行性腹泻病毒（PEDV）的遗传进化方向及为疫苗的研发奠定基础,采集陕西省部分地区腹泻仔猪的肠道及内容物,利用Vero细胞进行病原分离,扩增M基因和N基因序列并测序。结果显示病毒盲传5代,细胞出现收缩变圆直至脱落的细胞病变;序列分析结果表明,分离出的PEDV陕西地方株与其他参考毒株M基因核苷酸序列相似性为97.8%～99.7%,氨基酸序列相似性为97.3%～100%;N基因核苷酸序列相似性为95.7%～99.8%,氨基酸序列相似性为99.3%～100%。PEDV陕西分离株与CV777等经典株的亲缘关系较远,与变异株的亲缘关系较近。表明成功分离出PEDV陕西地方株,且均为变异株。 

【文章来源】：动物医学进展. 2020,41(08)北大核心

【文章页数】：5 页

【部分图文】：

不同地区病料中PEDV的RT-PCR结果

图1 不同地区病料中PEDV的RT-PCR结果通过M基因的系统发育树可以看出,分离的3株PEDV陕西地方株与Japan 14JM-216株、Fujian FJ-ZP 2014株、Hebei HBQY/2016株处于同一小支,亲缘关系较近,与CV777经典株的亲缘关系较远(图3 A)。

虽然目前已知PEDV只有1种血清型,但对PEDV的全基因系统发育研究表明,PEDV可以从遗传学上分为经典组(G1)和变异组(G2)。G1是以CV777株为主的PEDV经典株,G2主要是由经典株突变进化而来的突变株[15]。本研究中分离的3株PEDV陕西地方株均属于G2。与CV777经典株相比,3株PEDV分离株在M基因和N基因都有多个氨基酸位点发生突变。在M基因上,只有第214位由疏水性氨基酸突变为亲水性氨基酸,即由丙氨酸(A)突变为丝氨酸(S),其他突变位点亲疏水性未发生改变。在N基因上,除第142(A→T)、241(H→L)、395(L→Q)、397(Q→L)和412(V→S)位点亲疏水性发生改变,其他大部分突变位点亲疏水性未发生改变。这些位点的突变是否会影响B细胞抗原位点和病毒的致病性有待于进一步证实。本研究以陕西部分地区养猪场发生的疑似PED仔猪肠道及内容物为材料,利用Vero F53细胞进行了病原的分离,扩增其M基因和N基因片段,再对其进行全基因测序,结果表明成功分离出榆林、西安和宝鸡PEDV地方株,且均为变异株。该结果对于陕西地区PED的防控提供了参考资料。

【参考文献】：
期刊论文
[1]影响猪流行性腹泻病毒分离培养的因素[J]. 刘太峰,孙明洁,胡桂学.  中国兽医杂志. 2019(05)
[2]2006—2015年甘肃省猪流行性腹泻流行病学分析[J]. 于清磊.  中国动物检疫. 2017(04)

硕士论文
[1]2017-2018年中国部分地区PEDV的遗传演化分析[D]. 霍琳琳.中国农业科学院 2019
[2]猪流行性腹泻病毒的分离鉴定及灭活疫苗的研制[D]. 郭振刚.西北农林科技大学 2019



本文编号：3000361