猫importin基因生物信息分析及其在犬细小病毒感染F81细胞表达的动态变化

发布时间：2021-01-31 19:17

　　试验旨在系统研究猫源不同亚型importin （importinα1、importinα3、importinα4、importinα5、importinα6、importinα7、importinα8和importinβ）基因序列和蛋白基本特性,探讨其在犬细小病毒（canine parvovirus,CPV）感染F81细胞表达的动态变化。本研究利用RT-PCR方法扩增F81细胞中improtin基因全长序列,应用生物学软件预测其氨基酸序列及编码蛋白的结构及功能;进一步利用实时荧光定量RT-PCR技术检测importin基因在CPV感染F81细胞后24、48和72 h表达水平。结果显示,不同亚型importinα基因全长约在1 500 bp,而importinβ基因全长为2 600 bp;预测importin亚型蛋白序列发现,其等电点均在4.60左右,且发现importinα1、importinα5、importinα6、importinα7和importinβ为不稳定蛋白;分析发现这些importin蛋白均无信号肽、无跨膜区、无细胞定位;采用Predictprotein软件预测蛋白二级... 

【文章来源】：中国畜牧兽医. 2020,47(12)北大核心

【文章页数】：9 页

【部分图文】：

总RNA电泳图

以F81细胞cDNA为模板,PCR扩增目的条带,利用1.0%琼脂糖凝胶电泳检验结果,获得的importin α亚型基因约1 500 bp和importin β1基因约2 600 bp的目的条带(图2),与预期大小相符。将PCR扩增产物纯化后连接到pMD18-T克隆载体上,构建18-T-importin S(α1、α3、α4、α5、α6、α7、α8和β1)重组质粒,挑选阳性克隆质粒进行测序验证,与原始相似性100%,将重组质粒分别命名为18-T-importin S。2.3 猫源importin不同亚型蛋白理化性质

表4 猫源importin不同亚型蛋白的二级结构预测Table 4 Secondary structure prediction for the importin subtypes proteins from cat 蛋白Proteins α-螺旋Alpha-helix 无规则卷曲Random coil importin α1 67.49 32.51 importin α3 69.18 30.82 importin α4 68.49 31.51 importin α5 70.43 29.57 importin α6 69.51 30.49 importin α7 69.51 30.49 importin α8 69.46 30.54 importin β 75.11 24.893 讨 论

【参考文献】：
期刊论文
[1]犬细小病毒昆明流行株的分离鉴定与VP2基因序列分析[J]. 赵屹钦,曾梦颖,郭娟,张迪,高洪,严玉霖.  中国畜牧兽医. 2019(01)
[2]犬细小病毒CPV-BJ03/17株分离鉴定及VP2基因遗传进化分析[J]. 王洋,胡博,鲁荣光,吕爽,赵辉,廉士珍,闫喜军.  中国畜牧兽医. 2018(07)
[3]Importin的结构与功能研究进展[J]. 郭建林,徐存拴.  中国细胞生物学学报. 2015(07)



本文编号：3011441