河南奶山羊线粒体D-loop区遗传多态性和遗传分化研究
发布时间：2021-02-09 02:38
为了解河南奶山羊遗传资源现状,对河南奶山羊、萨能奶山羊、关中奶山羊和伏牛白山羊线粒体DNA D-loop区全序列遗传多态性和遗传关系进行分析。结果表明,共存在16种单倍型,各品种单倍型多样度范围为0.391～0.814,核苷酸多样度的范围为0.000 35～0.004 64,核苷酸平均差异数范围为9.333 33～13.666 67,核苷酸岐异度变异范围为0.008 33～0.012 19,遗传分化系数范围为0.135 65～0.360 10,固定系数范围为0.583 23～0.935 50。山羊品种间系统发育树表明,河南奶山羊首先与伏牛白山羊聚为一支,其次河南奶山羊与萨能奶山羊聚类,最后与关中奶山羊聚类。系统发育树聚类结果与遗传距离分析、遗传分化分析结果相符,从遗传角度证实了河南奶山羊是以萨能奶山羊为父本,以河南地方品种为母本经杂交选育而成。
【文章来源】：河南农业大学学报. 2020,54(04)北大核心
【文章页数】：7 页
【部分图文】：
4个山羊品种D-loop序列PCR结果检测
表1 4个山羊品种遗传多样度及单倍型Table 1 Genetic diversity of four goat breeds 品种 Breed 单倍型数目No. of h 单倍型h 单倍型多样度±标准差Hd±SD 核苷酸多样度±标准差Pi±SD 核苷酸平均差异数k 中性检验Tajima’s D 显著性Significance 河南奶山羊Henan dairy goat 9 Hap 4～12 0.814±0.045 0.004 64±0.000 32 5.219 0.190 07 P<0.05 萨能奶山羊Saanen dairy goat 3 Hap 1～3 0.594±0.054 0.002 93±0.000 18 3.290 2.359 87 P>0.1 关中奶山羊Guanzhong dairy goat 2 Hap 13～14 0.429±0.169 0.001 14±0.000 45 1.286 0.457 66 P>0.1 伏牛白山羊Funiu white goat 2 Hap 15～16 0.391±0.091 0.000 35±0.000 08 0.391 0.776 32 P>0.1 总和Total 16 Hap 1～16 0.903±0.013 0.007 50±0.000 24 8.402 0.086 86 P>0.12.3 基因流与遗传分化分析
4个山羊品种间系统发育树(图3)表明,河南奶山羊首先与伏牛白山羊聚为一支,其遗传距离为0.008 553 6;接着河南奶山羊与萨能奶山羊聚类,其遗传距离为0.009 136 8;最后与关中奶山羊聚类,其遗传距离为0.010 649 1。系统发育树聚类结果与遗传距离分析结果相符(表3),证明了河南奶山羊与伏牛白山羊遗传关系最近,接着是萨能奶山羊,离关中奶山羊最远。该结果与遗传分化分析结果一致。3 结论与讨论
【参考文献】：
期刊论文
[1]基于线粒体D-loop序列的长江口中华鲟幼鱼遗传多样性分析[J]. 孙丽婷,赵峰,张涛,纪严,庄平. 海洋渔业. 2019(01)
[2]基于线粒体标记的淮南麻黄鸡遗传结构及其遗传多样性分析[J]. 黄胜海,贾晓旭,陆俊贤,唐修君,樊艳凤,葛庆联,高玉时. 安徽农业大学学报. 2018(03)
[3]云南山羊线粒体DNA遗传多样性与聚类分析[J]. 王国华,郝荣超,杨国忠. 基因组学与应用生物学. 2016(09)
[4]川渝黔地区山羊起源于A和B两母系遗传谱系[J]. 蔡欣,泽让东科,苟兴能,董绍森,刘畅,王雪. 四川大学学报(自然科学版). 2012(04)
[5]新批准的西南地区5个山羊遗传资源mtDNA D-loop遗传多样性与亲缘关系研究[J]. 赵中权,刘小艳,张旭刚,李周权,赵永聚,张家骅. 黑龙江畜牧兽医. 2011(19)
[6]黄河下游同域山羊种群mtDNA D-环多态性及系统发育[J]. 侯磊,王建民,李培培,李珏,邢凤. 中国兽医学报. 2008(12)
[7]贵州山羊遗传多样性及其起源研究[J]. 杨忠诚,吴芸,滕尚辉,刘若余,毛凤显. 山地农业生物学报. 2006(05)
[8]4个引进山羊品种mtDNA控制区序列变异和系统发生关系研究[J]. 张红平,李利,李学伟. 中国畜牧杂志. 2006(09)
[9]动物线粒体DNA多态性的研究概况[J]. 张亚平,施立明. 动物学研究. 1992(03)
博士论文
[1]中国11个山羊品种遗传多样性与起源分化研究[D]. 王杰.西北农林科技大学 2007
[2]采用mtDNA序列研究中国家养山羊的遗传多样性与起源分化[D]. 张红平.四川农业大学 2003
硕士论文
[1]中国奶山羊线粒体DNA D-loop区遗传多样性与起源进化研究[D]. 皮秀霜.山东农业大学 2013
[2]川渝黔6个山羊品种mtDNA D-loop遗传多样性与系统进化研究[D]. 刘小艳.西南大学 2008
[3]中国部分家养山羊mtDNA D环区遗传多样性与进化[D]. 郝荣超.西北农林科技大学 2008
本文编号：3024907
【文章来源】：河南农业大学学报. 2020,54(04)北大核心
【文章页数】：7 页
【部分图文】：
4个山羊品种D-loop序列PCR结果检测
表1 4个山羊品种遗传多样度及单倍型Table 1 Genetic diversity of four goat breeds 品种 Breed 单倍型数目No. of h 单倍型h 单倍型多样度±标准差Hd±SD 核苷酸多样度±标准差Pi±SD 核苷酸平均差异数k 中性检验Tajima’s D 显著性Significance 河南奶山羊Henan dairy goat 9 Hap 4～12 0.814±0.045 0.004 64±0.000 32 5.219 0.190 07 P<0.05 萨能奶山羊Saanen dairy goat 3 Hap 1～3 0.594±0.054 0.002 93±0.000 18 3.290 2.359 87 P>0.1 关中奶山羊Guanzhong dairy goat 2 Hap 13～14 0.429±0.169 0.001 14±0.000 45 1.286 0.457 66 P>0.1 伏牛白山羊Funiu white goat 2 Hap 15～16 0.391±0.091 0.000 35±0.000 08 0.391 0.776 32 P>0.1 总和Total 16 Hap 1～16 0.903±0.013 0.007 50±0.000 24 8.402 0.086 86 P>0.12.3 基因流与遗传分化分析
4个山羊品种间系统发育树(图3)表明,河南奶山羊首先与伏牛白山羊聚为一支,其遗传距离为0.008 553 6;接着河南奶山羊与萨能奶山羊聚类,其遗传距离为0.009 136 8;最后与关中奶山羊聚类,其遗传距离为0.010 649 1。系统发育树聚类结果与遗传距离分析结果相符(表3),证明了河南奶山羊与伏牛白山羊遗传关系最近,接着是萨能奶山羊,离关中奶山羊最远。该结果与遗传分化分析结果一致。3 结论与讨论
【参考文献】：
期刊论文
[1]基于线粒体D-loop序列的长江口中华鲟幼鱼遗传多样性分析[J]. 孙丽婷,赵峰,张涛,纪严,庄平. 海洋渔业. 2019(01)
[2]基于线粒体标记的淮南麻黄鸡遗传结构及其遗传多样性分析[J]. 黄胜海,贾晓旭,陆俊贤,唐修君,樊艳凤,葛庆联,高玉时. 安徽农业大学学报. 2018(03)
[3]云南山羊线粒体DNA遗传多样性与聚类分析[J]. 王国华,郝荣超,杨国忠. 基因组学与应用生物学. 2016(09)
[4]川渝黔地区山羊起源于A和B两母系遗传谱系[J]. 蔡欣,泽让东科,苟兴能,董绍森,刘畅,王雪. 四川大学学报(自然科学版). 2012(04)
[5]新批准的西南地区5个山羊遗传资源mtDNA D-loop遗传多样性与亲缘关系研究[J]. 赵中权,刘小艳,张旭刚,李周权,赵永聚,张家骅. 黑龙江畜牧兽医. 2011(19)
[6]黄河下游同域山羊种群mtDNA D-环多态性及系统发育[J]. 侯磊,王建民,李培培,李珏,邢凤. 中国兽医学报. 2008(12)
[7]贵州山羊遗传多样性及其起源研究[J]. 杨忠诚,吴芸,滕尚辉,刘若余,毛凤显. 山地农业生物学报. 2006(05)
[8]4个引进山羊品种mtDNA控制区序列变异和系统发生关系研究[J]. 张红平,李利,李学伟. 中国畜牧杂志. 2006(09)
[9]动物线粒体DNA多态性的研究概况[J]. 张亚平,施立明. 动物学研究. 1992(03)
博士论文
[1]中国11个山羊品种遗传多样性与起源分化研究[D]. 王杰.西北农林科技大学 2007
[2]采用mtDNA序列研究中国家养山羊的遗传多样性与起源分化[D]. 张红平.四川农业大学 2003
硕士论文
[1]中国奶山羊线粒体DNA D-loop区遗传多样性与起源进化研究[D]. 皮秀霜.山东农业大学 2013
[2]川渝黔6个山羊品种mtDNA D-loop遗传多样性与系统进化研究[D]. 刘小艳.西南大学 2008
[3]中国部分家养山羊mtDNA D环区遗传多样性与进化[D]. 郝荣超.西北农林科技大学 2008
本文编号：3024907
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