柔嫩艾美耳球虫裂殖生殖时期鸡盲肠蛋白质组学和乙酰化修饰蛋白质组学分析
发布时间:2021-03-06 14:21
鸡球虫病是鸡感染艾美耳属球虫后引起的一种肠道疾病,鸡球虫病每年对全世界禽类养殖业造成巨大的损失。目前该病的防治主要依靠化学药物和疫苗,但是抗球虫药的滥用导致的耐药性产生使新药的开发迫在眉睫。鸡球虫生活史复杂,其发育主要经过孢子生殖、裂殖生殖和配子生殖三个阶段。裂殖生殖是鸡球虫的无性生殖阶段,此阶段伴随着球虫裂殖子入侵宿主细胞、在宿主细胞中大量增殖并破坏宿主细胞的过程。球虫在入侵过程中虫体和宿主会在蛋白质水平上出现变化,而蛋白质是生理功能的执行者,对蛋白质结构和功能的研究直接阐明物种生理和病理的变化机制。因此,研究球虫裂殖生殖时期宿主蛋白的变化对阐明球虫的致病机理、发现潜在的药物作用靶点及免疫防治具有重要意义。本研究收集了正常雏鸡盲肠和裂殖生殖时期(E.tenella感染120小时)雏鸡盲肠,盲肠样本经蛋白提取、胰酶酶解、TMT标记、HPLC分级、修饰富集、LC-MS/MS分析、数据库搜索,之后采用蛋白注释、蛋白质功能富集、基于蛋白功能富集的聚类分析和蛋白互作网络分析进行生物信息学分析。蛋白质组学分析结果显示:蛋白质差异表达分析发现717个差异表达蛋白,其中包括373个上调蛋白和344个...
【文章来源】:吉林农业大学吉林省
【文章页数】:81 页
【学位级别】:硕士
【部分图文】:
质谱鉴定到肽段的长度分布
质量和电荷数较高,HCD 碎裂方式不适用。如图 2-4 显布符合一般规律,肽段长度的分布符合质控要求,。图 2-4 质谱鉴定到肽段的长度分布Fig.2-4 Mass spectrometry identified the length distribution of peptid的质量精度正常要求绝大多数图谱的一级质量误差需要在差越小,得分越高。如图 2-5 绝大多数图谱的一级质量误大的质量偏差,说明质谱仪的质量精度正常,不会影响到
图 2-6 质谱数据结果柱状图Fig.2-6 Mass spectrometry Histogram白差异表达分析通过多次全蛋白定量的重复试验,分别得到了每个样本在当 p-value<0.05 时,以差异表达量变化超过 1.5 作为显著 1/1.5 作为显著下调的变化阈值。在 M 组/N 组中我们一共,其中有 373 个是上调蛋白,344 个是下调蛋白(下文比,详见图 2-7。
【参考文献】:
期刊论文
[1]宫颈癌HSPC 238和RPS 27a基因检测的临床意义研究[J]. 刘佳,蔡小凤. 中国计划生育和妇产科. 2018(06)
[2]棕榈酸通过上调脂肪酸转位酶诱导THP-1细胞的炎症反应[J]. 张畅,罗肖肖,晏勇,钟珊,赵蕾. 中国病理生理杂志. 2018(03)
[3]Ras和Sos1蛋白在上皮性卵巢恶性肿瘤组织中的表达及临床意义[J]. 肖正华,令狐华,刘倩芬. 南方医科大学学报. 2016(11)
[4]泛素连接酶Cullin3的研究进展[J]. 李衍辉,梁雅灵,徐勇. 广东医学. 2015(20)
[5]益气活血中药复方对CVB3大鼠心肌细胞感染模型核糖体蛋白L27a表达的影响[J]. 车红花,张明雪,何伟,侯平. 辽宁中医杂志. 2012(09)
[6]CYP2C9*13的研究进展[J]. 张秀华,徐仁爱,胡卢丰,张春红. 中国药师. 2012(09)
[7]弓形虫表观遗传学研究进展[J]. 杨培梁,陈晓光. 中国寄生虫学与寄生虫病杂志. 2012(03)
[8]高浓度D-葡萄糖对早孕绒毛细胞滋养细胞TNF-α、IL-6表达的影响[J]. 黄俊花,李栋,刘媛. 山东医药. 2011(18)
[9]用抑制性消减杂交方法筛选人肾癌相关基因[J]. 王莹,陈葳,李旭. 南方医科大学学报. 2008(01)
[10]核糖体蛋白S24基因在胃癌及其癌前病变中差异表达的研究[J]. 郑洁,周风华,张维铭,刘文天. 癌变.畸变.突变. 2006(04)
博士论文
[1]犬弓形虫急性感染血清中标志蛋白的筛选及其功能与应用研究[D]. 薛俊欣.南京农业大学 2016
[2]NS调节核糖体蛋白合成促进前列腺癌细胞增殖机制的研究[D]. 齐士勇.天津医科大学 2015
[3]牛早期胚胎发育过程中差异表达基因及其作用的研究[D]. 温建勋.内蒙古大学 2012
硕士论文
[1]柔嫩艾美耳球虫感染BHK-21细胞差异蛋白的筛选及特性研究[D]. 赵宗平.中国农业科学院 2018
[2]弓形虫感染后宿主细胞的磷酸化蛋白质组学研究[D]. 陈艾媛.南方医科大学 2014
[3]HtrA1丝氨酸蛋白酶表达对肝癌细胞凋亡和多药耐药的影响[D]. 金雷.苏州大学 2009
本文编号:3067258
【文章来源】:吉林农业大学吉林省
【文章页数】:81 页
【学位级别】:硕士
【部分图文】:
质谱鉴定到肽段的长度分布
质量和电荷数较高,HCD 碎裂方式不适用。如图 2-4 显布符合一般规律,肽段长度的分布符合质控要求,。图 2-4 质谱鉴定到肽段的长度分布Fig.2-4 Mass spectrometry identified the length distribution of peptid的质量精度正常要求绝大多数图谱的一级质量误差需要在差越小,得分越高。如图 2-5 绝大多数图谱的一级质量误大的质量偏差,说明质谱仪的质量精度正常,不会影响到
图 2-6 质谱数据结果柱状图Fig.2-6 Mass spectrometry Histogram白差异表达分析通过多次全蛋白定量的重复试验,分别得到了每个样本在当 p-value<0.05 时,以差异表达量变化超过 1.5 作为显著 1/1.5 作为显著下调的变化阈值。在 M 组/N 组中我们一共,其中有 373 个是上调蛋白,344 个是下调蛋白(下文比,详见图 2-7。
【参考文献】:
期刊论文
[1]宫颈癌HSPC 238和RPS 27a基因检测的临床意义研究[J]. 刘佳,蔡小凤. 中国计划生育和妇产科. 2018(06)
[2]棕榈酸通过上调脂肪酸转位酶诱导THP-1细胞的炎症反应[J]. 张畅,罗肖肖,晏勇,钟珊,赵蕾. 中国病理生理杂志. 2018(03)
[3]Ras和Sos1蛋白在上皮性卵巢恶性肿瘤组织中的表达及临床意义[J]. 肖正华,令狐华,刘倩芬. 南方医科大学学报. 2016(11)
[4]泛素连接酶Cullin3的研究进展[J]. 李衍辉,梁雅灵,徐勇. 广东医学. 2015(20)
[5]益气活血中药复方对CVB3大鼠心肌细胞感染模型核糖体蛋白L27a表达的影响[J]. 车红花,张明雪,何伟,侯平. 辽宁中医杂志. 2012(09)
[6]CYP2C9*13的研究进展[J]. 张秀华,徐仁爱,胡卢丰,张春红. 中国药师. 2012(09)
[7]弓形虫表观遗传学研究进展[J]. 杨培梁,陈晓光. 中国寄生虫学与寄生虫病杂志. 2012(03)
[8]高浓度D-葡萄糖对早孕绒毛细胞滋养细胞TNF-α、IL-6表达的影响[J]. 黄俊花,李栋,刘媛. 山东医药. 2011(18)
[9]用抑制性消减杂交方法筛选人肾癌相关基因[J]. 王莹,陈葳,李旭. 南方医科大学学报. 2008(01)
[10]核糖体蛋白S24基因在胃癌及其癌前病变中差异表达的研究[J]. 郑洁,周风华,张维铭,刘文天. 癌变.畸变.突变. 2006(04)
博士论文
[1]犬弓形虫急性感染血清中标志蛋白的筛选及其功能与应用研究[D]. 薛俊欣.南京农业大学 2016
[2]NS调节核糖体蛋白合成促进前列腺癌细胞增殖机制的研究[D]. 齐士勇.天津医科大学 2015
[3]牛早期胚胎发育过程中差异表达基因及其作用的研究[D]. 温建勋.内蒙古大学 2012
硕士论文
[1]柔嫩艾美耳球虫感染BHK-21细胞差异蛋白的筛选及特性研究[D]. 赵宗平.中国农业科学院 2018
[2]弓形虫感染后宿主细胞的磷酸化蛋白质组学研究[D]. 陈艾媛.南方医科大学 2014
[3]HtrA1丝氨酸蛋白酶表达对肝癌细胞凋亡和多药耐药的影响[D]. 金雷.苏州大学 2009
本文编号:3067258
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