2013—2018年广西地区猪伪狂犬病病毒gB、gE与TK基因遗传变异分析
发布时间：2021-03-10 16:45
为了解广西近年猪伪狂犬病（PR）流行情况及猪伪狂犬病病毒（PRV）流行株gB、gE、TK基因的遗传变异特点,于2013—2018年采集广西各地区疑似PR发病猪靶组织714份,进行PRV的PCR检测及病毒分离鉴定,并运用DNAStar、MEGA 6.0等生物学软件对分离毒株gB、gE、TK基因进行遗传变异分析。结果显示:样品检测阳性率为24.5%（175/714）,共分离获得PRV流行株38株。受检猪群普遍存在PRV感染,经典毒株及变异毒株并存,而且以变异毒株为主。广西流行株不同亚群PRV在gB、gE、TK基因上均存在相同的氨基酸变异特点,与国内变异株亲缘关系较近。推测广西流行株存在两种不同重组变异形式产生的PRV重组毒株,分别为疫苗株gB基因和变异株gE基因重组产生的重组毒株,以及经典株的TK基因被疫苗株（HB98）的TK基因替换而产生的重组毒株。近年广西受检猪场较普遍存在PRV感染,而且PRV流行株以变异毒株为主,可能存在两种不同重组变异形式产生的重组毒株,猪场需重视及实施针对性PR免疫防控计划。
【文章来源】：畜牧兽医学报. 2020,51(04)北大核心
【文章页数】：10 页
【部分图文】：
PRV广西分离株gE基因系统进化树
相关研究表明,gB、gE和TK基因分别对于PRV的感染和复制、细胞融合以及病毒的侵染能力具有极为重要的作用[12, 16, 26]。研究这三个基因的遗传变异特点对于分析PRV流行株变异具有重要意义。为进一步较全面了解广西地区不同时空PRV流行株流行特点、基因变异与遗传演化特点,课题组对2013—2018年于广西各地区采集的疑似PR发病猪靶组织进行PRV检测以及病毒分离鉴定,并对分离流行株gB、gE和TK基因进行克隆测序及遗传变异分析。分离获得38株地方流行毒株,对gB、gE基因的同源性及遗传进化树分析结果表明,广西地区PRV主要流行毒株为变异株且不同亚型毒株之间存在相同的氨基酸变化特点,这些氨基酸位点的变化可以作为区分PRV不同亚型的毒株的分子特征,这与已有的研究结果相符[27-28]。其中,变异株所具有的独特氨基酸位点的变化,其对病毒毒力的改变以及病毒的免疫逃避是否产生影响需要进一步研究验证。对广西PRV流行株的gB、gE基因系统分析研究发现,PRV分离株中2015-LB-2及2015-LB-3毒株的gB基因与疫苗株gB基因相似性较高,而gE基因与变异株gE基因相似性较高,推测其属于国内变异株与疫苗株发生重组产生的变异重组毒株,表明在广西地区PRV变异毒株可能是在疫苗免疫压力的作用下产生的病毒重组毒株,对此需进一步深入研究加以证实。
表3 疑似PR病料组织样品PRV检测结果Table 3 Detection results of tissue samples from suspected clinical specimen 采集时间Time 检测样品数/份Number of samples 阳性样品数/份Number of positive samples 阳性率/%Positive rate 2013 91 23 25.27 2014 130 34 26.15 2015 156 28 17.95 2016 153 53 34.64 2017 184 37 20.11 2018 89 33 37.082.3.1 gB、gE、TK基因的同源性分析
【参考文献】：
期刊论文
[1]一株分离自免疫猪场的伪狂犬病病毒的鉴定与变异分析[J]. 王一鹏,王亚文,徐瑞涛,林依丹,李潭清,宋勤叶. 畜牧兽医学报. 2019(10)
[2]猪伪狂犬病免疫抗体及感染抗体消长规律研究[J]. 赵雪丽,班付国,马震原,王东方,王淑娟,闫若潜. 现代牧业. 2019(01)
[3]江西省猪伪狂犬病原流行病学调查及其gB、gE及TK基因遗传变异分析[J]. 李海琴,康昭风,谭美芳,曾艳兵,季华员. 江西农业大学学报. 2019(02)
[4]江山地区猪伪狂犬的流行现状与防控措施[J]. 王国栋. 畜禽业. 2019(03)
[5]伪狂犬病病毒FS-2015株gE和gB基因序列分析[J]. 庞旋飞,练斯南,伍建敏,万曾培,王征帆,李中圣,白挨泉. 中国畜牧兽医. 2018(12)
[6]2014—2016年豫南地区规模化猪场猪主要病毒性传染病流行病学调查分析[J]. 刘涛,王瑞,曲哲会,董建国,赵瑜,左春生,易本驰,焦凤超,马超锋. 黑龙江畜牧兽医. 2018(20)
[7]猪伪狂犬病病毒流行株遗传进化及序列比对分析[J]. 高泽文,范桂芳,赵婷婷,徐守兴,吴斌. 中国兽医学报. 2018(01)
[8]伪狂犬病毒主要毒力基因的研究进展[J]. 任卫科,池晶晶,李秀丽,鄢明华,张莉. 畜牧兽医科学(电子版). 2017(08)
[9]猪伪狂犬病病毒新流行变异毒株的研究进展[J]. 华利忠,刘剑锋,冯志新,杨若松,邵国青. 江苏农业学报. 2017(02)
[10]PRV变异株的分离及抗原差异性分析[J]. 周春陵,谭鑫,许拓,刘洋,库旭钢,何启盖. 中国兽医学报. 2017(03)
博士论文
[1]Bartha-k61株疫苗对猪伪狂犬病病毒变异株的免疫保护及变异株生物学特性的初步研究[D]. 周金柱.扬州大学 2018
硕士论文
[1]猪伪狂犬病毒GXLB-2015和GXGG-2016毒株的全基因组序列分析和生物学特性研究[D]. 秦树英.广西大学 2017
[2]猪伪狂犬病病毒HeN1株全基因组测序与病毒遗传变异分析[D]. 叶超.中国农业科学院 2015
[3]山东省免疫猪场猪伪狂犬病毒分离鉴定及gE、gC、gD和TK基因的序列分析[D]. 陈超.山东农业大学 2015
[4]猪伪狂犬病病毒变异株的分离鉴定及其生物学特性的研究[D]. 赵鸿远.中国农业科学院 2014
[5]变异猪伪狂犬病毒的分离鉴定及生物学特性分析[D]. 张青占.中国农业科学院 2013
本文编号：3074951
【文章来源】：畜牧兽医学报. 2020,51(04)北大核心
【文章页数】：10 页
【部分图文】：
PRV广西分离株gE基因系统进化树
相关研究表明,gB、gE和TK基因分别对于PRV的感染和复制、细胞融合以及病毒的侵染能力具有极为重要的作用[12, 16, 26]。研究这三个基因的遗传变异特点对于分析PRV流行株变异具有重要意义。为进一步较全面了解广西地区不同时空PRV流行株流行特点、基因变异与遗传演化特点,课题组对2013—2018年于广西各地区采集的疑似PR发病猪靶组织进行PRV检测以及病毒分离鉴定,并对分离流行株gB、gE和TK基因进行克隆测序及遗传变异分析。分离获得38株地方流行毒株,对gB、gE基因的同源性及遗传进化树分析结果表明,广西地区PRV主要流行毒株为变异株且不同亚型毒株之间存在相同的氨基酸变化特点,这些氨基酸位点的变化可以作为区分PRV不同亚型的毒株的分子特征,这与已有的研究结果相符[27-28]。其中,变异株所具有的独特氨基酸位点的变化,其对病毒毒力的改变以及病毒的免疫逃避是否产生影响需要进一步研究验证。对广西PRV流行株的gB、gE基因系统分析研究发现,PRV分离株中2015-LB-2及2015-LB-3毒株的gB基因与疫苗株gB基因相似性较高,而gE基因与变异株gE基因相似性较高,推测其属于国内变异株与疫苗株发生重组产生的变异重组毒株,表明在广西地区PRV变异毒株可能是在疫苗免疫压力的作用下产生的病毒重组毒株,对此需进一步深入研究加以证实。
表3 疑似PR病料组织样品PRV检测结果Table 3 Detection results of tissue samples from suspected clinical specimen 采集时间Time 检测样品数/份Number of samples 阳性样品数/份Number of positive samples 阳性率/%Positive rate 2013 91 23 25.27 2014 130 34 26.15 2015 156 28 17.95 2016 153 53 34.64 2017 184 37 20.11 2018 89 33 37.082.3.1 gB、gE、TK基因的同源性分析
【参考文献】：
期刊论文
[1]一株分离自免疫猪场的伪狂犬病病毒的鉴定与变异分析[J]. 王一鹏,王亚文,徐瑞涛,林依丹,李潭清,宋勤叶. 畜牧兽医学报. 2019(10)
[2]猪伪狂犬病免疫抗体及感染抗体消长规律研究[J]. 赵雪丽,班付国,马震原,王东方,王淑娟,闫若潜. 现代牧业. 2019(01)
[3]江西省猪伪狂犬病原流行病学调查及其gB、gE及TK基因遗传变异分析[J]. 李海琴,康昭风,谭美芳,曾艳兵,季华员. 江西农业大学学报. 2019(02)
[4]江山地区猪伪狂犬的流行现状与防控措施[J]. 王国栋. 畜禽业. 2019(03)
[5]伪狂犬病病毒FS-2015株gE和gB基因序列分析[J]. 庞旋飞,练斯南,伍建敏,万曾培,王征帆,李中圣,白挨泉. 中国畜牧兽医. 2018(12)
[6]2014—2016年豫南地区规模化猪场猪主要病毒性传染病流行病学调查分析[J]. 刘涛,王瑞,曲哲会,董建国,赵瑜,左春生,易本驰,焦凤超,马超锋. 黑龙江畜牧兽医. 2018(20)
[7]猪伪狂犬病病毒流行株遗传进化及序列比对分析[J]. 高泽文,范桂芳,赵婷婷,徐守兴,吴斌. 中国兽医学报. 2018(01)
[8]伪狂犬病毒主要毒力基因的研究进展[J]. 任卫科,池晶晶,李秀丽,鄢明华,张莉. 畜牧兽医科学(电子版). 2017(08)
[9]猪伪狂犬病病毒新流行变异毒株的研究进展[J]. 华利忠,刘剑锋,冯志新,杨若松,邵国青. 江苏农业学报. 2017(02)
[10]PRV变异株的分离及抗原差异性分析[J]. 周春陵,谭鑫,许拓,刘洋,库旭钢,何启盖. 中国兽医学报. 2017(03)
博士论文
[1]Bartha-k61株疫苗对猪伪狂犬病病毒变异株的免疫保护及变异株生物学特性的初步研究[D]. 周金柱.扬州大学 2018
硕士论文
[1]猪伪狂犬病毒GXLB-2015和GXGG-2016毒株的全基因组序列分析和生物学特性研究[D]. 秦树英.广西大学 2017
[2]猪伪狂犬病病毒HeN1株全基因组测序与病毒遗传变异分析[D]. 叶超.中国农业科学院 2015
[3]山东省免疫猪场猪伪狂犬病毒分离鉴定及gE、gC、gD和TK基因的序列分析[D]. 陈超.山东农业大学 2015
[4]猪伪狂犬病病毒变异株的分离鉴定及其生物学特性的研究[D]. 赵鸿远.中国农业科学院 2014
[5]变异猪伪狂犬病毒的分离鉴定及生物学特性分析[D]. 张青占.中国农业科学院 2013
本文编号：3074951
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