绵羊Lpin1基因的克
发布时间:2021-03-15 08:50
脂素助in1基因在机体的脂肪代谢中发挥着重要的作用,不仅可以作为磷脂酸磷酸酶(phosphatidate phosphatase, PAP)直接参与甘油脂类和磷脂的合成,而且可以作为转录辅活化因子,间接调节脂类代谢相关基因的表达。通过研究LpinI基因的结构、遗传变异、表达及其与相关性状的相关性,有利于深入的了解机体内脂肪代谢的机制。不同尾脂型绵羊机体脂肪代谢的途径可能不同。但是,目前关于绵羊Lpinl基因的核酸序列、分子结构、遗传变异和表达的研究未见报道。本研究从DNA.mRNA和蛋白质3个水平对绵羊Lpinl基因的结构、多态性、mRNA及蛋白质的表达及其与性状的关联进行了研究。利用RT-PCR技术克隆绵羊Lpinl基因的编码区序列(coding sequence, CDS),并对CDS及编码的氨基酸序列进行生物信息学分析。以不同脂尾型绵羊(广灵大尾羊和小尾寒羊)共96个个体为研究对象,利用PCR-SSCP技术检测绵羊Lpinl基因的5’调控区序列的多态性,并将其基因型与两品种绵羊的尾型性状及屠宰性状进行关联研究。利用Real-time PCR技术和Western blotting技...
【文章来源】:山西农业大学山西省
【文章页数】:110 页
【学位级别】:硕士
【部分图文】:
Lipins蛋白的结构和功能序列(自文献[24bStructureandfunctionsequenceofLipinsprotein(Afterliterature[20})
数的酶都分布在内质网膜或线粒体上129],但是通过对HeLaM、3T3-U和HEK293等各种细胞的研究发现,Lipinl蛋白可以分布于细胞装、内质网膜及细胞核3个区室中…5],且Lipinl在胞衆/内质网膜及胞菜/细胞核间的易位受蛋白质翻译后修饰、原核定位信号序列以及蛋白质与蛋白质间互作的影响l3G]。蛋白质的翻译后修饰能够影响Lipinl蛋白的亚细胞定位(图1-2)。胰岛素和氨基酸可以分别通过磷脂醜肌醇-3-激酵(phosphatidyl inositol - 3 - kinase activity, P13K)和哺乳动物类雷帕霉素蛋0 (mammalian target of rapamycin, mTOR)信号途径诱导Lipinl发生憐酸化作用,从而使Lipinl从细胞衆转移至内质网膜上执行其PAP的功能。油酸和肾上腺素则具有相反的作用,能够使Lipin-]发生脱憐酸化作用,进而脱离内质网膜t27-3、有丝分裂也可以诱导Lipinl蛋白憐酸化进而由细胞衆易位至内质网膜上述这些研究表明,Lipinl的憐酸化修饰可以影响其在胞装内与内质网膜间的易位。Lipinl的小泛素相关修饰(small ubiquitin-related modifier, SUMO)能够诱导该蛋白从细胞衆转移至细胞核中,发挥其转录辅活化因子的作用。进一步的研究表明,Lipinl的该效应主要是由Lipinl-a的SUMO化修饰引起的,而Lipinl-p SUMO化修饰的具体功能未知132]。
和 NetPhos 2_0[丨(http://www.cbs.dtu. dk/services/)在线软件预测用 NCBI 的 CDD (http://www.ncbi.nlm.nih.gov/Stmcture/cdd/wrpsb.c结构域118]。列相似性通过NCBI中的BLAST功能进行比对。MEGA5软件II9]的基于遗传距离的邻接法对13个不同物种基进化树。13个物种Z/7//7/基因的蛋白质和mRNA序列信息见表2-2。分析周脂肪组织总RNA的绵羊肾周脂肪组织的总RNA经ND-100核酸蛋白测定仪测定后,700ng/^iL,OD26o/28()均在1.8?2.0之间,表明RNA浓度及纯度较的要求。另取5 [iL进行电泳检测,28S rRNA和18S rRNA的泳带取的脂肪组织的RNA质量较好(图2-〗),可用作后续cDNA第
【参考文献】:
期刊论文
[1]LIPIN1基因的结构、功能与表达调控研究进展[J]. 束刚,蔡晗,江青艳. 畜牧与兽医. 2012(S1)
[2]鸡Lpin1基因3′-UTR遗传变异及其对miRNA结合位点的潜在效应[J]. 李素雅,张建宏,陈文,黄艳群,孙桂荣,韩瑞丽,康相涛. 中国农业科学. 2012(08)
[3]Lpin1基因多态性与黄牛经济性状的关联研究[J]. 卫利选,常振华,何诚,郭本玲,蓝贤勇,陈宏,雷初朝. 西北农业学报. 2012(01)
[4]蛋白质翻译后修饰研究进展[J]. 郭会灿. 生物技术通报. 2011(07)
[5]Western blot检测家兔动脉组织蛋白质表达条件的优化[J]. 马艳琴,孙子龙,王彬,郭超,陈鹏晓. 农学学报. 2011(06)
[6]6个猪群Lpin1基因多态性分析[J]. 戈新,邢晋祎,刘忠琛,王建华,李培培,张宝. 西南农业学报. 2011(01)
[7]PCR-SSCP技术在微生物检测中的应用[J]. 顾真庆,冯志新,王占伟,刘茂军,王海燕,白昀,邵国青. 生物技术通报. 2011(02)
[8]鸡Lpin1基因c.1727C>T位点遗传变异及其与脂肪沉积性状的关联分析[J]. 王伯君,孙玲,黎绍波,朱志明,刘榜. 畜牧兽医学报. 2010(09)
[9]PCR-SSCP技术在基因多态分析中的应用[J]. 汤贤春,路健,李学英. 中国西部科技. 2010(06)
[10]如何正确估计蛋白质SDS聚丙烯酰胺凝胶电泳的样品加样量[J]. 高重天,孙群. 生物学通报. 2009(03)
硕士论文
[1]鸡Lpin2基因的时空表达特性及其遗传变异与性状的关联分析[D]. 张彩霞.河南农业大学 2011
[2]鸡LPIN1基因多态与固始鸡资源群性状的关联研究[D]. 王润之.河南农业大学 2010
本文编号:3083905
【文章来源】:山西农业大学山西省
【文章页数】:110 页
【学位级别】:硕士
【部分图文】:
Lipins蛋白的结构和功能序列(自文献[24bStructureandfunctionsequenceofLipinsprotein(Afterliterature[20})
数的酶都分布在内质网膜或线粒体上129],但是通过对HeLaM、3T3-U和HEK293等各种细胞的研究发现,Lipinl蛋白可以分布于细胞装、内质网膜及细胞核3个区室中…5],且Lipinl在胞衆/内质网膜及胞菜/细胞核间的易位受蛋白质翻译后修饰、原核定位信号序列以及蛋白质与蛋白质间互作的影响l3G]。蛋白质的翻译后修饰能够影响Lipinl蛋白的亚细胞定位(图1-2)。胰岛素和氨基酸可以分别通过磷脂醜肌醇-3-激酵(phosphatidyl inositol - 3 - kinase activity, P13K)和哺乳动物类雷帕霉素蛋0 (mammalian target of rapamycin, mTOR)信号途径诱导Lipinl发生憐酸化作用,从而使Lipinl从细胞衆转移至内质网膜上执行其PAP的功能。油酸和肾上腺素则具有相反的作用,能够使Lipin-]发生脱憐酸化作用,进而脱离内质网膜t27-3、有丝分裂也可以诱导Lipinl蛋白憐酸化进而由细胞衆易位至内质网膜上述这些研究表明,Lipinl的憐酸化修饰可以影响其在胞装内与内质网膜间的易位。Lipinl的小泛素相关修饰(small ubiquitin-related modifier, SUMO)能够诱导该蛋白从细胞衆转移至细胞核中,发挥其转录辅活化因子的作用。进一步的研究表明,Lipinl的该效应主要是由Lipinl-a的SUMO化修饰引起的,而Lipinl-p SUMO化修饰的具体功能未知132]。
和 NetPhos 2_0[丨(http://www.cbs.dtu. dk/services/)在线软件预测用 NCBI 的 CDD (http://www.ncbi.nlm.nih.gov/Stmcture/cdd/wrpsb.c结构域118]。列相似性通过NCBI中的BLAST功能进行比对。MEGA5软件II9]的基于遗传距离的邻接法对13个不同物种基进化树。13个物种Z/7//7/基因的蛋白质和mRNA序列信息见表2-2。分析周脂肪组织总RNA的绵羊肾周脂肪组织的总RNA经ND-100核酸蛋白测定仪测定后,700ng/^iL,OD26o/28()均在1.8?2.0之间,表明RNA浓度及纯度较的要求。另取5 [iL进行电泳检测,28S rRNA和18S rRNA的泳带取的脂肪组织的RNA质量较好(图2-〗),可用作后续cDNA第
【参考文献】:
期刊论文
[1]LIPIN1基因的结构、功能与表达调控研究进展[J]. 束刚,蔡晗,江青艳. 畜牧与兽医. 2012(S1)
[2]鸡Lpin1基因3′-UTR遗传变异及其对miRNA结合位点的潜在效应[J]. 李素雅,张建宏,陈文,黄艳群,孙桂荣,韩瑞丽,康相涛. 中国农业科学. 2012(08)
[3]Lpin1基因多态性与黄牛经济性状的关联研究[J]. 卫利选,常振华,何诚,郭本玲,蓝贤勇,陈宏,雷初朝. 西北农业学报. 2012(01)
[4]蛋白质翻译后修饰研究进展[J]. 郭会灿. 生物技术通报. 2011(07)
[5]Western blot检测家兔动脉组织蛋白质表达条件的优化[J]. 马艳琴,孙子龙,王彬,郭超,陈鹏晓. 农学学报. 2011(06)
[6]6个猪群Lpin1基因多态性分析[J]. 戈新,邢晋祎,刘忠琛,王建华,李培培,张宝. 西南农业学报. 2011(01)
[7]PCR-SSCP技术在微生物检测中的应用[J]. 顾真庆,冯志新,王占伟,刘茂军,王海燕,白昀,邵国青. 生物技术通报. 2011(02)
[8]鸡Lpin1基因c.1727C>T位点遗传变异及其与脂肪沉积性状的关联分析[J]. 王伯君,孙玲,黎绍波,朱志明,刘榜. 畜牧兽医学报. 2010(09)
[9]PCR-SSCP技术在基因多态分析中的应用[J]. 汤贤春,路健,李学英. 中国西部科技. 2010(06)
[10]如何正确估计蛋白质SDS聚丙烯酰胺凝胶电泳的样品加样量[J]. 高重天,孙群. 生物学通报. 2009(03)
硕士论文
[1]鸡Lpin2基因的时空表达特性及其遗传变异与性状的关联分析[D]. 张彩霞.河南农业大学 2011
[2]鸡LPIN1基因多态与固始鸡资源群性状的关联研究[D]. 王润之.河南农业大学 2010
本文编号:3083905
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