原始生殖细胞关键基因CC2EIP的生物信息学分析

发布时间：2021-03-27 14:47

　　为了对前期高通量测序结果筛选获得的鸡原始生殖细胞（PGCs）特异表达的未知转录本（C2EIP）进行系统的功能注释,试验通过PCR技术克隆C2EIP全长,并结合生物信息学技术对C2EIP的理化性质进行系统分析。结果显示:通过PCR成功克隆C2EIP全长,为714 bp,测序比对结果准确。生物信息学分析表明:C2EIP主要在细胞质中表达,存在磷酸化和糖基化位点,在生物进化过程中物种间保守性较差,禽类中保守性较高;C2EIP具有泛素化连接酶E3和磷酸化雷帕霉素靶蛋白复合体功能。试验结果为进一步研究C2EIP的功能和分子机制奠定了理论基础。 

【文章来源】：中国家禽. 2020,42(10)北大核心

【文章页数】：5 页

【部分图文】：

C2EIP蛋白二级、三级结构分析

C2EIP疏水性预测结果

蛋白功能结构域是蛋白行使功能的基础和前提，为了进一步预测C2EIP蛋白可能行使的功能，通过Smart软件对C2EIP蛋白进行功能结构域预测，预测结果发现C2EIP在第23～76位氨基酸处存在泛素化酶Cμllin功能域，推测C2EIP具有泛素化连接酶E3功能，调节相关蛋白泛素化修饰；同时在第106～183位氨基酸存在磷酸化雷帕霉素靶蛋白复合体，具有调节相关蛋白磷酸化修饰功能（见图5）。图5 C2EIP蛋白功能结构域预测

【参考文献】：
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本文编号：3103690