鸡CPT1A基因的生物信息学分析和组织表达谱构建

发布时间：2021-04-05 06:30

　　旨在探索鸡肉碱棕榈酰转移酶1A（CPT1A）基因的生物学特征,研究其表达的组织和时空差异。通过生物信息学软件对CPT1A序列进行分析和功能预测,利用荧光定量PCR技术检测该基因在12周固始鸡腹脂、皮脂、胸肌、腿肌和肝中的表达量,以及在不同时期（6周,12周,22周和30周）固始鸡胸肌中的表达量。结果显示,鸡CPT1A蛋白无信号肽,有两个跨膜结构域。鸡与斑马鱼CPT1A基因的亲缘关系最远,与小鼠、人、猪、山羊、奶牛的亲缘关系较近。CPT1A基因在12周固始鸡肝脏组织中表达量最高,胸肌和腿肌次之,腹脂和皮脂中表达量较低,在不同发育阶段中固始鸡胸肌中表达量相对较高的为12周和6周,22周次之,30周则表达量最低。试验结果为进一步研究鸡CPT1A基因调控鸡脂质代谢的分子机制提供理论基础。 

【文章来源】：畜牧与兽医. 2020,52(12)北大核心

【文章页数】：6 页

【部分图文】：

鸡CPT1A蛋白亲/疏水性和跨膜结构域分析

SPOMA预测结果见图2A。鸡CPT1A蛋白主要是由α-螺旋(49.48%),β-折叠(5.19 %),延伸链(11.56 %)和无规则卷曲(33.77 %)组成。通过Phyre 2预测该蛋白的三级结构结果见图2B。2.3 鸡CPT1A蛋白功能结构域、蛋白互作以及代谢通路预测分析

蛋白互作图见图3B。鸡CPT1A蛋白可能与长链脂酰辅酶A合成酶家族(ACSLs)、长链脂肪酸-辅酶A连接酶家族(ACSBGs)、CPT2以及脂酰辅酶A氧化酶1(ACOX1)存在相互作用;预测显示该蛋白可能参与的代谢通路为脂肪酸代谢,PPAR信号通路和脂肪细胞因子信号通路。2.4 CPT1A基因系统进化树的构建

【参考文献】：
期刊论文
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博士论文
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本文编号：3119319