中国和尼日利亚棘球绦虫流行株的遗传变异研究

发布时间：2021-04-14 15:27

　　囊型棘球蚴病（cystic echinococcosis,CE）俗称囊型包虫病,是一种世界范围内分布的人畜共患寄生虫病,在亚洲、南美洲、欧洲和非洲（尤其是北非和东非）高度流行。因受包虫感染的器官被废弃和包虫病患者的治疗费用,CE造成了巨大的经济损失。在人类和家畜,CE主要由细粒棘球绦虫广义种（Echinococcus granulosus sensu lato）引起。基于线粒体（mitochondrial,mt）基因（组）的多态性研究是将一系列遗传关系相近的虫种（虫株）归为“基因型”。线粒体基因遗传差异或多态性影响虫种/基因型对宿主的偏好性及其感染性等。因此,了解某一特定地点寄生宿主的虫种及其基因型的特性,对于理解和预测疫病的发展动态是非常有价值的,并且可以指导有效防控方案的制定。本研究调查了中国西藏自治区（Tibet Autonomous Region,TAR）4个县细粒棘球绦虫广义种的虫种多样性和遗传变异特点,并首次对导致尼日利亚CE的细粒棘球绦虫广义种的虫种/基因型进行了研究与分析。本项研究还筛选了用于棘球绦虫虫种鉴定的微卫星标记,这对进一步分析棘球绦虫种内和种间遗传变异规律有潜... 

【文章来源】：中国农业科学院北京市

【文章页数】：125 页

【学位级别】：博士

【部分图文】：

细粒棘球绦虫的生活史Fig.1-1LifecycleofEchinococcusgranulosussensulato(https://www.cdc.gov/dpdx/echinococcosis/index.html)

中国农业科学院博士学位论文CHAPTERIGeneralIntroductionandReviewofLiterature8图1-2中间宿主家畜中的泡型棘球蚴病的全球分布Fig.1-2Globaldistributionofcysticechinococcosisinthemaindomesticintermediatehosts(CEcausedbythecervidgenotypesofEchinococcuscanadensisandEchinococcusequinusarenotincluded)(Deplazesetal.,2017)

中国农业科学院博士学位论文CHAPTERIIGeneticdiversityofEchinococcusinTAR,China25designedprimers(Wuetal.,2018)andnewlydesignedcomplementaryprimers(AppendixB:TableB-1).EachPCRreactionyieldedasinglebanddetectedina1.5%(w/v)agarosegelstainedwithGelRed(Biotium,Fremont,USA)(seeAppendixA,Fig.A-1,A-2).FivemicrolitersoftheampliconwereusedforvisualizationwhiletherestwereusedforsequencinginanABI3730XlDNAAnalyser(TsinqkeBiologicalTechnology,Beijing,China).图2-1中国西藏自治区的研究区域Fig.2-1MapoftheTibetAutonomousRegionofChinashowingthestudyarea2.2.4MolecularandphylogeneticanalysisFollowingsequencing,thenucleotidesequenceswereviewedandmanuallycorrectedforanymisreadnucleotidebycomparingthechromatogramfilewiththeresultingsequencesusingUniproUGENEv1.29.0softwareandBioEdit(Hall,1999).ThesequencesofthecompletemtgenomewereassembledstepwisewiththehelpofDNAStarv7.1program,BioEdit,andUniproUGENEv1.29.0softwarewhilemakingsurethattheoverlapsequenceswereidentical.ThefinalsequenceswerealignedwithBioEdit(Hall,1999).Theprotein-encodinggenesandrRNAsofthecompletemtgenomewereannotatedusingGeSeq(Tillichetal.,2017);tRNAswereidentifiedusingtRNAscan-SEv2.0.3and/orbyaBLASTsearchagainstanE.canadensisgenotypeG6mtgenomesequenceavailableinGenBank(GenBank:AB208063).Theidentityoftheisolatesviatheirnucleotidesequenceswasassessedusingthe

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本文编号：3137560