氧化应激对猪肝脏转录组表达特征和肉品质的影响
发布时间：2021-04-17 19:28
应激是现代养猪生产中影响猪生长性能等性状的重要因素,而氧化应激又是众多应激中比较常见的一种类型。氧化应激通过影响猪机体的相关基因和长链非编码RNA（long noncoding RNA,lncRNA）的表达调控,造成机体组织的氧化损伤,引起各种机能和代谢的变化,使其处于亚健康状态,降低生产性能。猪机体可以利用自身的抗氧化系统来消除氧化应激产生的负面作用;猪屠宰后胴体的抗氧化酶可以维持肌肉氧化还原状态的稳衡。那么,氧化应激导致猪肝脏组织中lncRNA和基因发生异常表达,以及利用宰后24h的pH值（即终点pH,pHu）评估胴体肌肉的抗氧化性状等内容未见研究报道。因此,本研究首先以长白猪断奶仔猪为试验动物,利用Diquat（DQ）构建断奶仔猪的氧化应激模型,探讨氧化应激条件下断奶仔猪肝脏组织转录组的表达特征;然后,通过对胴体肌肉抗氧化性状与pHu的相关性分析,以及不同pHu分组对抗氧化酶活性及其基因的表达量的影响,建立胴体肌肉抗氧化性状与pHu之间的评估关系。主要研究内容及结果如下:1、对氧化应激组断奶仔猪进行腹腔注射10 mg/kg体重DQ后,仔猪表现出呕吐、食欲下降,并伴随直肠温度显著升...
【文章来源】：山东农业大学山东省
【文章页数】：94 页
【学位级别】：博士
【部分图文】：
lncRNA的分类（引自Maetal,2013）
10图 1-2 长链非编码 RNA（lncRNA）或不同种类的 lncRNA 在生物发生、成熟和降解的不点被差异调控（引自 Quinn & Chang, 2016）Fig.1-2 Some long non-coding RNAs (lncRNAs) or classes of lncRNAs are regulated differentialdifferent points of their biogenesis, maturation and degradation (citated from Quinn & Chang, 201.3.2 氧化应激相关的 mRNA（1）Nrf2 基因
图 2-1 lncRNA 序列生物信息学分析Figure 2-1 The bioinformatic analysis for lncRNA sequencing据生物信息学分析a Hiseq 得到的原始图像数据文件经 CASAVA 碱基识别(Base测序序列(Sequenced Reads)，我们称之为 Raw Data 或 Raw Re称为 fq）文件格式存储，其中包含测序序列（reads）的序列信量信息。对测序的原始数据通过 FastQC 进行质量评估。ic 进行质量剪切，得到相对准确的有效数据。NA-seq 测序评估ISAT2将样本有效数据比对到参考基因组上，统计Mapping信息果进行冗余序列分析、插入片段分布等分析。采用 Qualimap 根分布检查、基因组结构分布等分析。利用 BEDTools 进行基因覆上测序序列分布等分析。
【参考文献】：
期刊论文
[1]氧化应激对断奶仔猪的影响及营养的调控作用[J]. 钟琴,陈代文,余冰,郑萍. 动物营养学报. 2019(05)
[2]壳寡糖对氧化应激仔猪生长性能、抗氧化能力及空肠养分消化和转运能力的影响[J]. 田刚,黄琳惠,宋晓华,陈代文,毛湘冰,虞洁,郑萍,何军,余冰. 动物营养学报. 2018(07)
[3]高精料对泌乳奶山羊瘤胃上皮氧化应激和胆固醇代谢的影响[J]. 耿雅丽,田平,罗燕文,华灿枫,陶诗煜,田靖,倪迎冬. 草业学报. 2017(11)
[4]氧化应激对动物肠道的危害及其营养学缓解措施[J]. 韩月,黄友解,王友明. 上海畜牧兽医通讯. 2017(04)
[5]氧化应激与衰老研究进展[J]. 原慧萍,杨泽. 中国老年保健医学. 2015(05)
[6]核因子E2相关因子2调控机体抗氧化途径特性及其与畜禽的健康和肉品质的关系[J]. 林谦,邱磊,云龙,曹蓉,贺喜,侯德兴. 动物营养学报. 2014(06)
[7]Keap1/Nrf2/ARE通路相关基因在热诱导的氧化应激小鼠肝脏中的表达[J]. 王菲,黄毅,李延森,曹云,普少瑕,李春梅. 中国生物化学与分子生物学报. 2014(03)
[8]热应激对奶山羊生产性能及瘤胃上皮细胞形态结构的影响[J]. 马燕芬,杜瑞平,高民. 中国农业科学. 2013(21)
[9]葡萄籽原花青素及维生素E对氧化应激仔猪生长性能、血清氧化还原状态和肝脏氧化损伤的影响[J]. 赵娇,周招洪,梁小芳,毛湘冰,陈代文,余冰. 中国农业科学. 2013(19)
[10]有氧运动对酒精性肝损伤小鼠ALT、AST、IL-10和IL-6等的影响[J]. 蔡文丽,张慧,唐选,牛英鹏. 沈阳体育学院学报. 2013(03)
博士论文
[1]约克夏猪和金华猪甲状腺组织mRNA、lncRNA和miRNA测序及功能分析[D]. 沈一飞.浙江大学 2016
[2]氧化应激对仔猪精氨酸代谢和需求特点的影响及机制研究[D]. 郑萍.四川农业大学 2010
[3]仔猪氧化应激及硒的抗应激效应和机理的研究[D]. 袁施彬.四川农业大学 2007
硕士论文
[1]日粮添加L-茶氨酸对断奶仔猪的抗应激效果研究[D]. 刘通.西北农林科技大学 2016
[2]葡萄籽提取物减缓西杂肉牛空肠上皮细胞热应激反应的功能与机制研究[D]. 朱旺.西南大学 2015
[3]奶牛肢蹄病患牛体内矿物元素和氧化应激指标的变化[D]. 李忠鹏.山东农业大学 2014
[4]猪CuZnSOD基因的克隆、mRNA表达及其对肉质抗氧化性能的影响[D]. 杜金芳.山东农业大学 2011
[5]猪氧化应激模型构建以及茶多酚的抗应激效应的研究[D]. 徐静.四川农业大学 2009
本文编号：3144012
【文章来源】：山东农业大学山东省
【文章页数】：94 页
【学位级别】：博士
【部分图文】：
lncRNA的分类（引自Maetal,2013）
10图 1-2 长链非编码 RNA（lncRNA）或不同种类的 lncRNA 在生物发生、成熟和降解的不点被差异调控（引自 Quinn & Chang, 2016）Fig.1-2 Some long non-coding RNAs (lncRNAs) or classes of lncRNAs are regulated differentialdifferent points of their biogenesis, maturation and degradation (citated from Quinn & Chang, 201.3.2 氧化应激相关的 mRNA（1）Nrf2 基因
图 2-1 lncRNA 序列生物信息学分析Figure 2-1 The bioinformatic analysis for lncRNA sequencing据生物信息学分析a Hiseq 得到的原始图像数据文件经 CASAVA 碱基识别(Base测序序列(Sequenced Reads)，我们称之为 Raw Data 或 Raw Re称为 fq）文件格式存储，其中包含测序序列（reads）的序列信量信息。对测序的原始数据通过 FastQC 进行质量评估。ic 进行质量剪切，得到相对准确的有效数据。NA-seq 测序评估ISAT2将样本有效数据比对到参考基因组上，统计Mapping信息果进行冗余序列分析、插入片段分布等分析。采用 Qualimap 根分布检查、基因组结构分布等分析。利用 BEDTools 进行基因覆上测序序列分布等分析。
【参考文献】：
期刊论文
[1]氧化应激对断奶仔猪的影响及营养的调控作用[J]. 钟琴,陈代文,余冰,郑萍. 动物营养学报. 2019(05)
[2]壳寡糖对氧化应激仔猪生长性能、抗氧化能力及空肠养分消化和转运能力的影响[J]. 田刚,黄琳惠,宋晓华,陈代文,毛湘冰,虞洁,郑萍,何军,余冰. 动物营养学报. 2018(07)
[3]高精料对泌乳奶山羊瘤胃上皮氧化应激和胆固醇代谢的影响[J]. 耿雅丽,田平,罗燕文,华灿枫,陶诗煜,田靖,倪迎冬. 草业学报. 2017(11)
[4]氧化应激对动物肠道的危害及其营养学缓解措施[J]. 韩月,黄友解,王友明. 上海畜牧兽医通讯. 2017(04)
[5]氧化应激与衰老研究进展[J]. 原慧萍,杨泽. 中国老年保健医学. 2015(05)
[6]核因子E2相关因子2调控机体抗氧化途径特性及其与畜禽的健康和肉品质的关系[J]. 林谦,邱磊,云龙,曹蓉,贺喜,侯德兴. 动物营养学报. 2014(06)
[7]Keap1/Nrf2/ARE通路相关基因在热诱导的氧化应激小鼠肝脏中的表达[J]. 王菲,黄毅,李延森,曹云,普少瑕,李春梅. 中国生物化学与分子生物学报. 2014(03)
[8]热应激对奶山羊生产性能及瘤胃上皮细胞形态结构的影响[J]. 马燕芬,杜瑞平,高民. 中国农业科学. 2013(21)
[9]葡萄籽原花青素及维生素E对氧化应激仔猪生长性能、血清氧化还原状态和肝脏氧化损伤的影响[J]. 赵娇,周招洪,梁小芳,毛湘冰,陈代文,余冰. 中国农业科学. 2013(19)
[10]有氧运动对酒精性肝损伤小鼠ALT、AST、IL-10和IL-6等的影响[J]. 蔡文丽,张慧,唐选,牛英鹏. 沈阳体育学院学报. 2013(03)
博士论文
[1]约克夏猪和金华猪甲状腺组织mRNA、lncRNA和miRNA测序及功能分析[D]. 沈一飞.浙江大学 2016
[2]氧化应激对仔猪精氨酸代谢和需求特点的影响及机制研究[D]. 郑萍.四川农业大学 2010
[3]仔猪氧化应激及硒的抗应激效应和机理的研究[D]. 袁施彬.四川农业大学 2007
硕士论文
[1]日粮添加L-茶氨酸对断奶仔猪的抗应激效果研究[D]. 刘通.西北农林科技大学 2016
[2]葡萄籽提取物减缓西杂肉牛空肠上皮细胞热应激反应的功能与机制研究[D]. 朱旺.西南大学 2015
[3]奶牛肢蹄病患牛体内矿物元素和氧化应激指标的变化[D]. 李忠鹏.山东农业大学 2014
[4]猪CuZnSOD基因的克隆、mRNA表达及其对肉质抗氧化性能的影响[D]. 杜金芳.山东农业大学 2011
[5]猪氧化应激模型构建以及茶多酚的抗应激效应的研究[D]. 徐静.四川农业大学 2009
本文编号：3144012
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