猪动静脉血液miRNA表达谱分析

发布时间：2021-04-25 01:28

　　MicroRNAs （miRNAs）是一类长度约18～24nt的非编码RNA,能够与mRNA特异性结合从而调控基因的表达,在细胞增殖、分化、代谢、凋亡和免疫应答等生物学过程中具有重要作用。血液作为最重要的体液广泛参与机体各个生物学过程,血液中的1miRNAs被报道能稳定的存在于血液中作为生物体生理状态和病理状态的重要分子标记。然而目前对于猪血液miRNA的研究相对较少,且都是对静脉血液miRNA的研究,对于动脉血液中miRNA研究还完全是空白。为了鉴定猪血液miRNA表达谱和动静脉血液在miRNA表达水平的差异,我们利用高通量测序技术检测了猪的动脉血液和静脉血液的miRNA表达谱,并用荧光定量方法进行验证。结果如下：（1） 通过建库测序,分别在动脉血液和静脉血液获得了5.21 million （M）;和8.61 M原始数据。经过滤后,超过78%的序列达到质量要求成为mappable序列,这止匕mappable序列长度集中在21～23 nt。（2）两个文库共鉴定出272个猪已知的miRNAs.52个保守的：niRNAs和281个候选miRNAs,其中表达量位于前20位的miRNAs分别占... 

【文章来源】：四川农业大学四川省 211工程院校

【文章页数】：63 页

【学位级别】：硕士

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摘要
Abstract
1 文献综述
    1.1 miRNA简介
        1.1.1 miRNA的发现
        1.1.2 miRNA的生成
        1.1.3 miRNA的作用机制
        1.1.4 miRNA的检测方法
    1.2 猪miRNA研究进展
    1.3 血液miRNA研究进展
        1.3.1 血液miRNA的发现和稳定性
        1.3.2 血液miRNA的存在形式
        1.3.3 血液miRNA作为分子标记
2 研究内容与目的意义
3 材料和方法
    3.1 实验样品采集
    3.2 主要仪器和试剂
        3.2.1 主要仪器设备
        3.2.2 主要试剂
    3.3 试验方法
        3.3.1 Total RNA的提取
        3.3.2 Total RNA的质检
        3.3.3 高通量测序
        3.3.4 miRNA定量
        3.3.5 靶基因预测和功能注解分析
4 结果与分析
    4.1 Total RNA提取结果
    4.2 测序结果
        4.2.1 原始数据结果
        4.2.2 Mappable序列长度分布统计
        4.2.3 核酸倾向性分析
        4.2.4 miRNA的鉴定和分组
        4.2.5 miRNA簇
    4.3 高表达miRNAs的分析
        4.3.1 miRNA的拷贝数变异
        4.3.2 高表达miRNAs的分析
        4.3.3 高表达miRNAs的靶基因预测
        4.3.4 高表达miRNAs的生物学过程分析
    4.4 动静脉血液miRNA表达谱差异分析
        4.4.1 动静脉血液miRNA的聚类分析
        4.4.2 IDEG6差异检验差异miRNAs
        4.4.3 差异miRNAs生物学功能分析
    4.5 定量验证
5 讨论
    5.1 Solexa测序的优越性
    5.2 猪是理想的医学动物模型
    5.3 血液miRNAs文库表达谱特征
    5.4 高表达和差异表达的miRNAs
    5.5 基于血液miRNAs的核酸诊断和核酸治疗
6 结论
参考文献
致谢
攻读学位期间发表的学术论文



本文编号：3158438