2018年四川地区猪繁殖与呼吸综合征病毒ORF5基因的分子流行病学调查研究

发布时间：2021-05-08 08:51

　　为研究四川地区猪繁殖与呼吸综合征病毒（PRRSV）的流行及进化趋势,本研究以GP5蛋白为研究对象,对2018年间收集的378份四川省不同区市县PRRSV疑似病料进行了实时荧光定量PCR检测,并对部分毒株ORF5基因的核苷酸序列和推导的氨基酸序列进行进化分析和N-糖基化位点预测。通过疑似病料实时荧光定量PCR检测,共检出阳性样品69份,阳性率为18.25%。对其中23株PRRSV的ORF5基因序列分析结果显示,ORF5基因之间核苷酸同源性为81.6%～100%,推导的氨基酸同源性为81.4%～100%,均属于美洲型毒株。其中,1株属于以经典毒株VR2332为代表的亚型Ⅰ,17株属于以高致病毒株JXA1为代表的亚型Ⅱ,5株属于重组毒株NADC30为代表的亚型Ⅲ,说明2018年间四川省PRRSV流行毒株存在基因多样性,HP-PRRSV依然是主要流行毒株,但仍存在不断进化的经典毒株,同时,类似NADC30和QYYZ的重组毒株也开始出现。通过氨基酸突变位点和N-糖基化位点分析发现,23株PRRSV在GP5两个重要抗原表位相关区域和毒力相关位点均发生了一定程度的突变,推测这些突变可能影响了病毒逃避... 

【文章来源】：中国畜牧兽医. 2020,47(04)北大核心

【文章页数】：11 页

【文章目录】：
1 材料与方法
    1.1 材料
        1.1.1 病料采集
        1.1.2 主要试剂及仪器
    1.2 RNA提取与反转录
    1.3 PRRSV荧光定量PCR检测
    1.4 ORF5基因的扩增
    1.5 ORF5基因遗传进化分析
    1.6 GP5蛋白糖基化位点预测
2 结 果
    2.1 PRRSV的实时荧光定量PCR鉴定
    2.2 阳性样品ORF5基因测序结果
    2.3 ORF5基因的核苷酸序列同源性分析
    2.4 基于ORF5基因推导的氨基酸序列同源性分析
    2.5 基于ORF5基因核苷酸序列的PRRSV遗传进化分析
    2.6 氨基酸突变位点分析
    2.7 GP5蛋白潜在N-糖基化位点变化分析
3 讨 论
4 结 论


【参考文献】：
期刊论文
[1]猪系统性疾病的流行现状与防控措施[J]. 陈焕春.  北方牧业. 2017(11)
[2]PRRSV野毒感染猪群免疫接种弱毒活疫苗的效果分析[J]. 许心婷,施开创,李常挺,龙飞翔,莫胜兰,陈汉忠.  中国畜牧兽医. 2016(09)
[3]猪繁殖与呼吸综合征病毒及疫苗的研究进展[J]. 谭伟,邓显文,谢芝勋.  中国畜牧兽医. 2014(06)
[4]猪繁殖与呼吸综合征病毒GP5蛋白糖基化位点缺失突变株的构建[J]. 张辉,王光利,徐大勇,李峰,徐争辉.  中国兽医科学. 2012(05)
[5]4种猪繁殖障碍性疫病流行病学调研与分析[J]. 韩一超,吴忻,姚敬明,王娟萍,武守艳,孟帆,雷宇平,陈剑波,刘文俊,焦福林,樊振华,米瑞娟.  中国畜牧兽医. 2011(11)



本文编号：3175041