四川部分地区PED和TGE分子流行病学调查及PEDV部分S基因变异分析
发布时间：2021-05-15 22:57
猪流行性腹泻（Porcine epidemic diarrhea, PED）和猪传染性胃肠炎（Transmissible gastroenteriris of swine, TGE）分别由同属于冠状病毒科冠状病毒属的猪流行性腹泻病毒（Porcine epidemic diarrhea virus, PEDV）和猪传染性胃肠炎病毒（Transmissible gastroenteritis virus of swine, TGEV）引起的以腹泻、呕吐、脱水为特征,严重危害哺乳仔猪的两种高度接触性肠道传染病。四川地区从2011年10月份开始,在全省范围内爆发以仔猪水样腹泻,死亡率极高为特征的腹泻疫情,给我省带来了严重的经济损失。此次疫情中进行了PEDV-TGEV二联疫苗免疫的猪场也并无幸免。为了明确此次腹泻疫情中的主要病毒病原分布情况、感染情况以及PEDV在此次腹泻疫情中的变异情况,特开展本研究。本试验样本采集于2011年10月至2012年4月、2012年10月至2013年4月两个时间段,包括四川省资阳、广元、攀枝花、成都等10个区域进行腹泻样品采集工作,覆盖了四川东部、西部、中部地区的大...
【文章来源】：四川农业大学四川省 211工程院校
【文章页数】：60 页
【学位级别】：硕士
【文章目录】：
摘要
Abstract
缩略词表
第一部分 文献综述
1. 猪流行性腹泻
1.1 猪流行性腹泻的发病机理
1.2 猪流行性腹泻的病理变化
1.3 猪流行性腹泻病毒概述
1.3.1 PEDV的病毒学分类
1.3.2 PEDV的形态特征
1.3.3 PEDV的理化特性
1.3.4 PEDV的细胞培养特性
1.3.5 PEDV的基因组结构
1.3.6 PEDV主要结构蛋白及功能
1.4 猪流行腹泻的分子流行病学调查
1.5 猪流行性腹泻的诊断方法
2 猪传染性胃肠炎
2.1 猪传染性胃肠炎的发病机理
2.2 猪传染性胃肠炎的病理变化
2.3 猪传染性胃肠炎病毒概述
2.3.1 TGEV的形态结构
2.3.2 TGEV的理化特性
2.3.3 TGEV的细胞培养特性
2.3.4 TGEV的基因组结构
2.3.5 TGEV的主要蛋白及功能
2.4 TGE的分子流行病学调查
2.5 TGE的诊断方法
3 本研究的目的和意义
第二部分 PEDV和TGEV分子流行病学调查
1. 材料与方法
1.1 病料
1.2 试剂
1.3 主要的仪器设备
1.4 引物的设计
1.5 病毒总RNA的提取
1.6 CDNA的合成
1.7 PCR扩增
1.8 PCR扩增产物的检测及鉴定
2. 结果
2.1 RT-PCR结果
2.2 临床样品的检测结果
3. 讨论
第三部分 PEDV部分S基因遗传变异分析
1. 材料
1.1 病料
1.2 试剂
1.3 主要的仪器设备
1.4 主要溶液配制
2. 方法
2.1 引物的设计
2.2 病毒总RNA的提取
2.3 CDNA的合成
2.4 PCR扩增
2.5 PCR扩增产物的检测及鉴定
2.6 目的基因的克隆
3. 结果
3.1 RT-PCR结果
3.2 PEDV S基因的序列和进化分析
3.3 S基因的核苷酸及氨基酸同源性分析
4 讨论
全文结论
参考文献
致谢
附录 四川地区猪流行性腹泻部分S基因测序结果
【参考文献】：
期刊论文
[1]山东省部分地区猪流行性腹泻流行病学调查及其M基因遗传变异分析[J]. 赵梦姣,陈书民,成岩,孙振,姜世金,田夫林. 中国兽医学报. 2013(10)
[2]猪流行性腹泻病毒研究现状[J]. 杨德全,鞠厚斌,葛菲菲,宁昆,刘健,王建,周锦萍. 畜牧与兽医. 2013(08)
[3]猪流行性腹泻病毒的RT-PCR检测及DY株的分离鉴定[J]. 任玉鹏,陈弟诗,颜其贵,程渝,郭玲,杨绍林,舒蕾. 中国兽医科学. 2013(07)
[4]猪流行性腹泻病毒RT-PCR检测与ORF3基因分子流行病学调查[J]. 董彦鹏,白娟,范宝超,李玉峰,姜平. 中国预防兽医学报. 2013(07)
[5]华南地区猪流行性腹泻病毒的分离鉴定及其S基因抗原表位片段的遗传变异分析[J]. 田野,苏丹萍,蒋伟,钟望,张显浩,陈瑞爱,贺东生. 中国兽医杂志. 2013(05)
[6]2010～2012年华中地区猪流行性腹泻病毒分子特征和遗传进化分析[J]. 郑逢梅,霍金耀,赵军,常洪涛,王晓梦,陈陆,王川庆. 病毒学报. 2013(02)
[7]2011年广西猪群猪流行性腹泻和猪传染性胃肠炎调查[J]. 甘海霞,梁晟,韦显凯,温丽霞,郑列丰,邹联斌. 动物医学进展. 2012(10)
[8]猪流行性腹泻病毒的RT-PCR鉴定及其M、N和E基因的序列分析[J]. 张红垒,董洁,梁亚冰,许信刚,童德文. 西北农业学报. 2012(09)
[9]猪流行性腹泻病毒RT-PCR检测方法建立及初步应用研究[J]. 吴学敏,陈如敬,王隆柏,车勇良,刘玉涛,庄向生,严山,周伦江. 中国农学通报. 2012(26)
[10]猪流行性腹泻病毒ORF3和M基因的克隆与序列分析[J]. 王隆柏,吴学敏,车勇良,陈如敬,魏宏,刘玉涛,庄向生,周伦江. 中国动物传染病学报. 2012(03)
本文编号：3188485
【文章来源】：四川农业大学四川省 211工程院校
【文章页数】：60 页
【学位级别】：硕士
【文章目录】：
摘要
Abstract
缩略词表
第一部分 文献综述
1. 猪流行性腹泻
1.1 猪流行性腹泻的发病机理
1.2 猪流行性腹泻的病理变化
1.3 猪流行性腹泻病毒概述
1.3.1 PEDV的病毒学分类
1.3.2 PEDV的形态特征
1.3.3 PEDV的理化特性
1.3.4 PEDV的细胞培养特性
1.3.5 PEDV的基因组结构
1.3.6 PEDV主要结构蛋白及功能
1.4 猪流行腹泻的分子流行病学调查
1.5 猪流行性腹泻的诊断方法
2 猪传染性胃肠炎
2.1 猪传染性胃肠炎的发病机理
2.2 猪传染性胃肠炎的病理变化
2.3 猪传染性胃肠炎病毒概述
2.3.1 TGEV的形态结构
2.3.2 TGEV的理化特性
2.3.3 TGEV的细胞培养特性
2.3.4 TGEV的基因组结构
2.3.5 TGEV的主要蛋白及功能
2.4 TGE的分子流行病学调查
2.5 TGE的诊断方法
3 本研究的目的和意义
第二部分 PEDV和TGEV分子流行病学调查
1. 材料与方法
1.1 病料
1.2 试剂
1.3 主要的仪器设备
1.4 引物的设计
1.5 病毒总RNA的提取
1.6 CDNA的合成
1.7 PCR扩增
1.8 PCR扩增产物的检测及鉴定
2. 结果
2.1 RT-PCR结果
2.2 临床样品的检测结果
3. 讨论
第三部分 PEDV部分S基因遗传变异分析
1. 材料
1.1 病料
1.2 试剂
1.3 主要的仪器设备
1.4 主要溶液配制
2. 方法
2.1 引物的设计
2.2 病毒总RNA的提取
2.3 CDNA的合成
2.4 PCR扩增
2.5 PCR扩增产物的检测及鉴定
2.6 目的基因的克隆
3. 结果
3.1 RT-PCR结果
3.2 PEDV S基因的序列和进化分析
3.3 S基因的核苷酸及氨基酸同源性分析
4 讨论
全文结论
参考文献
致谢
附录 四川地区猪流行性腹泻部分S基因测序结果
【参考文献】：
期刊论文
[1]山东省部分地区猪流行性腹泻流行病学调查及其M基因遗传变异分析[J]. 赵梦姣,陈书民,成岩,孙振,姜世金,田夫林. 中国兽医学报. 2013(10)
[2]猪流行性腹泻病毒研究现状[J]. 杨德全,鞠厚斌,葛菲菲,宁昆,刘健,王建,周锦萍. 畜牧与兽医. 2013(08)
[3]猪流行性腹泻病毒的RT-PCR检测及DY株的分离鉴定[J]. 任玉鹏,陈弟诗,颜其贵,程渝,郭玲,杨绍林,舒蕾. 中国兽医科学. 2013(07)
[4]猪流行性腹泻病毒RT-PCR检测与ORF3基因分子流行病学调查[J]. 董彦鹏,白娟,范宝超,李玉峰,姜平. 中国预防兽医学报. 2013(07)
[5]华南地区猪流行性腹泻病毒的分离鉴定及其S基因抗原表位片段的遗传变异分析[J]. 田野,苏丹萍,蒋伟,钟望,张显浩,陈瑞爱,贺东生. 中国兽医杂志. 2013(05)
[6]2010～2012年华中地区猪流行性腹泻病毒分子特征和遗传进化分析[J]. 郑逢梅,霍金耀,赵军,常洪涛,王晓梦,陈陆,王川庆. 病毒学报. 2013(02)
[7]2011年广西猪群猪流行性腹泻和猪传染性胃肠炎调查[J]. 甘海霞,梁晟,韦显凯,温丽霞,郑列丰,邹联斌. 动物医学进展. 2012(10)
[8]猪流行性腹泻病毒的RT-PCR鉴定及其M、N和E基因的序列分析[J]. 张红垒,董洁,梁亚冰,许信刚,童德文. 西北农业学报. 2012(09)
[9]猪流行性腹泻病毒RT-PCR检测方法建立及初步应用研究[J]. 吴学敏,陈如敬,王隆柏,车勇良,刘玉涛,庄向生,严山,周伦江. 中国农学通报. 2012(26)
[10]猪流行性腹泻病毒ORF3和M基因的克隆与序列分析[J]. 王隆柏,吴学敏,车勇良,陈如敬,魏宏,刘玉涛,庄向生,周伦江. 中国动物传染病学报. 2012(03)
本文编号：3188485
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