猪脂肪分解通路中主要基因的网络构建
发布时间:2021-05-15 23:17
脂肪代谢性状属于多基因控制的复杂性状。目前有关脂肪分解的研究大多着眼于几个甚至单一基因,难以发现基因之间的互作,应用于育种实践时具有一定的局限性。HSL是一种重要的脂肪分解酶,已有研究证实CB1可以影响HSL基因的表达,但是调控机制并不清楚。本文采用文献挖掘方法,构建了与脂肪分解有关的基因网络,阐明脂解基因之间的作用机理;推测CB1通过CB1→PPARγ2→perilipinA→HSL通路对HSL起调控作用,并通过试验对CB1对HSL基因表达的调控进行验证,可为今后进一步开展脂肪分解通路的研究提供理论依据。本研究分析了脂肪动员、线粒体与过氧化物酶体内脂肪酸的β氧化和甘油代谢三个环节中相关酶及其编码基因的性质特征,并解释了调控通路的作用机制;运用生物信息学方法分析CB1→PPARγ2→perilipinA→HSL通路中4个基因编码的蛋白质的理化性质与结构;选取了4、5、6、7月龄15头美系大白猪屠宰采样,对CB1、PPARγ2和HSL基因表达进行相对定量。结果显示:兴奋性G蛋白偶联受体通路、抑制性G蛋白偶联受体通路和Gq/PLC/PKC通路属于G蛋白偶联通路,调控机制相似;酪氨酸激酶受体...
【文章来源】:河北农业大学河北省
【文章页数】:56 页
【学位级别】:硕士
【文章目录】:
摘要
Abstract
1 引言
1.1 脂肪组织和脂肪细胞
1.1.1 脂肪组织和脂肪细胞的构成
1.1.2 脂肪组织和脂肪细胞的起源和发育
1.1.3 脂肪因子
1.2 脂肪的分解过程及相关脂肪酶
1.2.1 脂肪的动员
1.2.2 甘油的代谢
1.2.3 脂肪酸的 β 氧化
1.2.4 其他调节脂肪分解的基因
1.3 脂肪分解的信号机制
1.3.1 兴奋性 G 蛋白偶联受体通路
1.3.2 抑制性 G 蛋白偶联受体通路
1.3.3 酪氨酸激酶受体通路
1.3.4 Gq/PLC/PKC 通路
1.3.5 JAK‐STATs 通路
1.4 脂肪分解代谢的研究方法
1.5 有待解决的问题
1.6 本研究的内容
1.7 本研究的意义
2 材料与方法
2.1 试验材料
2.1.1 生物信息学分析材料
2.1.2 提取总 RNA 试验材料
2.1.3 主要的试验试剂
2.1.4 试剂的配制
2.2 试验方法
2.2.1 调控网络的构建
2.2.2 生物信息学分析
2.2.3 主要的试验仪器
2.2.4 总 RNA 的提取
2.2.5 RNA 纯度和质量的检测
2.2.6 RNase free DNaseⅠ处理总 RNA
2.2.7 引物设计
2.2.8 PCR 鉴定 gDNA
2.2.9 反转录成 cDNA
2.2.10 Real‐time PCR
2.2.11 数据处理
3 结果与分析
3.1 脂肪降解通路中主要基因的网络构建
3.1.1 猪脂肪分解调控网络
3.1.2 G 蛋白偶联受体介导的调控通路
3.2 CB1/ PPARΓ2/HSL 通路中蛋白质的生物信息学分析
3.2.1 蛋白质的理化性质
3.2.2 蛋白质的信号肽和亚细胞定位
3.2.3 蛋白质的二级结构
3.3 CB1 调控 HSL 表达研究
3.3.1 RNA 纯度和质量的检测结果
3.3.2 反应曲线
3.3.3 CB1、PPARγ2 和 HSL 基因的组织表达谱
3.3.4 猪不同体重阶段 CB1、PPARγ2 和 HSL 基因的表达趋势
4 讨论
4.1 猪脂肪分解通路中的基因网络
4.2 脂解通路之间的关系
4.3 CB1/ PPARΓ2/HSL 通路的推测
4.3.1 CB1/ PPARγ2/HSL 通路中蛋白质的生物信息学分析
4.3.2 CB1 对 HSL 表达的调控
4.4 有待进一步研究的问题
5 结论
参考文献
缩略词表
在读期间发表的论文
作者简历
致谢
本文编号:3188514
【文章来源】:河北农业大学河北省
【文章页数】:56 页
【学位级别】:硕士
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摘要
Abstract
1 引言
1.1 脂肪组织和脂肪细胞
1.1.1 脂肪组织和脂肪细胞的构成
1.1.2 脂肪组织和脂肪细胞的起源和发育
1.1.3 脂肪因子
1.2 脂肪的分解过程及相关脂肪酶
1.2.1 脂肪的动员
1.2.2 甘油的代谢
1.2.3 脂肪酸的 β 氧化
1.2.4 其他调节脂肪分解的基因
1.3 脂肪分解的信号机制
1.3.1 兴奋性 G 蛋白偶联受体通路
1.3.2 抑制性 G 蛋白偶联受体通路
1.3.3 酪氨酸激酶受体通路
1.3.4 Gq/PLC/PKC 通路
1.3.5 JAK‐STATs 通路
1.4 脂肪分解代谢的研究方法
1.5 有待解决的问题
1.6 本研究的内容
1.7 本研究的意义
2 材料与方法
2.1 试验材料
2.1.1 生物信息学分析材料
2.1.2 提取总 RNA 试验材料
2.1.3 主要的试验试剂
2.1.4 试剂的配制
2.2 试验方法
2.2.1 调控网络的构建
2.2.2 生物信息学分析
2.2.3 主要的试验仪器
2.2.4 总 RNA 的提取
2.2.5 RNA 纯度和质量的检测
2.2.6 RNase free DNaseⅠ处理总 RNA
2.2.7 引物设计
2.2.8 PCR 鉴定 gDNA
2.2.9 反转录成 cDNA
2.2.10 Real‐time PCR
2.2.11 数据处理
3 结果与分析
3.1 脂肪降解通路中主要基因的网络构建
3.1.1 猪脂肪分解调控网络
3.1.2 G 蛋白偶联受体介导的调控通路
3.2 CB1/ PPARΓ2/HSL 通路中蛋白质的生物信息学分析
3.2.1 蛋白质的理化性质
3.2.2 蛋白质的信号肽和亚细胞定位
3.2.3 蛋白质的二级结构
3.3 CB1 调控 HSL 表达研究
3.3.1 RNA 纯度和质量的检测结果
3.3.2 反应曲线
3.3.3 CB1、PPARγ2 和 HSL 基因的组织表达谱
3.3.4 猪不同体重阶段 CB1、PPARγ2 和 HSL 基因的表达趋势
4 讨论
4.1 猪脂肪分解通路中的基因网络
4.2 脂解通路之间的关系
4.3 CB1/ PPARΓ2/HSL 通路的推测
4.3.1 CB1/ PPARγ2/HSL 通路中蛋白质的生物信息学分析
4.3.2 CB1 对 HSL 表达的调控
4.4 有待进一步研究的问题
5 结论
参考文献
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在读期间发表的论文
作者简历
致谢
本文编号:3188514
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