太行鸡CYP19A1基因克隆及生物信息学分析

发布时间：2021-05-17 09:21

　　试验旨在克隆蛋鸡CYP19A1基因,对其遗传结构进行生物信息学分析并探究其在太行鸡不同组织中及不同产蛋量个体中的表达情况。以河北省太行鸡为研究对象,通过设计引物对CYP19A1基因CDS区进行克隆测序,运用生物信息学软件对其功能结构进行预测。结果显示,CYP19A1基因含有一个1 509 bp的开放阅读框（ORF）,编码502个氨基酸。同源性比对和系统发生树分析结果表明,太行鸡CYP19A1基因与鸭的同源性较高（90.7%）,并且在不同物种间高度保守。对CYP19A1蛋白理化性质进行预测分析发现,该蛋白为亲水蛋白,蛋白分子式为C₂₆₀₂H₄₁₀₃N₆₇₅O₇₁₉S₃₆,分子质量为57.51 ku,理论等电点为5.99,其中含量最高的是亮氨酸（为14.0%）。蛋白质二级结构由α-螺旋、延伸链、β-折叠及无规则卷曲4种结构组成,所占比例分别为58.95%、2.18%、3.93%和34.93%。组织表达谱分析发现,CYP19A1基因在不同组织中均有表达,但其在卵巢中表达量最高。实时荧... 

【文章来源】：中国畜牧兽医. 2020,47(05)北大核心

【文章页数】：9 页

【文章目录】：
1 材料与方法
    1.1 材料
        1.1.1 样品采集
        1.1.2 主要试剂
    1.2 方法
        1.2.1 太行鸡血液DNA提取
        1.2.2 各组织RNA提取
        1.2.3 cDNA合成
        1.2.4 克隆及测序
        1.2.5 CYP19A1基因生物信息学分析
        1.2.6 组织半定量表达分析
        1.2.7 实时荧光定量PCR
    1.3 数据统计分析
2 结 果
    2.1 生产性能
    2.2 CYP19A1基因序列分析
    2.3 CYP19A1基因生物信息学分析
        2.3.1 同源性分析
        2.3.2 CYP19A1蛋白理化性质分析
        2.3.3 CYP19A1蛋白二级结构预测分析
        2.3.4 NJ系统进化树
    2.4 组织半定量表达结果
    2.5 实时荧光定量PCR结果
3 讨 论
4 结 论


【参考文献】：
期刊论文
[1]广西麻鸡CYP19A1基因的克隆、序列分析和组织表达谱研究[J]. 孙甜甜,杨祝良,邓继贤,曾令湖,蒋和生,杨秀荣.  中国家禽. 2017(18)
[2]Cyp19a1基因在中华鳖早期卵巢分化中的功能研究[J]. 包海声,蔡晗,韩伟,张海艳,孙伟,葛楚天,钱国英.  中国科学:生命科学. 2017(06)
[3]补肾调周法对超排卵周期颗粒细胞CYP19A1 mRNA表达的影响[J]. 何珊,常宏,刘大艳,邓少洁,樊丹怡.  中国医院用药评价与分析. 2015(07)
[4]利用shRNA真核表达载体干涉雌性鸡胚性腺中芳香化酶基因（CYP19A1）的表达[J]. 朱晓亮,徐桂云,杨宁,李俊英,郑江霞.  农业生物技术学报. 2011(06)
[5]奥利亚罗非鱼卵巢芳香化酶基因的克隆及其表达[J]. 唐永凯,李建林,陈文华,俞菊华.  中国水产科学. 2008(05)

博士论文
[1]雌激素和TGF-β1对鸡原始卵泡和生长卵泡发育的调节作用及其机理的研究[D]. 赵丹.浙江大学 2018

硕士论文
[1]鸡卵泡体细胞转录组研究及芳香化酶基因调控分析[D]. 景若曦.华中农业大学 2018



本文编号：3191516