高山美利奴羊INHA基因多态性生物信息学分析及与产羔数关联分析

发布时间：2021-05-19 13:53

　　本研究旨在研究高山美利奴羊INHA基因外显子多态性及其与产羔数的相关性。本实验通过比对高山美利奴羊全基因组测序结果中不同个体INHA外显子,分析高山美利奴羊INHA基因的单核苷酸多态性,应用生物信息学软件分析高山美利奴羊INHA基因突变前后不同等位基因的m RNA二级结构、蛋白质的二级结构及三级结构。通过上述分析,将引起高山美利奴羊INHA编码氨基酸变化的位点作为该基因的特异性候选位点,通过直接测序法分析高山美利奴羊特异性候选位点INHA基因多态性,并分析其与产羔数的相关性。结果发现,高山美利奴羊INHA基因外显子区域存在3个SNPs,分别为T206A （Met→Lys）、T387A（Thr→Thr）、G900A （Pro→Pro）;INHA基因3个SNPS都改变了RNA的最小自由能以及二级结构,错义突变T206A （Met→Lys）引起蛋白质二级结构和三级结构的改变;高山美利奴羊INHA基因T206A突变表现出3种基因型分别命名为TT、TA、AA,基因型与产羔数关联分析发现TT、TA基因型个体的产羔数极显著高于TT基因型个体（p<0.01）。本研究初步表明INHA基因是影响高山... 

【文章来源】：基因组学与应用生物学. 2020,39(03)北大核心CSCD

【文章页数】：7 页

【文章目录】：
1 结果与分析
    1.1 高山美利奴羊INHA基因外显子SNPs筛选
    1.2 SNP位点的遗传多态性
    1.3 生物信息学分析
    1.4 PCR扩增及测序
    1.5 高山美利奴羊INHA基因外显子T206A SNP位点的基因型频率和等位基因频率分析
    1.6 INHA基因多态性与产羔数关联分析
2 讨论
3 材料与方法
    3.1 材料
    3.2 血液基因组DNA的提取
    3.3 全基因组测序及INAH基因多态位点筛选
    3.4 多态位点遗传多样性分析
    3.5 生物信息学分析
    3.6 引物设计
    3.7 PCR扩增与测序
    3.8 统计学分析


【参考文献】：
期刊论文
[1]高山美利奴羊新品种种质特性初步研究[J]. 岳耀敬,王天翔,刘建斌,郭健,李桂英,孙晓萍,李文辉,冯瑞林,牛春娥,郭婷婷,李范文,杨博辉.  中国畜牧杂志. 2014(21)
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[7]我国细毛羊产业现状及发展对策[J]. 夏新山.  中国畜牧杂志. 2007(13)
[8]小尾寒羊高繁殖力候选基因INHA的研究[J]. 周文然,储明星,孙少华,方丽,叶素成.  农业生物技术学报. 2007(01)



本文编号：3195881