猪TLR4基因多态性及与其断奶仔猪免疫指标的关联分析

发布时间：2021-06-07 14:42

　　本研究以皖南黑猪、安庆六白猪、圩猪、霍寿黑猪四个安徽地方品种及一个外来品种长白猪为材料,采用PCR-SSCP技术筛查TLR4基因第三外显子部分片段的单链核苷酸多态性（SNP）,并通过SPSS软件分析所检测到的SNP在安庆六白猪、圩猪、霍寿黑猪、大白猪四个品种中的多态性与断奶仔猪部分免疫指标的相关性,从而为寻找与猪抗病性状相关的有效遗传标记奠定基础,为安徽地方猪抗病育种提供理论依据。经研究发现：（1）检测皖南黑猪,安庆六白猪,圩猪,霍寿黑猪,长白猪5个群体的TLR4基因多态性,发现了位于TLR4基因外显子3上的3个SNPs,分别是G417A,C318A,C1027A。（2）群体遗传学分析表明C318A位点,在皖南黑猪、圩猪、安庆六白猪均检测到CC、CA两种基因型,在皖南黑猪中的基因型频率分别为80.95%、19.05%,在圩猪中的基因型频率分别为70.00%、30.00%,在安庆六白猪中的基因型频率分别为82.50%、17.50%。其中CC基因型为该3个群体中优势基因型,AA基因型均未检测到。该位点在3个群体中PIC值分别为0.1575、0.2225、0.1469,均处于低度多态；且经过... 

【文章来源】：安徽农业大学安徽省

【文章页数】：60 页

【学位级别】：硕士

【文章目录】：
摘要
Abstract
缩略词(Abbreviation)
第一章 文献综述
    1 抗病育种研究概况
        1.1 抗病机理
        1.2 抗病力的遗传学基础
        1.3 抗病育种的主要途径
        1.4 抗病育种面临的困难及前景展望
    2 F18大肠杆菌的研究进展
        2.1 大肠杆菌简介
        2.2 致病机理
        2.3 大肠杆菌F18ab/ac菌毛
    3 TLR4研究进展
        3.1 TLRs家族及其结构
        3.2 TLR4基因的发现结构特点
        3.3 TLR4的信号转导通路
        3.4 TLR4基因研究现状
    4 单核苷酸多态性(SNP)
        4.1 SNP概念
        4.2 SNPs的特点
        4.3 SNP的检测技术的分类
        4.4 几种传统的SNP检测技术
引言
第二章 猪TLR4基因第三外显子多态性检测
    1 试验材料
        1.1 试验动物
        1.2 主要仪器设备
        1.3 试验试剂
        1.4 软件工具
    2 试验方法
        2.1 DNA提取
        2.2 引物设计
        2.3 PCR扩增
        2.4 单链构象多态性检测(SSCP)
        2.5 目的片段的克隆测序
        2.6 统计分析方法
    3 结果与分析
        3.1 猪耳组织DNA检测
        3.5 群体遗传学分析
    4 讨论
第三章 TLR4基因多态性与断奶仔猪部分免疫指标的关联分析
    1 试验材料
        1.1 试验动物
        1.2 试验仪器
        1.3 主要试剂
    2 试验方法
        2.1 仔猪DNA样品TLR4基因多态性的检测
        2.2 免疫指标的测定
    3 数据计算与分析
    4 结果与分析
        4.1 各种猪种间免疫指标差异分析
        4.2 猪TLR4基因C1027A位点多态性与免疫指标的关联分析
        4.3 猪TLR4基因G417A位点多态性与免疫指标的关联分析
    5 讨论
全文结论
参考文献
致谢
作者简介
攻读学位期间发表和参与发表的学术论文


【参考文献】：
期刊论文
[1]猪PLIN1基因单核苷酸多态检测与遗传分析[J]. 黄龙,余大华,何小雷,朱卫华,孟云,薛玮玮,丁月云,殷宗俊.  安徽农业大学学报. 2013(05)
[2]Toll样受体4与免疫的研究进展[J]. 许丹宁,李婉雁,田允波,黄运茂,唐军.  黑龙江畜牧兽医. 2013(15)
[3]单核苷酸多态性检测方法的研究进展[J]. 李穗雯,胡大春.  国际检验医学杂志. 2013(12)
[4]TLR4及其作用的研究进展[J]. 易世杰,赵礼金.  蛇志. 2013(02)
[5]猪TLR4基因单核苷酸多态性对转录的影响[J]. 杨秀芹,李朋,王秋实.  东北农业大学学报. 2013(03)
[6]猪TLR4基因2个突变位点的PCR-SSCP分析[J]. 陈月婵,翟春媛,刘娣,杨秀芹.  黑龙江畜牧兽医. 2012(17)
[7]猪Toll样受体4基因SNPs功能分析[J]. 杨秀芹,陈月婵,汪亮,李海涛,刘娣,关庆芝,付博.  遗传. 2012(08)
[8]白细胞介素（IL）-6及IL-8在儿童肺炎支原体肺炎中的变化和临床意义[J]. 唐涛.  当代医学. 2012(02)
[9]Toll样受体的研究进展[J]. 韩正强,王楠楠.  畜牧与兽医. 2011(12)
[10]单核苷酸多态性检测技术的研究[J]. 龙波,陈仕国,马显光,邓玲,廖新华.  激光杂志. 2011(05)

硕士论文
[1]TLR4基因对断奶仔猪F18大肠杆菌抗性调节机制的初步分析[D]. 刘璐.扬州大学 2013
[2]TAP1基因对断奶仔猪F18大肠杆菌抗性和部分免疫指标的效应分析[D]. 潘章源.扬州大学 2012
[3]苏钟猪TLR4基因多态性及编码区C1027A功能分析[D]. 刘筱.南京农业大学 2011
[4]猪TLR4基因的突变与功能分析[D]. 翟春媛.东北农业大学 2010
[5]仔猪大肠杆菌F18粘附型与FUT1基因型相关性研究[D]. 罗艳茹.甘肃农业大学 2007
[6]牛UCP3基因多态性与血清生化指标的相关性研究[D]. 李秋玲.西北农林科技大学 2006
[7]大肠杆菌F18菌毛FedF亚单位单克隆抗体的制备及其初步应用[D]. 丁爱云.扬州大学 2006
[8]猪NRAMP1基因PCR-RFLP多态性与免疫指标及生产性状关系的研究[D]. 吴宏梅.中国农业科学院 2005



本文编号：3216772