基于IGPD靶标研究芦丁对木糖葡萄球菌生物被膜的干预作用
发布时间：2021-06-10 16:40
木糖葡萄球菌（Staphylococcus xylosus,S.xylosus）是凝固酶阴性葡萄球菌奶牛乳房炎的主要分离菌,其分离率不仅呈上升趋势,且具有较强的生物被膜形成能力。生物被膜的存在能够增强细菌应对外界环境改变带来的生存压力,增强细菌耐药性以及造成宿主的持续性感染。因此,如何干预或消除细菌生物被膜的形成成为了科研工作者关注的热点。咪唑甘油磷酸酯脱水酶（Imidazoleglycerol-phosphate dehydratase,IGPD）在木糖葡萄球菌生物被膜的形成中发挥重要作用。IGPD是L-组氨酸合成通路中重要的金属酶之一,其广泛存在于低等植物和微生物的细胞内,被认为是潜在的药物靶点。芦丁是黄酮类药物,具有多种药理活性,但其能否干预木糖葡萄球菌生物被膜的形成以及干预机制尚未见报道。在本研究中,探究在木糖葡萄球菌生物被膜形成过程中,芦丁对木糖葡萄球菌生物被膜的干预作用;基于分子对接、表面等离子共振技术和氨基酸定点突变技术,阐明芦丁是否与IGPD的某些位点结合,确定其作用靶位;探究芦丁对hisB基因表达、IGPD蛋白表达、L-组氨酸含量、酶活性变化的影响;具体的研究结果如下...
【文章来源】：东北农业大学黑龙江省 211工程院校
【文章页数】：61 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
细菌生物被膜的形成过程
东北农业大学农学硕士学位论文咪唑甘油磷酸酯脱水酶及 L-组氨酸的研究进展 咪唑甘油磷酸酯脱水酶的研究进展唑甘油磷酸酯脱水酶（imidazoleglycerol phosphate dehydratase, IGPD）是一种等植物和微生物机体内的金属酶[34]，IGPD 在细菌、低等真核生物中保守，然的机体内却不存在[35]。目前其具体的催化机理仍不清楚，据报道其可能的催化 所示[36]。外，IGPD 是植物以及微生物体内 L-组氨酸生物合成途径的关键酶之一，在 L合成中发挥重要作用，因此通过抑制 IGPD 的活性从而阻断 L-组氨酸的生物合使细菌死亡而不会影响到人和动物的生命安全，另外，Sinhan[37]等报道 IGPD三聚体 X 射线晶体衍射结构，为 IGPD 抑制剂的研究提供了更加有利的思路与D 成为了新的除草剂的潜在靶标酶。
引 言黄色葡萄球菌的 IGPD 的晶体结构为 CNS 菌属 IGPD 的研究提供有利的结构基础，研究中，以金黄色葡萄球菌 IGPD 为模板，通过同源模建的方法，获得了可信度在 9糖葡萄球菌 IGPD 的三维结构[40]，木糖葡萄球菌的三维结构如图 1-3 所示，这对于球菌 IGPD 的抑制剂的筛选有较大的帮助。
【参考文献】：
期刊论文
[1]反枝苋乙酰乳酸合成酶与烟嘧磺隆分子结合模式分析及抗性位点预测[J]. 杨冬臣,霍静倩,张哲,齐萌,张金林. 农药学学报. 2019(01)
[2]基于定点突变的植物Ⅲ型聚酮合酶结构与功能研究进展[J]. 李星,陈默,柴团耀,王红. 生物工程学报. 2018(04)
[3]大环内酯类抗生素对细菌生物被膜作用的研究进展[J]. 丁双元,官丽莉,马红霞,刘树明. 黑龙江畜牧兽医. 2018(03)
[4]牛乳源金黄色葡萄球菌生物被膜形成与耐药性的研究[J]. 陈程,张锐,姜兴佳,吴帆,常佳伟,吉星,王曈,万佳宏,王桂琴. 中国兽医科学. 2018(06)
[5]Strategies for combating bacterial biofilm infections[J]. Hong Wu,Claus Moser,Heng-Zhuang Wang,Niels Hφiby,Zhi-Jun Song. International Journal of Oral Science. 2015(01)
[6]CMP羟甲基化酶MilA中与甲基羟化过程相关的关键氨基酸定点突变分析[J]. 高土玲,陈诚,赵功,邓子新,胡申才,贺新义. 微生物学通报. 2014(01)
[7]咪唑甘油磷酸酯脱水酶与含氮杂环磷酸酯类抑制剂作用方式的分子模拟[J]. 申涛,杜凤沛,刘婷,姚广伟,吴峥,方萌萌,徐筱杰,路慧哲. 物理化学学报. 2011(08)
[8]分子对接方法的应用与发展[J]. 段爱霞,陈晶,刘宏德,刘秀辉,卢小泉. 分析科学学报. 2009(04)
[9]细菌生物被膜的耐药机制及控制策略[J]. 贾鸣,胡晓梅,胡福泉. 生命的化学. 2008(03)
[10]基于氨基酸序列预测蛋白质功能性点突变位点[J]. 宋卓,张宁,阮吉寿,杨卓,张涛. 生物物理学报. 2007(02)
博士论文
[1]碳基纳米材料与生物分子相互作用的分子动力学研究[D]. 于怡.苏州大学 2018
[2]基于IGPD靶标探讨头孢喹肟干预木糖葡萄球菌生物被膜形成的机制[D]. 周永辉.东北农业大学 2018
[3]基于谷氨酰胺合成酶靶标探讨红霉素干预木糖葡萄球菌生物被膜形成的机制[D]. 杨艳北.东北农业大学 2017
硕士论文
[1]芦丁干预S.suis生物被膜的形成及其对cps基因簇和毒力基因表达的影响[D]. 王帅.东北农业大学 2017
[2]ALA-PDT对铜绿假单胞菌生物膜及其QS系统的影响的实验研究[D]. 谭杨.第三军医大学 2017
[3]基于核受体靶点的小分子设计及化学生物学研究[D]. 张欢.华侨大学 2015
[4]定向进化技术提高枯草芽孢杆菌角蛋白酶活性研究[D]. 高静雷.四川农业大学 2014
本文编号：3222743
【文章来源】：东北农业大学黑龙江省 211工程院校
【文章页数】：61 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
细菌生物被膜的形成过程
东北农业大学农学硕士学位论文咪唑甘油磷酸酯脱水酶及 L-组氨酸的研究进展 咪唑甘油磷酸酯脱水酶的研究进展唑甘油磷酸酯脱水酶（imidazoleglycerol phosphate dehydratase, IGPD）是一种等植物和微生物机体内的金属酶[34]，IGPD 在细菌、低等真核生物中保守，然的机体内却不存在[35]。目前其具体的催化机理仍不清楚，据报道其可能的催化 所示[36]。外，IGPD 是植物以及微生物体内 L-组氨酸生物合成途径的关键酶之一，在 L合成中发挥重要作用，因此通过抑制 IGPD 的活性从而阻断 L-组氨酸的生物合使细菌死亡而不会影响到人和动物的生命安全，另外，Sinhan[37]等报道 IGPD三聚体 X 射线晶体衍射结构，为 IGPD 抑制剂的研究提供了更加有利的思路与D 成为了新的除草剂的潜在靶标酶。
引 言黄色葡萄球菌的 IGPD 的晶体结构为 CNS 菌属 IGPD 的研究提供有利的结构基础，研究中，以金黄色葡萄球菌 IGPD 为模板，通过同源模建的方法，获得了可信度在 9糖葡萄球菌 IGPD 的三维结构[40]，木糖葡萄球菌的三维结构如图 1-3 所示，这对于球菌 IGPD 的抑制剂的筛选有较大的帮助。
【参考文献】：
期刊论文
[1]反枝苋乙酰乳酸合成酶与烟嘧磺隆分子结合模式分析及抗性位点预测[J]. 杨冬臣,霍静倩,张哲,齐萌,张金林. 农药学学报. 2019(01)
[2]基于定点突变的植物Ⅲ型聚酮合酶结构与功能研究进展[J]. 李星,陈默,柴团耀,王红. 生物工程学报. 2018(04)
[3]大环内酯类抗生素对细菌生物被膜作用的研究进展[J]. 丁双元,官丽莉,马红霞,刘树明. 黑龙江畜牧兽医. 2018(03)
[4]牛乳源金黄色葡萄球菌生物被膜形成与耐药性的研究[J]. 陈程,张锐,姜兴佳,吴帆,常佳伟,吉星,王曈,万佳宏,王桂琴. 中国兽医科学. 2018(06)
[5]Strategies for combating bacterial biofilm infections[J]. Hong Wu,Claus Moser,Heng-Zhuang Wang,Niels Hφiby,Zhi-Jun Song. International Journal of Oral Science. 2015(01)
[6]CMP羟甲基化酶MilA中与甲基羟化过程相关的关键氨基酸定点突变分析[J]. 高土玲,陈诚,赵功,邓子新,胡申才,贺新义. 微生物学通报. 2014(01)
[7]咪唑甘油磷酸酯脱水酶与含氮杂环磷酸酯类抑制剂作用方式的分子模拟[J]. 申涛,杜凤沛,刘婷,姚广伟,吴峥,方萌萌,徐筱杰,路慧哲. 物理化学学报. 2011(08)
[8]分子对接方法的应用与发展[J]. 段爱霞,陈晶,刘宏德,刘秀辉,卢小泉. 分析科学学报. 2009(04)
[9]细菌生物被膜的耐药机制及控制策略[J]. 贾鸣,胡晓梅,胡福泉. 生命的化学. 2008(03)
[10]基于氨基酸序列预测蛋白质功能性点突变位点[J]. 宋卓,张宁,阮吉寿,杨卓,张涛. 生物物理学报. 2007(02)
博士论文
[1]碳基纳米材料与生物分子相互作用的分子动力学研究[D]. 于怡.苏州大学 2018
[2]基于IGPD靶标探讨头孢喹肟干预木糖葡萄球菌生物被膜形成的机制[D]. 周永辉.东北农业大学 2018
[3]基于谷氨酰胺合成酶靶标探讨红霉素干预木糖葡萄球菌生物被膜形成的机制[D]. 杨艳北.东北农业大学 2017
硕士论文
[1]芦丁干预S.suis生物被膜的形成及其对cps基因簇和毒力基因表达的影响[D]. 王帅.东北农业大学 2017
[2]ALA-PDT对铜绿假单胞菌生物膜及其QS系统的影响的实验研究[D]. 谭杨.第三军医大学 2017
[3]基于核受体靶点的小分子设计及化学生物学研究[D]. 张欢.华侨大学 2015
[4]定向进化技术提高枯草芽孢杆菌角蛋白酶活性研究[D]. 高静雷.四川农业大学 2014
本文编号：3222743
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