基于数据挖掘的禽流感病毒传播能力与毒性分析

发布时间：2021-06-15 14:14

　　随着人类科技的不断进步,越来越多的疾病也随之产生,困扰着人类,并且对人类的生命安全甚至种族的延续都产生了致命的威胁。禽流感病毒不仅对家禽养殖造成巨大危害,同时也严重危害着人类的健康。这篇文章针对已经爆发数年的禽流感病毒的历史数据,运用数据挖掘方法,对禽流感病毒进行详细分析,为根治此类病毒做出理论依据。近年来,禽流感的爆发使得相关数据成指数型增长,单纯通过实验手段来研究已经越来越难以取得突破性进展,在这样的现状下,数据挖掘的引入就成为了一种必然。数据挖掘是新型的一门多学科的交叉学科,涉及到经济学、管理学、工学、理学等很多领域,在近几年的研究中得到了广泛的应用。本文设计的病毒数据很难通过简单的统计学分析发现潜在联系,所以要用数据挖掘的方法从比较大量的、复杂的、有众多噪声和模糊性干扰的情况下提取有效和实用的病毒信息。本课题对不同宿主禽流感病毒间的糖基化位点在数目、位置、使用氨基酸残基等信息进行了较详细分析,发现这些信息不足以有效地判断流感病毒是否可以跨宿主传播。通过对禽类与人类禽流感病毒使用数据挖掘的方法进行分析的多序列比对结果的对比分析,找到了多个可以区分不同宿主的氨基酸残基的特异性片段,... 

【文章来源】：大连海事大学辽宁省 211工程院校

【文章页数】：64 页

【学位级别】：硕士

【部分图文】：

识别的18个抗原变异关键位置在HA蛋A抗原表位中的位置

使得分析更为快速，没有选用最近一次爆发的H1N1的HA蛋白，共获得54条序列，使用clustalW进行多序列比对，比对结果如图4.1和图4. 2。多序列比对后差异很小的位置有24-51位，87-138位，302-525位，529-567位，在这些位置中除了禽流感病毒均具有的序列，很可能具有某一片段是禽类禽流感病毒独有的序列片段，而其余差异比较大的序列片段就很可能是每种毒株具有的个体差异。** ； * ； *****************************1 gi|209164818|g ffiA1:IX?IMlirrAANADTLCIGYBANKSTDTVDTVIMNVTVmSVNIXEDPHK(mC|(‘ gi|189313196|g MEAILLVIIYTFTAANADTICIGYlANHSTDTVDTVIE^N\T￥THS7KXXEE?HlTGKICi：gi 119 3 8 7 7 8 4 7 I g MAILWIIVTFTTANADTICIG￥|IANlTSTDTVDT?LElCNVT?'mSVKIXEDraHCS-Ci(4 gi 1198482881 gb MKAIIWLLVTFTTAHADTICTCOTAHroTDTVDTVIE^KVTVTHSVKXXEDKfiKGKLqK5 gi|30522968|gb HKTILVVLIYTFTTADADTLCIGYaAWNSTDTVDTVIEKNVTVmSVKLIElrtffllTGKLCK6 gi|189313177|g ffiAILLVIXCTFTAANADIXCIGYIUNNSTDTVDTYIEKNVTVraSVNIXEDSHNGKLCK

图4. 4人类HI禽流感病毒HA蛋白多序列比对结果二Fig. 4.4 HI human bird flu virus HA protein sequence alignment results(2)多序列比对后差异很小的位置有17-51位，87-99位，113-147位，292-567

【参考文献】：
期刊论文
[1]面向领域的数据挖掘云平台研究[J]. 曾安,陈云,潘丹,杨海东,谢光强.  微电子学与计算机. 2014(08)
[2]数据挖掘在中国的现状和发展分析[J]. 闫燕.  科技信息. 2014(05)
[3]数据挖掘研究现状及发展趋势[J]. 王惠中,彭安群.  工矿自动化. 2011(02)
[4]Mutation trend of hemagglutinin of influenza A virus: a review from a computational mutation viewpoint[J]. Guang WU~1 Shao-min YAN Computational Mutation Project.DreamSciTech Consulting,301.Building 12.Nanyou A-zone,Jiannan Road.Shenzhen 518054,China.  Acta Pharmacologica Sinica. 2006(05)



本文编号：3231206