基因变异对奶牛生产性状的影响及隐性遗传疾病致病位点检测技术的研究
发布时间：2021-06-21 23:56
本研究开展了两个方面的研究,（1）在483头荷斯坦奶牛中,对我们实验室前期研究从SNP芯片中筛选出的PTHRP, TGFB1, PTK2, MAF1和PHF20的与奶牛生产性能相关的SNPs进行了其变异遗传效应的验证,以获得繁殖和产奶性能相关的分子遗传标记。（2）建立锌缺乏症（Bovine hereditary zinc deficiency, BHZD）、脊髓型肌萎缩症（Spinal muscular atrophy, SMA）、血友病（Hemophilia A）以及轴突病变（Degenerative Axonopathy）四种疾病的致病基因突变位点的分子生物学检测技术,并利用测序技术对其准确性进行验证,且对现有的荷斯坦奶牛样本进行检测,以淘汰奶牛群中的遗传病有害基因。主要研究结果如下：1、PTHRP基因变异对奶牛产奶繁殖性能具有显著的影响。在PTHRP基因intron1中的SNP位点（C→T突变）,对第二胎次的305产奶量、总产奶量、总蛋白量均有显著影响（P<0.05）, CC基因型个体的高于其他二个基因型个体的；对第一胎和第三胎的犊牛出生重量均达到了显著水平（P<0....
【文章来源】：华中农业大学湖北省 211工程院校 教育部直属院校
【文章页数】：89 页
【学位级别】：硕士
【文章目录】：
摘要
Abstract
缩略词表
第一部分 基因变异对奶牛繁殖产奶性状影响的分析
第一章 文献综述
1.1 引言
1.2 候选基因研究进展
1.2.1 甲状旁腺素相关蛋白(parathyroid hormone-related protein,PTHRP)基因
1.2.2 TGFB1(转化生长因子-β1)基因
1.2.3 PTK2(粘着斑激酶)基因
1.2.4 MAF1(同源酿酒酵母)基因
1.2.5 PHF20(指蛋白20)基因
1.3 研究目的和意义
第二章 材料与方法
2.1 实验材料
2.1.1 实验牛
2.1.2 血液样品的采集和提取方法
2.2 主要仪器与设备
2.3 主要的试剂及配制
2.3.1 主要试剂的配制
2.3.2 其他试剂
2.4 试验方法
2.4.1 基因组DNA的提取
2.4.2 聚合酶链反应(Polymerase Chain Reaction,PCR)
2.4.3 SNPs的检测
2.4.4 PCR产物酶切及电泳
2.4.5 分子生物学软件和数据分析软件
2.4.6 群体遗传学研究和数据统计分析
第三章 结果与分析
3.1 PTHRP基因
3.1.1 牛的PTHRP基因目的片段扩增结果
3.1.2 PTHRP基因的基因多态性检测
3.1.3 牛PTHRP基因SNP位点的PCR-RFLP多态性检测结果
3.1.4 奶牛PTHRP基因的变异特征
3.1.5 PTHRP基因型与荷斯坦奶牛生产性状的关联分析
3.2 PTK2基因
3.2.1 牛的PTK2基因目的片段扩增结果
3.2.2 牛PTK2基因SNP位点的CRS-PCR-RFLP多态性检测结果
3.2.3 奶牛PTK2基因的变异特征
3.2.4 PTK2基因型与荷斯坦奶牛生产性状的关联分析
3.3 MAF1基因
3.3.1 牛的MAF1基因目的片段扩增结果
3.3.2 牛MAF1基因SNP位点的PCR-RFLP多态性检测结果
3.3.3 奶牛MAF1基因的变异特征
3.3.4 MAF1基因型与荷斯坦奶牛生产性状的关联分析
3.4 PHF20基因
3.4.1 牛的PHF20基因目的片段扩增结果
3.4.2 牛PHF20基因SNP位点的PCR-RFLP多态性检测结果
3.4.3 奶牛PHF20基因的变异特征
3.4.4 PHF20基因型与荷斯坦奶牛生产性状的关联分析
3.5 TGFB1基因
3.5.1 牛的TGFBl基因目的片段扩增结果
3.5.2 TGFB1基因的基因变异位点的发现
第四章 讨论
4.1 PTHRP基因内含子变异对奶牛产奶性能影响的讨论
4.2 MAF1、PTK2和PHF20基因变异对奶牛繁殖和产奶性状产生遗效应的验证及其讨论
4.2.1 PTK2基因多态性和性状关联分析
4.2.2 MAF1基因多态性和性状关联分析
4.2.3 PHF20基因多态性和性状关联分析
第二部分 隐性遗传疾病致病位点检测技术的建立
第一章 文献综述
1.1 引言
1.2 脊髓型肌萎缩症(Spinal muscular atrophy,SMA)的研究进展
1.2.2 SMA的检测方法与分布
1.3 牛锌缺乏症(bovine hereditary zinc deficiency,BHZD)的研究进展
1.3.1 牛锌缺乏症(bovine hereditary zinc deficiency,BHZD)的发病机制及临床症状
1.3.2 BHZD的检测方法与分布
1.4 血友病(hemophilia A)的研究进展
1.4.1 血友病(hemophilia A)的发病机制与临床症状
1.4.2 血友病(hemophilia A)的检测方法和分布
1.5 轴突病变(Degenerative Axonopathy)的研究进展
1.5.1 轴突病变(Degenerative Axonopathy)的发病机制及临床症状
1.5.2 轴突病变(Degenerative Axonopathy)的检测方法和分布
1.6 研究目的和意义
第二章 材料与方法
2.1 试验材料
2.1.1 试验牛来源
2.1.2 血液样品的采集和提取方法(见第一部分的材料与方法)
2.2 主要仪器与设备(见第一部分的材料与方法)
2.3 主要的试剂及配制(见第一部分的材料与方法)
2.4 试验方法
2.4.1 基因组DNA的提取(见第一部分的材料与方法)
2.4.2 聚合酶链反应(Polymerase Chain Reaction,PCR)
2.4.3 PCR产物酶切及电泳(见第一部分的材料与方法)
2.4.4 PCR产物回收及测序
第三章 结果与分析
3.1 牛锌缺乏症(BHZD)致病位点检测技术的建立
3.1.1 BHZD致病位点PCR-RFLP(BtsC Ⅰ)检测技术的建立
3.1.2 利用序列测序技术对BHZD致病位点检测技术进行验证
3.1.3 PCR-RFLP致病位点检测技术在荷斯坦奶牛上的应用
3.2 牛脊髓型肌萎缩症(SMA)致病位点检测技术的建立
3.2.1 SMA致病位点PCR-RFLP(Mva Ⅰ)检测技术的建立
3.2.2 利用序列测序技术对SMA致病位点检测技术进行验证
3.2.3 PCR-RFLP致病位点检测技术在荷斯坦奶牛上的应用
3.3 牛血友病(Hemophilia A)致病位点检测技术的建立
3.3.1 血友病致病位点PCR-RFLP(Ear Ⅰ)检测技术的建立
3.3.2 利用序列测序技术对Hemophilia A致病位点检测技术进行验证
3.3.3 PCR-RFLP致病位点检测方法在荷斯坦奶牛上的应用
3.4 牛轴突病变(Degenerative Axonopathy)致病位点检测技术的建立
3.4.1 轴突病变致病位点PCR-RFLP(TspR Ⅰ)检测技术的建立
3.4.2 利用序列测序技术对轴突病变致病位点检测技术进行验证
3.4.3 PCR-RFLP致病位点检测技术在荷斯坦奶牛上的应用
第四章 讨论
4.1 关于建立SMA、BHZD、Hemophilia A以及Degenerative Axonopathy四种隐性遗传疾病致病位点的PCR-RFLP检测技术
4.2 荷斯坦奶牛隐性遗传疾病的检测
第三部分 小结
1.1 主要结论
1.2 本研究创新点
1.3 本研究的进一步研究内容
参考文献
致谢
本文编号：3241686
【文章来源】：华中农业大学湖北省 211工程院校 教育部直属院校
【文章页数】：89 页
【学位级别】：硕士
【文章目录】：
摘要
Abstract
缩略词表
第一部分 基因变异对奶牛繁殖产奶性状影响的分析
第一章 文献综述
1.1 引言
1.2 候选基因研究进展
1.2.1 甲状旁腺素相关蛋白(parathyroid hormone-related protein,PTHRP)基因
1.2.2 TGFB1(转化生长因子-β1)基因
1.2.3 PTK2(粘着斑激酶)基因
1.2.4 MAF1(同源酿酒酵母)基因
1.2.5 PHF20(指蛋白20)基因
1.3 研究目的和意义
第二章 材料与方法
2.1 实验材料
2.1.1 实验牛
2.1.2 血液样品的采集和提取方法
2.2 主要仪器与设备
2.3 主要的试剂及配制
2.3.1 主要试剂的配制
2.3.2 其他试剂
2.4 试验方法
2.4.1 基因组DNA的提取
2.4.2 聚合酶链反应(Polymerase Chain Reaction,PCR)
2.4.3 SNPs的检测
2.4.4 PCR产物酶切及电泳
2.4.5 分子生物学软件和数据分析软件
2.4.6 群体遗传学研究和数据统计分析
第三章 结果与分析
3.1 PTHRP基因
3.1.1 牛的PTHRP基因目的片段扩增结果
3.1.2 PTHRP基因的基因多态性检测
3.1.3 牛PTHRP基因SNP位点的PCR-RFLP多态性检测结果
3.1.4 奶牛PTHRP基因的变异特征
3.1.5 PTHRP基因型与荷斯坦奶牛生产性状的关联分析
3.2 PTK2基因
3.2.1 牛的PTK2基因目的片段扩增结果
3.2.2 牛PTK2基因SNP位点的CRS-PCR-RFLP多态性检测结果
3.2.3 奶牛PTK2基因的变异特征
3.2.4 PTK2基因型与荷斯坦奶牛生产性状的关联分析
3.3 MAF1基因
3.3.1 牛的MAF1基因目的片段扩增结果
3.3.2 牛MAF1基因SNP位点的PCR-RFLP多态性检测结果
3.3.3 奶牛MAF1基因的变异特征
3.3.4 MAF1基因型与荷斯坦奶牛生产性状的关联分析
3.4 PHF20基因
3.4.1 牛的PHF20基因目的片段扩增结果
3.4.2 牛PHF20基因SNP位点的PCR-RFLP多态性检测结果
3.4.3 奶牛PHF20基因的变异特征
3.4.4 PHF20基因型与荷斯坦奶牛生产性状的关联分析
3.5 TGFB1基因
3.5.1 牛的TGFBl基因目的片段扩增结果
3.5.2 TGFB1基因的基因变异位点的发现
第四章 讨论
4.1 PTHRP基因内含子变异对奶牛产奶性能影响的讨论
4.2 MAF1、PTK2和PHF20基因变异对奶牛繁殖和产奶性状产生遗效应的验证及其讨论
4.2.1 PTK2基因多态性和性状关联分析
4.2.2 MAF1基因多态性和性状关联分析
4.2.3 PHF20基因多态性和性状关联分析
第二部分 隐性遗传疾病致病位点检测技术的建立
第一章 文献综述
1.1 引言
1.2 脊髓型肌萎缩症(Spinal muscular atrophy,SMA)的研究进展
1.2.2 SMA的检测方法与分布
1.3 牛锌缺乏症(bovine hereditary zinc deficiency,BHZD)的研究进展
1.3.1 牛锌缺乏症(bovine hereditary zinc deficiency,BHZD)的发病机制及临床症状
1.3.2 BHZD的检测方法与分布
1.4 血友病(hemophilia A)的研究进展
1.4.1 血友病(hemophilia A)的发病机制与临床症状
1.4.2 血友病(hemophilia A)的检测方法和分布
1.5 轴突病变(Degenerative Axonopathy)的研究进展
1.5.1 轴突病变(Degenerative Axonopathy)的发病机制及临床症状
1.5.2 轴突病变(Degenerative Axonopathy)的检测方法和分布
1.6 研究目的和意义
第二章 材料与方法
2.1 试验材料
2.1.1 试验牛来源
2.1.2 血液样品的采集和提取方法(见第一部分的材料与方法)
2.2 主要仪器与设备(见第一部分的材料与方法)
2.3 主要的试剂及配制(见第一部分的材料与方法)
2.4 试验方法
2.4.1 基因组DNA的提取(见第一部分的材料与方法)
2.4.2 聚合酶链反应(Polymerase Chain Reaction,PCR)
2.4.3 PCR产物酶切及电泳(见第一部分的材料与方法)
2.4.4 PCR产物回收及测序
第三章 结果与分析
3.1 牛锌缺乏症(BHZD)致病位点检测技术的建立
3.1.1 BHZD致病位点PCR-RFLP(BtsC Ⅰ)检测技术的建立
3.1.2 利用序列测序技术对BHZD致病位点检测技术进行验证
3.1.3 PCR-RFLP致病位点检测技术在荷斯坦奶牛上的应用
3.2 牛脊髓型肌萎缩症(SMA)致病位点检测技术的建立
3.2.1 SMA致病位点PCR-RFLP(Mva Ⅰ)检测技术的建立
3.2.2 利用序列测序技术对SMA致病位点检测技术进行验证
3.2.3 PCR-RFLP致病位点检测技术在荷斯坦奶牛上的应用
3.3 牛血友病(Hemophilia A)致病位点检测技术的建立
3.3.1 血友病致病位点PCR-RFLP(Ear Ⅰ)检测技术的建立
3.3.2 利用序列测序技术对Hemophilia A致病位点检测技术进行验证
3.3.3 PCR-RFLP致病位点检测方法在荷斯坦奶牛上的应用
3.4 牛轴突病变(Degenerative Axonopathy)致病位点检测技术的建立
3.4.1 轴突病变致病位点PCR-RFLP(TspR Ⅰ)检测技术的建立
3.4.2 利用序列测序技术对轴突病变致病位点检测技术进行验证
3.4.3 PCR-RFLP致病位点检测技术在荷斯坦奶牛上的应用
第四章 讨论
4.1 关于建立SMA、BHZD、Hemophilia A以及Degenerative Axonopathy四种隐性遗传疾病致病位点的PCR-RFLP检测技术
4.2 荷斯坦奶牛隐性遗传疾病的检测
第三部分 小结
1.1 主要结论
1.2 本研究创新点
1.3 本研究的进一步研究内容
参考文献
致谢
本文编号：3241686
本文链接：https://www.wllwen.com/yixuelunwen/dongwuyixue/3241686.html
