解析VRTN基因因果突变调控猪胸椎数的分子机理
发布时间：2021-06-23 03:27
脊椎数是猪重要经济性状,影响猪胴体长、单位产肉量及乳头数。本实验室及日本Mikawa研究小组利用一系列的遗传学分析在7号染色体（SSC7）上鉴别一个显著影响猪脊椎数的数量性状位点（QTL）,该位点的单个等位基因可使胸椎数（TVN）增加0.5,vertnin（VRTN）被认为是该位点的候选因果基因,且该基因上的两个突变位点被鉴定为候选因果突变位点（QTNs）,它们很可能起源于中国地方猪并在历史上被导入到欧洲猪中。本研究旨在前期工作基础上对VRTN基因进行深入的功能验证,解析猪胸椎数变异的分子机理。本研究首先使用60K SNP芯片判定了609头杜长大杂交猪39,367个SNP的基因型,与胸椎数进行全基因组关联分析（GWAS）,发现最强关联位点是位于SSC7上的MARC0038565(P=1.87×10-51),通过连锁不平衡分析确定了400 kb的QTL置信区间。在置信区间内增加分子标记密度后,再次开展GWAS分析,结果发现VRTN基因中的g.8063G>A、g.13066C>T、g.19034A>C和g.2031120312i...
【文章来源】：江西农业大学江西省
【文章页数】：163 页
【学位级别】：博士
【部分图文】：
猪脊椎骨骼图
图 1-2 脊椎动物胚胎的发育过程（引自张红卫，发育生物学，2006[7]）Figure 1.2 Developmental process of embryos in vertebrate(cited from Zhang et al, Developmental biology, 2006[7])
图 1-3 中胚层的分化（引自安利国，发育生物学，2010[9]）Figure 1.3 Differentiation of mesoderm(cited from An et al, Developmental biology，2010[9])
【参考文献】：
期刊论文
[1]猪F2代资源家系的群体结构对QTL定位的影响[J]. 郭源梅,张勤,任军,周利华. 中国农业科学. 2011(04)
[2]X-连锁迟发性脊椎骨骺发育不良一家系报道[J]. 郭奕斌,王晶晶. 中国优生与遗传杂志. 2008(01)
[3]畜禽数量性状基因座位的精细定位[J]. 鲁绍雄,连林生. 中国牛业科学. 2006(01)
博士论文
[1]鉴别猪7号染色体影响脊椎数变异的因果突变位点[D]. 范寅.江西农业大学 2014
[2]利用系谱传递不平衡检验精细定位QTL[D]. 丁向东.中国农业大学 2004
硕士论文
[1]猪7号染色体上位置候选基因PROX2在西方商业猪群中对脊椎数变异影响效应的分析[D]. 范寅.江西农业大学 2011
本文编号：3244135
【文章来源】：江西农业大学江西省
【文章页数】：163 页
【学位级别】：博士
【部分图文】：
猪脊椎骨骼图
图 1-2 脊椎动物胚胎的发育过程（引自张红卫，发育生物学，2006[7]）Figure 1.2 Developmental process of embryos in vertebrate(cited from Zhang et al, Developmental biology, 2006[7])
图 1-3 中胚层的分化（引自安利国，发育生物学，2010[9]）Figure 1.3 Differentiation of mesoderm(cited from An et al, Developmental biology，2010[9])
【参考文献】：
期刊论文
[1]猪F2代资源家系的群体结构对QTL定位的影响[J]. 郭源梅,张勤,任军,周利华. 中国农业科学. 2011(04)
[2]X-连锁迟发性脊椎骨骺发育不良一家系报道[J]. 郭奕斌,王晶晶. 中国优生与遗传杂志. 2008(01)
[3]畜禽数量性状基因座位的精细定位[J]. 鲁绍雄,连林生. 中国牛业科学. 2006(01)
博士论文
[1]鉴别猪7号染色体影响脊椎数变异的因果突变位点[D]. 范寅.江西农业大学 2014
[2]利用系谱传递不平衡检验精细定位QTL[D]. 丁向东.中国农业大学 2004
硕士论文
[1]猪7号染色体上位置候选基因PROX2在西方商业猪群中对脊椎数变异影响效应的分析[D]. 范寅.江西农业大学 2011
本文编号：3244135
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