山羊CIDEa基因克隆及组织表达分析

发布时间：2021-06-26 23:03

　　为了探讨山羊诱导细胞凋亡DFF45样效应因子a （CIDEa）基因分子特征,了解其组织表达谱和在不同品种山羊之间的表达差异,试验对隆林山羊CIDEa基因进行克隆和生物信息学分析,采用实时荧光定量PCR方法检测CIDEa基因的组织表达情况。结果表明:克隆获得的隆林山羊CIDEa基因编码区（CDS区）全长为660 bp,编码219个氨基酸,蛋白质分子质量为23 367.21 ku,属于亲水性不稳定膜外蛋白。与普通山羊CIDEa基因CDS区对比,隆林山羊CIDEa基因序列存在一个核苷酸突变位点,由亮氨酸变为脯氨酸。隆林山羊CIDEa基因与绵羊CIDEa基因同源性最高,与猪、猕猴、人的同源性较低,与大鼠、小鼠的遗传距离最远;隆林山羊CIDEa基因编码蛋白中α-螺旋占35.62%,T-转角占8.68%,β-氨基酸残基构成的延伸链占16.44%,无规则卷曲占39.27%;隆林山羊CIDEa基因在腹脂和皮下脂肪中高表达,其表达水平显著高于努比亚山羊,在其他组织中表达水平极低或不表达。说明试验成功克隆出隆林山羊CIDEa基因,该基因与山羊脂肪代谢有着密不可分的关系。 

【文章来源】：黑龙江畜牧兽医. 2020,(21)北大核心

【文章页数】：6 页

【部分图文】：

隆林山羊CIDEa基因PCR扩增产物鉴定结果

利用在线软件ExPASy中的Protscale对隆林山羊CIDEa蛋白进行亲疏水性分析(见图3),结果该蛋白质属于亲水蛋白,即为可溶性蛋白。3.2.4 蛋白质二级结构和三级结构预测

利用在线软件SWISS-MODEL预测隆林山羊CIDEa蛋白三级结构,结果见图5。在二级结构的基础上,隆林山羊CIDEa蛋白肽链按照一定的空间结构进一步形成了更复杂高级的三级结构,暗示着该蛋白的某些功能。3.3 隆林山羊CIDEa基因序列分析

【参考文献】：
期刊论文
[1]豫西脂尾羊CIDEa基因的克隆、序列分析与组织表达[J]. 李君,候霞飞,梁文双,邓红雨,张桂枝,刘太宇,王笑笑,权凯.  中国畜牧兽医. 2019(06)
[2]营养素、生长因子与激素对脂肪细胞生长发育影响的研究[J]. 雒诚龙,邵伟,任万平,余雄.  黑龙江畜牧兽医. 2018(03)
[3]日龄对麻鸭脂肪沉积及相关基因表达的影响[J]. 徐思雨,郑和洋,刘涛,孙杨赢,曹锦轩,潘道东.  食品科学. 2019(03)
[4]隆林县发展隆林山羊现状及前景分析[J]. 吴海.  广西畜牧兽医. 2011(04)
[5]诱导细胞死亡DNA片段化因子a样效应因子A基因对肥胖和代谢综合征作用的研究进展[J]. 张玲,戴颖,王玮,王嵬,华琦.  中华老年心脑血管病杂志. 2010(07)
[6]脂肪细胞因子研究进展[J]. 龚大为,李平,朱大龙.  中国糖尿病杂志. 2007(10)

博士论文
[1]Cidea和Cidec的转录调控以及在细胞脂肪生成中的作用[D]. 王瑞.北京协和医学院 2009

硕士论文
[1]CIDEa和CIDEc基因在肉鸡中的表达分析[D]. 黄柳梅.江西农业大学 2016
[2]大鼠肝再生中脂肪滴蛋白质组的差异分析[D]. 张一甫.复旦大学 2010
[3]猪CIDE家族基因的克隆及功能研究[D]. 李艳华.华中农业大学 2008



本文编号：3252273