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牛支原体与无乳支原体的相似性比对分析

发布时间:2021-07-14 20:59
  运用生物信息学方法对牛支原体(Mycoplasma bovis)和无乳支原体(Mycoplasma agalactiae)的相似性进行多重比对分析。使用Mega 7、Clustal a、Sibeilia等生物信息学软件对M.bovis与M.agalactiae的全基因组、16S rRNA、脂蛋白家族进行相似性比对分析。通过多重比对发现,M.bovis与M.agalactiae在全基因、16S rRNA、以及脂蛋白家族方面均表现出较高的相似性。 

【文章来源】:江苏农业学报. 2020,36(02)北大核心CSCD

【文章页数】:6 页

【部分图文】:

牛支原体与无乳支原体的相似性比对分析


牛支原体标准株与无乳支原体分离株的基因组共线性分析

共线性,支原体,基因组


运用生物信息学软件Sibelia对M.bovis的标准株PG45与M.agalactiae的标准株PG2进行全基因组共线性分析。由共线性圆形图(图1)可以发现,PG45与PG2之间有4个位置的基因具有共线性关系,说明M.bovis与M.agalactiae的标准株具有一定的相似性。在M.bovis与M.agalactiae标准株表现出共线性的前提下,对M.bovis标准株PG45与M.agalactiae分离株5632进行全基因组共线性分析(图2),对M.bovis分离株Ningxia-1与M.agalactiae分离株5632也进行了全基因组共线性分析(图3)。结果表明M.bovis与M.agalactiae不仅在标准株中具有共线性关系,在分离株中同样存在共线性关系,说明二者在基因组共线性层面上具有相似性。

支原体,共线性,基因组


牛支原体分离株与无乳支原体分离株的基因组共线性分析

【参考文献】:
期刊论文
[1]牛支原体免疫学及免疫学诊断研究进展[J]. 张文劲,张文皓,唐鑫,李雨芮,陈曦,陈颖钰,郭爱珍,胡长敏.  中国兽医学报. 2019(09)
[2]鸡毒支原体河南株的分离鉴定及生物学特性研究[J]. 徐引弟,焦文强,王治方,李海利,张青娴,朱文豪,王克领.  山东农业科学. 2018(11)
[3]牛支原体疫苗的研究进展[J]. 季文恒,吴娅琴,翟肖辉,储岳峰.  中国畜牧兽医. 2018(03)
[4]绵羊肺炎支原体P208蛋白质的分子特征分析及免疫原性[J]. 管礼麟,马媛,杨丹茹,杨发龙.  江苏农业学报. 2018(01)
[5]2013年—2015年宁夏地区牛支原体感染的血清学调查分析[J]. 郭亚男,曹思婷,何生虎,王爽,张鑫,孙鹏.  动物医学进展. 2017(04)
[6]牛支原体套式PCR检测方法的建立[J]. 李媛,董惠,张美晶,陈超,曹培丽,郭丹,姜海芳,辛九庆.  中国预防兽医学报. 2009(09)

博士论文
[1]宁夏地区永宁县牛支原体病流行病学调查及防治技术研究[D]. 邵倩.甘肃农业大学 2017



本文编号:3284884

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