大尾寒羊保种群分子系谱的构建及遗传结构分析
发布时间：2021-07-17 11:04
系谱记录是明确个体间亲缘关系,以个体选择为主的现代育种实践,是动物遗传育种的重要信息来源。然而,随着社会经济的不断发展,人类对高产的盲目追求,加上大量高产外来品种的引进,导致大尾寒羊品种受到了前所未有的破坏,存栏量逐年下降。目前,在山东省内建立大尾寒羊国家级保种群已迫在眉睫。由于大尾寒羊个体来源复杂,原保种群管理不严格,存在分子系谱不清楚,遗传结构不清晰等问题,为保护大尾寒羊遗传资源,需通过分子手段了解大尾寒羊个体间的亲子关系,构建分子系谱,识别杂交个体,制定育种计划。本研究对大尾寒羊保种群145只个体为材料,选取25个微卫星位点,预实验采用40只个体进行混池检测,筛选了15个多态性较高的微卫星位点,用于亲权鉴定和分子系谱构建。Cervus3.0进行亲子关系分析,例如:杂合度（H）、多态性信息含量（PIC）、给定候选亲本与子代基因型,排除候选亲本的概率（NE-1P）、给定已知亲本基因型、候选亲本基因型和子代基因型,排除候选亲本的概率（NE-2P）和多个位点的累积排除概率（CEP）,以及Hardy-Weinberg平衡检测。用Pedigraph3.0软件,绘制具有复杂近交系结构的家系系谱...
【文章来源】：山东农业大学山东省
【文章页数】：76 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
大尾寒羊血液基因组DNA提取凝胶电泳图，M：DL2000DNAMarkerFigure1GelelectrophoresismapofbloodgenomicDNAofLargeTailedHanSheep，M：DL2000DNAMarker
山东农业大学硕士专业学位论文21结果用1%的琼脂糖凝胶电泳检测，使用凝胶成像系统观察并拍照，检测产物有无扩增出，部分微卫星标记的PCR扩增产物琼脂糖凝胶电泳检测，见图2，图3，图4，图5。Marker为100-3000bp的marker。通过琼脂糖电泳检测结果可以看出，PCR扩增产物电泳图条带清晰，效果较好，扩增的片段长度与目的长度吻合，可以用来进行后续实验。图2基因座BMS574的PCR扩增产物琼脂糖凝胶电泳图3基因座OarFCB20的PCR扩增产物琼脂糖凝胶电泳Figure2PCRamplificationofBMS574Figure3PCRamplificationofOarFCB20图4基因座BMS1248的PCR扩增产物琼脂糖凝胶电泳图5基因座MB023的PCR扩增产物琼脂糖凝胶电泳Figure4PCRamplificationofBMS1248Figure5PCRamplificationofMB0233.3遗传参数分析3.3.1微卫星位点多态性在预实验的40只大尾寒羊中，对25个位点进行多态性筛选，通过等位基因数，多态信息含量等因素，选取了15个等位基因数目较多、多态性较高的微卫星位点用于大尾寒羊分子系谱的构建和遗传结构分析。通过Cervus3.0中AlleleFrequencyAnalysis程序，会得到各种遗传参数，具体信息见表5。
山东农业大学硕士专业学位论文21结果用1%的琼脂糖凝胶电泳检测，使用凝胶成像系统观察并拍照，检测产物有无扩增出，部分微卫星标记的PCR扩增产物琼脂糖凝胶电泳检测，见图2，图3，图4，图5。Marker为100-3000bp的marker。通过琼脂糖电泳检测结果可以看出，PCR扩增产物电泳图条带清晰，效果较好，扩增的片段长度与目的长度吻合，可以用来进行后续实验。图2基因座BMS574的PCR扩增产物琼脂糖凝胶电泳图3基因座OarFCB20的PCR扩增产物琼脂糖凝胶电泳Figure2PCRamplificationofBMS574Figure3PCRamplificationofOarFCB20图4基因座BMS1248的PCR扩增产物琼脂糖凝胶电泳图5基因座MB023的PCR扩增产物琼脂糖凝胶电泳Figure4PCRamplificationofBMS1248Figure5PCRamplificationofMB0233.3遗传参数分析3.3.1微卫星位点多态性在预实验的40只大尾寒羊中，对25个位点进行多态性筛选，通过等位基因数，多态信息含量等因素，选取了15个等位基因数目较多、多态性较高的微卫星位点用于大尾寒羊分子系谱的构建和遗传结构分析。通过Cervus3.0中AlleleFrequencyAnalysis程序，会得到各种遗传参数，具体信息见表5。
【参考文献】：
期刊论文
[1]利用微卫星标记分析安徽地方种猪的遗传多样性[J]. 丁勇,尚金男,徐怡亮,丁月云,崔文竹,高亚飞,殷宗俊,张晓东. 云南农业大学学报(自然科学). 2019(05)
[2]岷县黑裘皮羊微卫星遗传多样性分析[J]. 张瑞,郎侠,吴建平,刘婷,宫旭胤,王彩莲,迟浩斌,梁婷玉. 中国畜牧兽医. 2019(08)
[3]西藏岗巴绵羊种质特异标记研究[J]. 洛桑催成,德庆卓嘎,巴桑吉巴,格桑加措,平措班旦,扎西,普布次仁,张立,旦巴,大格桑罗布. 畜禽业. 2019(06)
[4]山东省济宁青山羊群体遗传多样性分析[J]. 王可,刘昭华,曹洪防,楚惠民,崔绪奎. 山东农业科学. 2019(05)
[5]滩羊微卫星标记多态性及与体尺性状关联分析[J]. 李标,张瑞莹,王小琪,张存芳,段子渊. 生物技术通报. 2019(06)
[6]阿拉善沙漠双峰驼的微卫星多态性与体尺性状的关联分析[J]. 乌仁套迪,斯琴图雅,白俊艳. 畜牧与兽医. 2018(09)
[7]阿拉善戈壁双峰驼的微卫星多态性与体尺性状关联分析[J]. 乌仁套迪,白俊艳,巴拉,周俊文,张文彬. 中国畜牧兽医. 2018(07)
[8]布拖黑绵羊微卫星标记遗传多样性研究[J]. 周明亮,陈明华,庞倩,杨平贵,李燕. 草学. 2018(02)
[9]MiniFiler及Yfiler试剂盒无创产前亲子鉴定的可能性探究[J]. 蒋浩君,尹路,穆豪放,陈芳,何农跃,杜舟. 中国法医学杂志. 2017(01)
[10]新疆罗布羊群体遗传多样性及系统进化分析[J]. 郑永富,王姗姗,高庆华,钱梦阳,宫昌海,陈晓利,韩春梅. 生物技术. 2016(06)
硕士论文
[1]两个山羊品种分子系谱的构建及家系遗传特征分析[D]. 纪志宾.山东农业大学 2010
[2]7个微卫星标记与波尔山羊生长性状的关联分析[D]. 苏杰.华中农业大学 2009
[3]中国9个地方山羊品种遗传多样性的微卫星分析[D]. 樊睿.西北农林科技大学 2009
[4]六个miniSTR基因座群体遗传学研究[D]. 李霞.河北医科大学 2009
[5]山东地方山羊种群边际多样性和优先保护次序[D]. 李培培.山东农业大学 2008
[6]利用微卫星标记分析部分山羊品种的遗传多样性[D]. 赵艳红.内蒙古农业大学 2003
本文编号：3288052
【文章来源】：山东农业大学山东省
【文章页数】：76 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
大尾寒羊血液基因组DNA提取凝胶电泳图，M：DL2000DNAMarkerFigure1GelelectrophoresismapofbloodgenomicDNAofLargeTailedHanSheep，M：DL2000DNAMarker
山东农业大学硕士专业学位论文21结果用1%的琼脂糖凝胶电泳检测，使用凝胶成像系统观察并拍照，检测产物有无扩增出，部分微卫星标记的PCR扩增产物琼脂糖凝胶电泳检测，见图2，图3，图4，图5。Marker为100-3000bp的marker。通过琼脂糖电泳检测结果可以看出，PCR扩增产物电泳图条带清晰，效果较好，扩增的片段长度与目的长度吻合，可以用来进行后续实验。图2基因座BMS574的PCR扩增产物琼脂糖凝胶电泳图3基因座OarFCB20的PCR扩增产物琼脂糖凝胶电泳Figure2PCRamplificationofBMS574Figure3PCRamplificationofOarFCB20图4基因座BMS1248的PCR扩增产物琼脂糖凝胶电泳图5基因座MB023的PCR扩增产物琼脂糖凝胶电泳Figure4PCRamplificationofBMS1248Figure5PCRamplificationofMB0233.3遗传参数分析3.3.1微卫星位点多态性在预实验的40只大尾寒羊中，对25个位点进行多态性筛选，通过等位基因数，多态信息含量等因素，选取了15个等位基因数目较多、多态性较高的微卫星位点用于大尾寒羊分子系谱的构建和遗传结构分析。通过Cervus3.0中AlleleFrequencyAnalysis程序，会得到各种遗传参数，具体信息见表5。
山东农业大学硕士专业学位论文21结果用1%的琼脂糖凝胶电泳检测，使用凝胶成像系统观察并拍照，检测产物有无扩增出，部分微卫星标记的PCR扩增产物琼脂糖凝胶电泳检测，见图2，图3，图4，图5。Marker为100-3000bp的marker。通过琼脂糖电泳检测结果可以看出，PCR扩增产物电泳图条带清晰，效果较好，扩增的片段长度与目的长度吻合，可以用来进行后续实验。图2基因座BMS574的PCR扩增产物琼脂糖凝胶电泳图3基因座OarFCB20的PCR扩增产物琼脂糖凝胶电泳Figure2PCRamplificationofBMS574Figure3PCRamplificationofOarFCB20图4基因座BMS1248的PCR扩增产物琼脂糖凝胶电泳图5基因座MB023的PCR扩增产物琼脂糖凝胶电泳Figure4PCRamplificationofBMS1248Figure5PCRamplificationofMB0233.3遗传参数分析3.3.1微卫星位点多态性在预实验的40只大尾寒羊中，对25个位点进行多态性筛选，通过等位基因数，多态信息含量等因素，选取了15个等位基因数目较多、多态性较高的微卫星位点用于大尾寒羊分子系谱的构建和遗传结构分析。通过Cervus3.0中AlleleFrequencyAnalysis程序，会得到各种遗传参数，具体信息见表5。
【参考文献】：
期刊论文
[1]利用微卫星标记分析安徽地方种猪的遗传多样性[J]. 丁勇,尚金男,徐怡亮,丁月云,崔文竹,高亚飞,殷宗俊,张晓东. 云南农业大学学报(自然科学). 2019(05)
[2]岷县黑裘皮羊微卫星遗传多样性分析[J]. 张瑞,郎侠,吴建平,刘婷,宫旭胤,王彩莲,迟浩斌,梁婷玉. 中国畜牧兽医. 2019(08)
[3]西藏岗巴绵羊种质特异标记研究[J]. 洛桑催成,德庆卓嘎,巴桑吉巴,格桑加措,平措班旦,扎西,普布次仁,张立,旦巴,大格桑罗布. 畜禽业. 2019(06)
[4]山东省济宁青山羊群体遗传多样性分析[J]. 王可,刘昭华,曹洪防,楚惠民,崔绪奎. 山东农业科学. 2019(05)
[5]滩羊微卫星标记多态性及与体尺性状关联分析[J]. 李标,张瑞莹,王小琪,张存芳,段子渊. 生物技术通报. 2019(06)
[6]阿拉善沙漠双峰驼的微卫星多态性与体尺性状的关联分析[J]. 乌仁套迪,斯琴图雅,白俊艳. 畜牧与兽医. 2018(09)
[7]阿拉善戈壁双峰驼的微卫星多态性与体尺性状关联分析[J]. 乌仁套迪,白俊艳,巴拉,周俊文,张文彬. 中国畜牧兽医. 2018(07)
[8]布拖黑绵羊微卫星标记遗传多样性研究[J]. 周明亮,陈明华,庞倩,杨平贵,李燕. 草学. 2018(02)
[9]MiniFiler及Yfiler试剂盒无创产前亲子鉴定的可能性探究[J]. 蒋浩君,尹路,穆豪放,陈芳,何农跃,杜舟. 中国法医学杂志. 2017(01)
[10]新疆罗布羊群体遗传多样性及系统进化分析[J]. 郑永富,王姗姗,高庆华,钱梦阳,宫昌海,陈晓利,韩春梅. 生物技术. 2016(06)
硕士论文
[1]两个山羊品种分子系谱的构建及家系遗传特征分析[D]. 纪志宾.山东农业大学 2010
[2]7个微卫星标记与波尔山羊生长性状的关联分析[D]. 苏杰.华中农业大学 2009
[3]中国9个地方山羊品种遗传多样性的微卫星分析[D]. 樊睿.西北农林科技大学 2009
[4]六个miniSTR基因座群体遗传学研究[D]. 李霞.河北医科大学 2009
[5]山东地方山羊种群边际多样性和优先保护次序[D]. 李培培.山东农业大学 2008
[6]利用微卫星标记分析部分山羊品种的遗传多样性[D]. 赵艳红.内蒙古农业大学 2003
本文编号：3288052
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