樱桃谷肉鸭脱羽综合征病因的初步研究
发布时间：2021-07-20 08:15
自2017年以来,华东三省（山东、安徽和江苏）陆续出现了一种以樱桃谷鸭为感染对象的,全身羽毛部分或全部脱落,屠宰后羽根难以拔除（毛刺鸭）的临床疾病,暂称为“脱羽综合征”（Feathers Shedding Syndrome,FSS）。该病在2019年临床危害尤为严重,发病鸭以樱桃谷肉鸭为主,发病鸭场该病的发病率为3%-70%。发病鸭主要表现为生长迟缓,采食率下将,羽毛脱落越来越严重;部分鸭群会出现死亡,死亡率不等,给肉鸭养殖户造成巨大损失。因鸭圆环病毒（Duck circovirus,DuCV）和新型鹅细小病毒（Novel goose parvovirus-related virus,NGPV）感染可能导致相似的临床症状,本研究建立了可同时检测DuCV-1、DuCV-2和NGPV的三重PCR方法,并对山东、安徽和江苏三省采集的脱羽鸭的羽毛囊和各种器官进行了检测,在此基础上对临床病料中的6株DuCV和6株NGPV毒株进行了全基因组扩增和序列分析,并通过动物试验来探讨此病发生的原因,以期为养鸭行业对FSS疾病的科学防控提供了参考依据。本研究分为四个部分:1、检测DuCV-1、DuCV-2和...
【文章来源】：山东农业大学山东省
【文章页数】：86 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
电镜下DuCV的形态（标尺代表100nm）（引自Hattermannetal.,2003）
山东农业大学硕士学位论文3图1-1电镜下DuCV的形态（标尺代表100nm）（引自Hattermannetal.,2003）Fig.1-1DuCVmorphologyinEM（barrepresents100nm）（FromHattermannetal.,2003）1.2.3.2DuCV基因组结构DuCV的基因组是长约1.99kb大小的环状单股负链共价闭合，其基因组为双义基因组，它的基因组超过200bp大小的的开放阅读框（Openreadingframe,ORF）主要有6个，分布在正链和负链上，分别为V1、V2、V3以及C1、C2、C3，其次还包括一个茎环结构，如图1-2所示。由于基因组较小，所以DuCV的基因组利用率较高。由于DuCV几乎无法在体外培养，因此到目前为止，我们主要认识到ORF1、ORF2和ORF3三个主要开放阅读框。图1-2DuCV基因组结构示意图Fig.1-2TheStructurepatternofDuCVgenome1.2.3.3DuCV各蛋白的生物学特性ORF1基因即V1基因，全长879bp，由292个氨基酸组成，位于正义链上，位置在49bp-927bp，编码复制蛋白（Replicationprotein,Rep），其大小为33.6kDa，Rep基因上存在3个与滚环复制有关的保守基序，它们成为dNTPs结合的P环，此结构与圆环病毒的复制有关。同时有研究表明，DuCV编码的Rep蛋白的序列下游有1个TATA盒，这个盒子可能在Rep蛋白的表达控制和调节过程中发挥一定的作用（Hughesetal.,2008;Wangetal.,2014;Xieetal.,2014）。通过对不同的圆环病毒的Rep基因BLAST和Clustal
上，这大大提高了我们的研究效率和拓宽了我们的研究思路。如NGPV和GPV有很近的亲缘关系且结构蛋白相似，因此对于研究NGPV，我们经常参考GPV进行研究，甚至有学者提出NGPV属于GPV的变异毒株，它们的形态、理化特性、基因组结构、蛋白功能等基础特征相似度很高。1.3.3.1基因组结构特征NGPV的全基因组共长约为5.1kb大小，不同的毒株其全基因组长度和部分序列也不完全一样。它主要包含5’端和3’端的两个完全一样的反向重复序列（InvertedterminalRepeats,ITR）以及左右两个互不重叠的开放阅读框（ORF），其结构如图1-3所示：图1.3NGPV基因组结构示意图Fig.1.3Thesketch-mapofNGPVgenomestructureITR区域是位于5’端和3’端两个完全一致的反向重复序列，它的大小为444个核苷酸而且前后两端完全相同。在两端的重复序列的407nt处折叠形成了一个U型的发夹结构，此结构可作为病毒复制的起始位点（BossisandChiorini,2003），同时为之后的病毒的包装提供了顺式信号，用来引导核酸和蛋白的组合，从而完成对病毒的包装（Kajjgayaetal.,1991）。而在ITR的发夹结构，是由181bp的碱基组成了其两边的的茎部以及44bp的碱基形成的泡状区，在该泡区顶部是SphΙ的酶切位点。此结构对于病毒的研究具有重大意义。目前的研究表明，NGPV和GPV的ITR结构与人的细小病毒B19的ITR结构最为相似（Zhietal.,2004）。在ITR区域的中间是左右两个不同的开放阅读框（ORF）。左侧开放阅读框主要由两个编码非结构蛋白（non-structureprotein,NS）即复制蛋白的基因组成，Rep1和Rep2，
【参考文献】：
期刊论文
[1]一例鸭圆环病毒感染的诊治[J]. 洪炳发. 中国畜禽种业. 2019(12)
[2]鸭圆环病毒的流行与防控[J]. 陶广朋. 中国畜禽种业. 2019(09)
[3]小鹅瘟诊治与预防措施[J]. 冯海波,安同伟,陈庆忠,李迎梅. 畜牧兽医科学(电子版). 2019(05)
[4]广东省水禽主要传染病的流行现状及防控思考[J]. 孙敏华. 广东畜牧兽医科技. 2019(01)
[5]鸭源新型鹅细小病毒核酸探针的制备与应用[J]. 李鹏飞,张瑞华,宋莎莎,王玮,陈君豪,蓝晶晶,谢之景,姜世金. 中国兽医学报. 2018(11)
[6]我国部分地区鸭病毒性疫病共感染的流行病学调查[J]. 杨晶,张日腾,王振忠,于相龙,牛晓宇,唐熠,刁有祥. 中国兽医学报. 2018(10)
[7]鸭源新型鹅细小病毒DS15株生物学特性研究[J]. 宫晓华,李琦,李传峰,张莉,唐井玉,刘光清,王桂军. 中国家禽. 2017(04)
[8]鸭细小病毒变异株引起肉鸭大舌头病[J]. 贾佳丽,于沛江,王新伟,王群义. 中国兽医杂志. 2016(11)
[9]鸭细小病毒套式PCR检测方法的建立与应用[J]. 窦砚国,陈浩,郑肖强,于相龙,杨晶,牛晓宇,刁有祥. 中国兽医学报. 2016(10)
[10]鸭短喙长舌综合征的血液生化指标测定与分析[J]. 武世珍,靖吉强,李舫,王光锋. 黑龙江畜牧兽医. 2016(18)
博士论文
[1]鸭圆环病毒Rep和ORF3蛋白部分生物学活性的研究[D]. 王鑫.山东农业大学 2015
硕士论文
[1]鹅细小病毒常州株NS1和VP1基因序列分析及NS1基因的表达[D]. 陈希.扬州大学 2007
本文编号：3292472
【文章来源】：山东农业大学山东省
【文章页数】：86 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
电镜下DuCV的形态（标尺代表100nm）（引自Hattermannetal.,2003）
山东农业大学硕士学位论文3图1-1电镜下DuCV的形态（标尺代表100nm）（引自Hattermannetal.,2003）Fig.1-1DuCVmorphologyinEM（barrepresents100nm）（FromHattermannetal.,2003）1.2.3.2DuCV基因组结构DuCV的基因组是长约1.99kb大小的环状单股负链共价闭合，其基因组为双义基因组，它的基因组超过200bp大小的的开放阅读框（Openreadingframe,ORF）主要有6个，分布在正链和负链上，分别为V1、V2、V3以及C1、C2、C3，其次还包括一个茎环结构，如图1-2所示。由于基因组较小，所以DuCV的基因组利用率较高。由于DuCV几乎无法在体外培养，因此到目前为止，我们主要认识到ORF1、ORF2和ORF3三个主要开放阅读框。图1-2DuCV基因组结构示意图Fig.1-2TheStructurepatternofDuCVgenome1.2.3.3DuCV各蛋白的生物学特性ORF1基因即V1基因，全长879bp，由292个氨基酸组成，位于正义链上，位置在49bp-927bp，编码复制蛋白（Replicationprotein,Rep），其大小为33.6kDa，Rep基因上存在3个与滚环复制有关的保守基序，它们成为dNTPs结合的P环，此结构与圆环病毒的复制有关。同时有研究表明，DuCV编码的Rep蛋白的序列下游有1个TATA盒，这个盒子可能在Rep蛋白的表达控制和调节过程中发挥一定的作用（Hughesetal.,2008;Wangetal.,2014;Xieetal.,2014）。通过对不同的圆环病毒的Rep基因BLAST和Clustal
上，这大大提高了我们的研究效率和拓宽了我们的研究思路。如NGPV和GPV有很近的亲缘关系且结构蛋白相似，因此对于研究NGPV，我们经常参考GPV进行研究，甚至有学者提出NGPV属于GPV的变异毒株，它们的形态、理化特性、基因组结构、蛋白功能等基础特征相似度很高。1.3.3.1基因组结构特征NGPV的全基因组共长约为5.1kb大小，不同的毒株其全基因组长度和部分序列也不完全一样。它主要包含5’端和3’端的两个完全一样的反向重复序列（InvertedterminalRepeats,ITR）以及左右两个互不重叠的开放阅读框（ORF），其结构如图1-3所示：图1.3NGPV基因组结构示意图Fig.1.3Thesketch-mapofNGPVgenomestructureITR区域是位于5’端和3’端两个完全一致的反向重复序列，它的大小为444个核苷酸而且前后两端完全相同。在两端的重复序列的407nt处折叠形成了一个U型的发夹结构，此结构可作为病毒复制的起始位点（BossisandChiorini,2003），同时为之后的病毒的包装提供了顺式信号，用来引导核酸和蛋白的组合，从而完成对病毒的包装（Kajjgayaetal.,1991）。而在ITR的发夹结构，是由181bp的碱基组成了其两边的的茎部以及44bp的碱基形成的泡状区，在该泡区顶部是SphΙ的酶切位点。此结构对于病毒的研究具有重大意义。目前的研究表明，NGPV和GPV的ITR结构与人的细小病毒B19的ITR结构最为相似（Zhietal.,2004）。在ITR区域的中间是左右两个不同的开放阅读框（ORF）。左侧开放阅读框主要由两个编码非结构蛋白（non-structureprotein,NS）即复制蛋白的基因组成，Rep1和Rep2，
【参考文献】：
期刊论文
[1]一例鸭圆环病毒感染的诊治[J]. 洪炳发. 中国畜禽种业. 2019(12)
[2]鸭圆环病毒的流行与防控[J]. 陶广朋. 中国畜禽种业. 2019(09)
[3]小鹅瘟诊治与预防措施[J]. 冯海波,安同伟,陈庆忠,李迎梅. 畜牧兽医科学(电子版). 2019(05)
[4]广东省水禽主要传染病的流行现状及防控思考[J]. 孙敏华. 广东畜牧兽医科技. 2019(01)
[5]鸭源新型鹅细小病毒核酸探针的制备与应用[J]. 李鹏飞,张瑞华,宋莎莎,王玮,陈君豪,蓝晶晶,谢之景,姜世金. 中国兽医学报. 2018(11)
[6]我国部分地区鸭病毒性疫病共感染的流行病学调查[J]. 杨晶,张日腾,王振忠,于相龙,牛晓宇,唐熠,刁有祥. 中国兽医学报. 2018(10)
[7]鸭源新型鹅细小病毒DS15株生物学特性研究[J]. 宫晓华,李琦,李传峰,张莉,唐井玉,刘光清,王桂军. 中国家禽. 2017(04)
[8]鸭细小病毒变异株引起肉鸭大舌头病[J]. 贾佳丽,于沛江,王新伟,王群义. 中国兽医杂志. 2016(11)
[9]鸭细小病毒套式PCR检测方法的建立与应用[J]. 窦砚国,陈浩,郑肖强,于相龙,杨晶,牛晓宇,刁有祥. 中国兽医学报. 2016(10)
[10]鸭短喙长舌综合征的血液生化指标测定与分析[J]. 武世珍,靖吉强,李舫,王光锋. 黑龙江畜牧兽医. 2016(18)
博士论文
[1]鸭圆环病毒Rep和ORF3蛋白部分生物学活性的研究[D]. 王鑫.山东农业大学 2015
硕士论文
[1]鹅细小病毒常州株NS1和VP1基因序列分析及NS1基因的表达[D]. 陈希.扬州大学 2007
本文编号：3292472
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