2013～2016年中国流行性出血病病毒血清型5型的分离与遗传特征分析

发布时间：2021-07-27 23:32

　　流行性出血病病毒（Epizootic haemorrhagic disease virus,EHDV）是一种严重危害反刍动物的虫媒病毒,全世界已发现9种血清型EHDV,长久以来我国EHDV血清型分布、病毒活动规律和病毒遗传特征不明确,对我国的畜牧业进出口和牛羊养殖业构成了潜在威胁。本文首次报道了2013～2016年在云南省与广西壮族自治区设立的哨兵动物中,9株EHDV-5型毒株的分离以及病毒基因节段2、3与6（Seg-2、Seg-3、Seg-6）的序列特征。中国分离的9株EHDV-5型毒株Seg-2,Seg-3与Seg-6及其编码蛋白之间高度保守,核酸与氨基酸序列相似度均大于99%,在系统发生树上聚为紧密的一簇,表明我国云南与广西流行的EHDV-5有着最近的共有祖先。中国与澳大利亚EHDV-5毒株不同基因节段之间也有着较高的序列相似度（>91%）,表明两地流行EHDV-5型毒株有着共同的起源。中国毒株的Seg-2与Seg-6在系统发生树上虽与澳大利亚毒株（CSIRO 157）聚为一簇,但最终形成了独立的进化分支,表明中国流行的EHDV-5发生了独立的进化。本研究首先丰富了世界范围... 

【文章来源】：病毒学报. 2020,36(03)北大核心CSCD

【文章页数】：9 页

【部分图文】：

基于最大似然法的流行性出血病病毒（EHDV)Seg-2序列的系统发育分析

EHDV的VP3蛋白序列高度保守，但其编码的Seg‐3基因在不同地域分离毒株之间存在较大差异，体现出强烈的地域性特征[12]。我国分离9株EHDV‐5型毒株的Seg‐3核酸序列相似度为（99.26±0.5)%,VP3氨基酸序列相似度为（99.75±0.2）%。构建的EHDV Seg‐3系统发生树显示，中国EHDV‐5型毒株与分离自日本、澳大利亚的不同血清型EHDV毒株均属于“Eastern”型（图2),Seg‐3序列相似度为（94.21±2.2)%,VP3序列相似度为（99.38±0.4）%。中国毒株与分离自中东地区、非洲与北美洲等“Western”型毒株遗传关系较远，Seg‐3序列相似度仅为（79.70±0.3)%,VP3序列相似度仅为（96.62±0.3）%。4 EHDV-5型毒株Seg-6基因节段分析

Seg‐6编码的VP5蛋白对同为病毒外壳蛋白的VP2构象存在一定影响，从而也影响着EHDV血清型特异性抗体的产生，根据不同血清型Seg‐6核酸序列的差异也可将EHDV分为A、B、C和D四个群[11]。我国分离9株EHDV‐5型毒株的Seg‐6核酸序列相似度为（98.92±0.8)%,VP5氨基酸序列相似度为（99.68±0.3）%。与在Seg‐2分析中观察到的情况一致，中国与澳大利亚EHDV‐5型毒株的Seg‐6在系统发生树上形成一个独立分支，与EHDV‐4型毒株共同构成D群（Group D），在系统发生树上中国EHDV‐5型毒株也构成了单独的一个“中国支系”（图4），与EHDV‐4型毒株Seg‐6核酸序列相似度为（72.08±0.8)%,VP5氨基酸序列相似度为（86.61±0.2）%；与澳大利亚EHDV‐5型毒株的Seg‐6核酸序列相似度为（93.49±0.2)%,VP5氨基酸序列相似度为（99.0±0.2）%。讨论


本文编号：3306756