绿头鸭RIG-Ⅰ基因的分子特征及其在体内的表达分布

发布时间：2021-08-01 01:18

　　为揭示野生绿头鸭视黄酸诱导基因Ⅰ（Retinoic acid-inducible geneⅠ,RIG-Ⅰ）的分子特征及其在体内的表达分布规律,对野生绿头鸭RIG-Ⅰ（MdRIG-Ⅰ）基因的CDS序列进行了克隆和序列分析,并应用荧光定量PCR方法对RIG-Ⅰ基因在绿头鸭不同组织中的表达水平进行了测定。结果显示:MdRIG-Ⅰ基因的CDS序列全长2 802 bp,编码933个氨基酸,与哺乳动物和鱼类的RIG-Ⅰ基因同源率较低,为43.7%～46.7%与52.2%～54.9%;与鸟类的RIG-Ⅰ基因同源率较高,为78.7%～99.8%;与番鸭和绍兴麻鸭的RIG-Ⅰ基因同源率为98.3%和99.8%,有较强的种间特异性;MdRIG-Ⅰ基因mRNA在体内不同器官的表达量均高于SPF鸭（绍兴麻鸭）,且不同组织表达量各不相同:在肝脏中表达水平最高,其次是肠,在心和脾表达呈中等水平,在肺和肾表达呈低等水平。研究结果揭示了RIG-Ⅰ通路在鸭科动物抗病毒中的作用及其分子机制,为水禽先天性免疫研究奠定良好的基础。 

【文章来源】：中国家禽. 2020,42(11)北大核心

【文章页数】：5 页

【部分图文】：

SMART预测MdRIG-Ⅰ的蛋白质结构域简图

将MdRIG-Ⅰ氨基酸序列与SPF鸭RIG-Ⅰ氨基酸序列用DNAstar Megalign进行比对，发现存在2个差异位点，分别是第4位和617位氨基酸残基（见图3）。2.5 标准曲线的建立

RIG-Ⅰ基因作为先天性免疫系统的重要组成部分，在机体抵抗病毒的过程中起着重要作用。本研究克隆了MdRIG-Ⅰ基因的CDS序列，生物信息学分析显示，MdRIG-Ⅰ基因的CDS序列全长2 802 bp，由933个氨基酸组成，SMART预测显示具有典型的RIG-Ⅰ蛋白结构，N端为2个串联半胱天冬氨酸激活招募区、中间为DExD/H解旋酶区、C端为抑制区。本研究中MdRIG-Ⅰ氨基酸序列与鸟类同源性为78.7%～99.8%，与哺乳类同源性为52.2%～54.9%，与鱼类同源性为43.7%～46.7%，有较强的种间特异性，与Kowalinski等[8]研究结果一致。本研究发现绿头鸭MdRIG-Ⅰ氨基酸序列与绍兴麻鸭同源性更近，为99.8%。野生绿头鸭和SPF鸭存在差异的位点为第4位和617位氨基酸残基。根据王同淑等[6]的研究结果，MdRIG-Ⅰ蛋白突变的位点包含在α-螺旋重合区域中，但对亲水性、柔韧性、抗原表位等蛋白质特性均无影响，具有较强的种间特异性，这表明环境因素可能是影响野生绿头鸭和SPF鸭抗AIV能力存在差异的主要原因。3.2 MdRIG-Ⅰ荧光定量分析

【参考文献】：
期刊论文
[1]北京鸭RIG-I基因的克隆及其生物信息学分析[J]. 王同淑,李传峰,陈宗艳,孟春春,吴润,刘光清.  浙江农业学报. 2015(05)
[2]鸭RIG-1基因的PCR扩增及其序列分析[J]. 程玉强,焦培荣,韦良孟,钟自富,廖顺娣,袁润余,贾宝琴,罗开健,廖明.  动物医学进展. 2012(06)
[3]鸡β-actin基因实时荧光定量PCR方法的建立[J]. 马莉,谢秀兰,岳华.  中国畜牧兽医. 2007(02)



本文编号：3314556